• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2014 Fiscal Year Annual Research Report

東南アジア特異に流行するHCVゲノタイプ6の多様性、感染拡大様式及び病原性の解明

Research Project

Project/Area Number 25305006
Research InstitutionNational Institute of Infectious Diseases

Principal Investigator

阿部 賢治  国立感染症研究所, その他部局等, 研究員 (60130415)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsB型肝炎 / C型肝炎 / HBVゲノタイプ / HCVゲノタイプ / ウイルス変異株 / 麻疹流行 / ベトナム / 東南アジア
Outline of Annual Research Achievements

今年度の成果:
1. ベトナム由来HCVの全長ゲノム解析結果から、ゲノタイプ6に属すが既知のサブタイプには属さない新型HCVが分離された。これらの新規HCVは、HCV新規命名法として最近提唱された分類法に従って、仮に6Xbと6Xcと命名した。
2.台湾島に10,000年以上前から生活している先住民族から分離されたHBVとHCVの遺伝的特徴を解析した。その結果、HBVはゲノタイプB2(78%)と最も多く、次いでゲノタイプD(22%)であった。HCVは、ゲノタイプ1b(78%)が最多で、2b(17%)、3a(5%)と続いたが、ゲノタイプ6は今回の調査では存在しなかった。ゲノタイプDに属すHBV全長ゲノム解析から、既知のサブゲノタイプDには明らかには属さないがD2により近縁であることが示されたので、仮にD2亜型(quasi-subgenotype D2)と命名した。この台湾アボリジン由来のD2亜型HBVは、ユニークなアミノ酸並列(Pre-S/S領域のN115;X遺伝子のP41;P遺伝子のS239, K/E295, V567, P708)を示した。この成績は、台湾アボリジンの移住の歴史を考察する上で興味深い。
3. HCVに関する研究に加えて、今東南アジアで流行し、エマージング疾患として重要である感染症も併せて調査した。昨年ベトナムでは麻疹が大流行したため、その分子疫学的特徴を解析した。その結果は、122人の小児患者からは全てゲノタイプD8に属す麻疹ウイルスが分離できた。興味あることに、N-450領域における塩基配列の解析から、3ヶ所のアミノ酸にユニークな配列(R442, S451,G452)が観察された。これらの遺伝情報は、遺伝子銀行に登録した。この東南アジアに流行する麻疹ウイルスの分子疫学情報は、WHOが勧めるワクチンによる麻疹制圧戦略に貢献すると信じる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

現地カウンターパートの協力が得られ、おおむね順調に共同研究を進めることが出来た。

Strategy for Future Research Activity

今年度は最終年度に当たるので、現地に赴いてより積極的な共同研究を進めたい。研究の総括を行い、今後の研究につなげたい。

Causes of Carryover

3月末までの海外渡航だったので、現地での急な出費を考慮し、若干余裕を残して予算を計上したのが理由です。

Expenditure Plan for Carryover Budget

最終年度となる来年度の研究費に回し、有効に活用したい。

  • Research Products

    (5 results)

All 2014

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 1 results)

  • [Journal Article] Support of the infectivity of hepatitis delta virus particles by the envelope proteins of different genotypes of hepatitis B virus.2014

    • Author(s)
      Natalia Freitas, Kenji Abe, Celso Cunha, Stephan Menne, Severin O. Gudima:
    • Journal Title

      Journal of Virology

      Volume: 88 Pages: 6255-6267

    • DOI

      10.1128/JVI.00346-14

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Novel quasi-subgenotype D2 of hepatitis B virus identified in Taiwanese aborigines.2014

    • Author(s)
      Huy Tran, Ming-Lung Yu, Chia-Yen Dai, I-Ling Lin, Ming-Lun Yeh, Wan-Long Chuang, Kenji Abe:
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 49 Pages: 30-37

    • DOI

      10.1007/s11262-014-1072-x

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The genetic diversity and evolutionary history of hepatitis C virus in Vietnam.2014

    • Author(s)
      Chunhua Li, ManqiongYuan, Ling Lu, Teng Lu, Wenjie Xia, Van H. Pham, An X.D. Vo, Mindie H. Nguyen, Kenji Abe:
    • Journal Title

      Virology

      Volume: 468-470 Pages: 197-206

    • DOI

      org/10.1016/j.virol.2014.07.026

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Nine additional complete genome sequences of HCV genotype 6 from Vietnam including new subtypes 6xb and 6xc.2014

    • Author(s)
      Chunhua Li, Van H. Pham, Kenji Abe, Ling Lu:
    • Journal Title

      Virology

      Volume: 468-470 Pages: 172-177,

    • DOI

      org/10.1016/j.virol.2014.08.006

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Measles epidemics among children in Vietnam: Genomic characterization of virus responsible for measles outbreak in Ho Chi Minh City, 2014.2014

    • Author(s)
      Van H. Pham, Diem P.H. Nguyet, Khanh N.H. Mai, Khanh H. Truong, Loc V. Huynh, Trang H.T. Pham, Kenji Abe:
    • Journal Title

      EBioMedicine

      Volume: 1 Pages: 133-140,

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2014.10.015

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant

URL: 

Published: 2016-06-01  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi