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2014 Fiscal Year Annual Research Report

褐色脂肪細胞特異的転写制御におけるクロマチン構造変化とエピゲノム制御の役割

Research Project

Project/Area Number 25293209
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

脇 裕典  東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (00466765)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords分化 / 転写制御 / エピゲノム
Outline of Annual Research Achievements

In vivo 褐色脂肪組織のFAIRE-seq/ChIP-seq:オープンクロマチン(転写制御)領域/ヒストン修飾のエピゲノム解析においては、マウス褐色脂肪組織、皮下および生殖器周囲白色脂肪組織、肝臓に対してin vivoのFAIRE-seqを施行し、全ゲノムレベルでオープンクロマチン領域を同定した。褐色脂肪組織に特異的なオープンクロマチン領域は、代表的な褐色脂肪遺伝子周囲に多く存在し、ゲノムレベルの解析でも、褐色脂肪に選択的に発現する遺伝子の近傍に多く存在していた。Gene Ontology解析を施行したところ、褐色脂肪分化に関わる遺伝子の周囲に有意に濃縮していた。褐色脂肪細胞に特異的オープンクロマチン領域のDNA配列のモチーフ解析により、制御因子の候補リストを作成した。それらの因子のうちの一つは、細胞レベル・組織レベルで白色脂肪、骨格筋と比較して、褐色脂肪に多く発現しており、レトロウイルスによる過剰発現やsiRNAによるノックダウンなどの実験から褐色脂肪細胞特異的な誘導作用を有していることを明らかにした。この因子のゲノムレベルでの結合領域を同定するために、ChIP-seqを施行し、褐色・白色脂肪のマスターレギュレーターであるPPARgとの機能的な相互関係の解析を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

褐色脂肪組織特異的なオープンクロマチン領域のunbiasedなゲノムワイド解析を施行し、褐色脂肪特異的な遺伝子の近傍に褐色脂肪細胞に特異的なオープンクロマチン領域を同定した。これらの領域のunbiasedな解析により、褐色脂肪特異的な転写制御作用の候補因子を同定した。これらの因子の中で、過剰発現やsiRNAを用いた検討から、褐色脂肪特異的な転写制御作用を有する転写因子を同定した。この転写因子がどのように褐色脂肪特異的な転写制御作用をもつか、またマスターレギュレーターPPARgと関連の解析を進めている。申請時の研究計画に従い、おおむね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

研究計画に従い、おおむね順調に進展していると考えら得、引き続き、申請時の研究計画に従って研究を遂行する。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014

All Journal Article (3 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] 褐色細胞組織の機能制御とその破綻2015

    • Author(s)
      脇裕典
    • Journal Title

      医学のあゆみ(第5土曜特集 糖尿病のすべて 基礎研究の最前線)

      Volume: 252(5) Pages: 415-419

  • [Journal Article] III プロトコール エピゲノム C.クロマチンアクセシビリティ解析 2.オープンクロマチンを同定するFAIRE-seq2014

    • Author(s)
      中村正裕, 脇裕典
    • Journal Title

      実験医学別冊 次世代シークエンス解析スタンダード

      Volume: 0 Pages: 195-203

  • [Journal Article] エピゲノムと肥満症2014

    • Author(s)
      脇 裕典, 山内 敏正, 門脇 孝
    • Journal Title

      医学のあゆみ (第5土曜特集 肥満の医学 : 臨床と研究の最先端)

      Volume: 250(9) Pages: 797-801

  • [Presentation] シンポジウム4 ゲノム・エピゲノムと糖尿病2015

    • Author(s)
      脇裕典
    • Organizer
      第49回 糖尿病学の進歩 シンポジウム4 ゲノム・エピゲノムと糖尿病
    • Place of Presentation
      岡山市
    • Year and Date
      2015-02-20 – 2015-02-20
    • Invited
  • [Presentation] 褐色脂肪特異的な転写制御・エピゲノム制御におけるNFIAの役割の解明2015

    • Author(s)
      脇裕典, 平池勇雄, 于静, 中村正裕, 孫威, 三宅加奈, 鈴木顕, 青山倫久, 冨岡恵, 廣田雄輔, 植木浩二郎, 堤修一, 油谷浩幸, 山内敏正, 門脇孝
    • Organizer
      日本糖尿病・肥満動物学会
    • Place of Presentation
      京都市
    • Year and Date
      2015-02-14 – 2015-02-14
  • [Presentation] 白色・褐色脂肪細胞におけるクロマチン構造変化とエピゲノム制御の役割2014

