2015 Fiscal Year Annual Research Report
メチル化シグナルによる長鎖非コードRNA機能の発現機構の解明
| Project/Area Number |
25293073
|
|---|
| Research Institution | Saitama Medical University |
|---|
Principal Investigator |
黒川 理樹 埼玉医科大学, 医学部, 教授 (70170107)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
| Keywords | 酵素 / 遺伝子 / 核酸 / 生体分子 / 発現制御 / メチル化 / 長鎖非コードRNA |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
研究の進展により初めの計画に修正を加えたが、本来の目的には変更はなかった。
TLSが結合する長鎖非コードRNA(lncRNA)であるpncRNA-Dの詳細な2次構造を解明した(Yoneda et al. 2016)。とりわけ、5末端側のステム-ループ構造の直鎖状RNA領域がTLS結合に必須であるという新規性の高い結果が得られた。このRNA構造は、生化学的解析と共に、NMR解析でも確認された。これは本課題の大きな成果である。
我々のNature論文（Wangら2008）では、pncRNA-D発現誘導にX線照射を用いていた。これはX線照射装置が必要なため、実験的障壁となっていた。今回ソルビトールによる高浸透圧処理が、X線照射よりも効率的にpncRNA-Dを誘導できることを示した。今後は、簡便な浸透圧処理を用いていく。このことは、高浸透圧処理によるストレス負荷と長鎖非コードRNAの関連という新たな視点をもたらした。現在、次世代シークエンサーを駆使して、高浸透圧処理でゲノムワイドのlncRNA発現変動を調べている。このlncRNAの中から、TLSへメチル化依存的に結合制御されるRNAが検出されることを期待している。
高浸透圧処理により、TLSのpncRNAへの結合が上昇する結果を得た。また高浸透圧処理により、pncRNA-Dのアデノシンメチル化(m6A)が減少した。このことから、pncRNA-Dのメチル化により安定性が低下することが示唆された。
TLSのアルギニン(R)216・R218のメチル化による、結合するタンパク質の結合変動を同定して数種類のRNPを見出し、これらの生理的意味を検討している。
当初の予想のように、TLSと結合するpncRNA-Dの機能には、メチル化シグナルが重要な役割を果たすことが示された。今後は、メチル化シグナルネットワークのゲノムワイドでの解析を進めていく。
|
| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Causes of Carryover |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Expenditure Plan for Carryover Budget |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
|
| Remarks |
|
-
[Journal Article] Histone methylation and STAT3 differentially regulate IL-6-induced MMP gene activation in rheumatoid arthritis synovial fibroblasts.2016
Author(s)
Araki,Y., Wada,T., Aizaki,Y., Sato,K., Yokota,K., Fujimoto,K., Kim,YT., Oda,H., Kurokawa,R., Mimura,T
-
Journal Title
Arthritis & Rheumatology
Volume: 印刷中
Pages: 印刷中
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] The Binding Specificity of Translocated in LipoSarcoma/FUsed in Sarcoma with lncRNA Transcribed from the Promoter Region of Cyclin D1.2016
Author(s)
Yoneda,R., Suzuki,S., Mashima,T., Kondo,K., Nagata,T., Katahira,M., Kurokawa,R.
-
Journal Title
Cell & Bioscience
Volume: 6
Pages: 4
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
-
