2014 Fiscal Year Annual Research Report
アジアの河川流域における薬剤耐性菌の動態解析とβラクタマーゼ産生多剤耐性菌の調査
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25303019
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
山下 尚之 京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (90391614)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水野 忠雄 京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 講師 (00422981)
田中 宏明 京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70344017)
井原 賢 京都大学, 工学(系)研究科(研究院), 研究員 (70450202)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 薬剤耐性菌 / βラクタマーゼ / 多剤耐性菌 / 河川流域 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では，アジアにおいて地理的，社会的状況の異なる日本，中国，バングラデシュという３つの国を対象として，河川流域における薬剤耐性菌の動態について明らかにするとともに，これらの国における多剤耐性菌の存在実態とその多剤耐性菌のβ-ラクタマーゼ産生について調査することを目的とする。今年度は，以下の２つの項目について調査・検討を行った。
(1) アジア諸国の河川流域における薬剤耐性菌の存在実態
アジアの河川流域においてサンプリングを行い，アジア諸国における薬剤耐性菌の存在実態について調査を実施した。平成26年度は，日本および中国においてサンプリングを実施し，河川流域における薬剤耐性菌の存在実態を調べた。日本においては，関西地域の重要な水域である淀川流域，中国は中国南部の大都市である深セン市を流れる大沙河および布吉河において採水を行い，βラクタム系抗生物質の他，スルファメトキサゾール（SMZ），テトラサイクリン（TC）等の抗生物質への薬剤感受性について調査を行い，薬剤耐性菌の存在実態について比較を行った。
(2) アジア諸国の河川流域における多剤耐性菌の存在実態と多剤耐性プロファイル
アジア諸国の河川流域において多剤耐性菌の調査を行い，アジア諸国における多剤耐性菌の存在実態について調査を行った。平成26年度は，日本および中国においてサンプリングを実施し，河川流域における多剤耐性菌の存在実態と多剤耐性プロファイルを明らかにした。多剤耐性試験としては，アンピシリン(ABPC)，セファゾリン(CEZ)，セフォタキシム(CTX)などのβラクタム系抗生物質を中心として，スルファメトキサゾール(SMZ)，テトラサイクリン(TC)，レボフロキサシン(LVFX) ,カナマイシン（KM），ゲンタマイシン（GM）など広範囲の抗生物質を対象とし，多剤耐性プロファイルについて調べた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では，アジアにおいて地理的，社会的状況の異なる日本，中国，バングラデシュという３つの国を対象として，河川流域における薬剤耐性菌の動態について明らかにするとともに，これらの国における多剤耐性菌の存在実態とその多剤耐性菌のβ-ラクタマーゼ産生について調査することを目的とする。今年度は，(1) アジア諸国の河川流域における薬剤耐性菌の存在実態，(2) アジア諸国の河川流域における多剤耐性菌の存在実態，について検討することを予定しており，概ね予定通りに研究の進展が見られた。しかし，国別に見れば，バングラデシュでの河川調査も予定していたが，バングラデシュ国内の政治情勢が不安定だったために，平成26年度は調査を実施することができなかったが，バングラデシュの研究者と調査計画については打合せを行い，具体的な調査計画を作成した。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後の研究推進方策としては，日本および中国での調査に加えて，バングラデシュの研究者と連携しながら，バングラデシュでの河川流域調査も実施し，(1) アジア諸国の河川流域における薬剤耐性菌の存在実態，(2) アジア諸国の河川流域における多剤耐性菌の存在実態に関する知見を集積し，日本，中国，バングラデシュにおける薬剤耐性菌の存在実態に関する国際比較を行う予定である。また，アジア諸国の河川流域から得られた単離株を用いて，(3) アジア諸国の河川流域から単離された多剤耐性菌のβ-ラクタマーゼ産生についても研究を進める予定である。さらに，河川流域から河川水および下水処理水を採水し，(4) 河川水，下水処理水中における薬剤耐性菌の消長に関する基礎的検討についても研究を進め，薬剤耐性菌の環境動態に関する基礎的知見を得る予定としている。
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| Causes of Carryover |
河川流域から採取した薬剤耐性菌の起源解析を目的として，パルスフィールドゲル電気泳動装置等の購入を検討していたが，近年，次世代シーケンサーを用いた遺伝子解析技術の進展が見られており，最適な遺伝子パターン解析を行うことを考慮して，パルスフィールドゲル電気泳動装置等の購入を見合わせた。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成27年度は，環境微生物の遺伝子の解析技術を促進するため，研究室に新たに次世代シーケンサーが導入される見込みとなり，次世代シーケンサーを利用した薬剤耐性菌の起源解析を試みる。一方，次世代シーケンサー用の前処理キットや試薬類を購入するための費用が必要となるため，平成27年度の研究費の一部をこれら前処理キットや試薬類の購入費として充当する。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Elevated risk from estrogens in the Yodo River basin (Japan) in winter and ozonation as a management option2014
Author(s)
Kumar, V., Hanamoto, S., Johnson, A.C., Yamashita, N., Nakada, N., Tanaka, H.
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Journal Title
Environmental Science-Processes & Impacts
Volume: 16(2)
Pages: 232-238
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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