    • Author(s)
      脇裕典
    • Organizer
      AdipoScience in Hiroshima
    • Place of Presentation
      広島市
    • Year and Date
      2014-10-31 – 2014-10-31
    • Invited
  • [Presentation] Genome-wide Profiling of Brown Fat-Specific Open Regulatory Regions Identifies NFIA as a Transcriptional Regulator of Brown Fat Differentiation2014

    • Author(s)
      Hironori Waki, Yuta Hiraike Jing Yu, Kana Miyake, Masahiro Nakamura, Ken Suzuki, Wei Sun, Megumi Tomioka, Yusuke Hirota, Tomohisa Aoyama, Masato Iwabu, Miki Okada-Iwabu, Kohjiro Ueki, Shuichi Tsutsumi, Hiroyuki Aburatani, Toshimasa Yamauchi and Takashi Kadowaki
    • Organizer
      International Symposium for the Study of Obesity〝Molecular Basis and Disorders of Control of Appetite and Fat Accumulation″
    • Place of Presentation
      Miyazaki, Japan
    • Year and Date
      2014-10-26 – 2014-10-26
    • Invited
  • [Presentation] 白色・褐色脂肪細胞におけるクロマチン構造変化とエピゲノム制御の役割2014

    • Author(s)
      脇裕典、平池勇雄、于静、中村正裕、青山倫久、孫威、鈴木顕、若林賢一、井上剛、武和巳、冨岡恵、三宅加奈、廣田雄輔、岩部真人、岩部美紀、杉山拓也、和田洋一郎、植木浩二郎、堤 修一、油谷浩幸、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第35回日本肥満学会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      宮崎市
    • Year and Date
      2014-10-25 – 2014-10-25
    • Invited
  • [Presentation] 褐色脂肪分化と遺伝子制御におけるNFIA の役割2014

    • Author(s)
      脇裕典、平池勇雄、于静、中村正裕、鈴木顕、孫威、青山倫久、冨岡恵、杉山拓也、植木浩二郎、堤 修一、油谷浩幸、山内敏正、門脇孝
    • Organizer
      第29回日本糖尿病合併症学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-10-03 – 2014-10-03
  • [Presentation] Genome-wide Profiling of Brown Fat-Specific Open Regulatory Regions Identifies NFIA as a Transcriptional Regulator of Brown Fat Muscle Cell Lineage Specification2014

    • Author(s)
      Hironori Waki, Yuta Hiraike, Jing Yu, Kana Miyake, Masahiro Nakamura, Ken Suzuki, Kohjiro Ueki, Shuichi Tsutsumi, Hiroyuki Aburatani, Toshimasa Yamauchi, Takashi Kadowaki
    • Organizer
      9th Metabolic Syndrome, Type 2 Diabetes and Atherosclerosis Congress
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2014-09-13 – 2014-09-13
  • [Presentation] 白色・褐色脂肪細胞におけるクロマチン構造変化とエピゲノム制御の役割2014

    • Author(s)
      脇 裕典
    • Organizer
      第32回内分泌代.謝学サマーセミナー
    • Place of Presentation
      山梨
    • Year and Date
      2014-07-11 – 2014-07-11
    • Invited
  • [Presentation] 褐色脂肪細胞特異的な転写制御領域のFAIRE-seqによる新規制御因子の同定2014

    • Author(s)
      脇裕典、平池勇雄、于静、山内敏正、中村正裕、孫威、青山倫久、冨岡恵、岩部真人、岩部美紀、植木浩二郎、堤 修一、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第57回日本糖尿病学会年次学術集会
    • Place of Presentation
      大阪市
    • Year and Date
      2014-05-24 – 2014-05-24
  • [Presentation] ゲノムワイドFAIRE-seqを用いた褐色脂肪細胞特異的な転写制御機構におけるNFIAの役割の同定2014

    • Author(s)
      脇裕典、平池勇雄、于静、山内敏正、中村正裕、孫威、青山倫久、冨岡恵、岩部真人、岩部美紀、植木浩二郎、堤 修一、油谷浩幸、門脇孝
    • Organizer
      第87回日本内分泌学会学術総会
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      2014-04-26 – 2014-04-26

URL: 

Published: 2016-06-01  

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