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2015 Fiscal Year Annual Research Report

水和数の精密制御による小さなタンパク質の折れ畳みの観測:真の駆動力は何か

Research Project

Project/Area Number 25410022
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

迫田 憲治  九州大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (80346767)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsリボヌクレアーゼA / タンパク質 / 折り畳み
Outline of Annual Research Achievements

タンパク質が機能を発現するには,適切な構造に折れ畳む必要がある.近年,タンパク質と直接には相互作用していない,遠方にある水分子の並進運動(並進エントロピー)や,それに伴う水分子ネットワーク構造の組み替えが,タンパク質の効率的な折れ畳みを駆動している可能性が指摘されている.天然状態のタンパク質は溶液中でコンパクトな立体構造をとるが,この立体構造が崩壊するときの自由エネルギー変化は比較的小さい.そのため,加熱や他の溶存物質との相互作用によって容易に変性しやすく,このとき,タンパク質がもっていた生化学的な機能は失われる.そのため,タンパク質の微妙な構造安定性を理解するためには,周囲に存在する水の役割を無視することは出来ない.本年度は,球状タンパク質の1つであるリボヌクレアーゼAの電子スペクトルを測定することによって,水や添加化合物がリボヌクレアーゼAの安定性に与える効果に関して研究を行った.
リボヌクレアーゼAの側鎖芳香環の吸収に由来する280nm付近の吸収バンドをモニターしながら温度を変化させると,65℃付近で吸収強度に大きな変化が観測された.これはリボヌクレアーゼAの変性に伴う変化である.一方,実際の細胞中の環境を模倣する目的で中性高分子であるポリエチレングリコールを高濃度に添加した.以前からポリエチレングリコールのような巨大混み合い分子を添加するとタンパク質の安定性が上昇することが報告されていたが,本実験ではリボヌクレアーゼAの融解温度に大きな変化が観測されなかった.一方,溶液中に電解質を添加した系では,リボヌクレアーゼAの融解温度に大きな変化が観測された.これは,電解質イオンの添加によって水分子ネットワークの構造が変化したことが原因であると考えている.

  • Research Products

    (19 results)

All 2016 2015

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (16 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Rearrangements of a Water Molecule in Both Directions between Two Hydrogen-Bonding Sites of 5‑Hydroxyindole Cation: Experimental Determination of the Energy Threshold for the Rearrangement2016

    • Author(s)
      T. Ikeda, K. Sakota, H. Sekiya
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 120 Pages: 1825-1832

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b12111

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Macromolecular crowding modifies the impact of specific Hofmeister ions on the coil-globule transition of PNIPAM2015

    • Author(s)
      K. Sakota, D. Tabata, H. Sekiya
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 119 Pages: 10334-10340

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b01255

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Simultaneous interaction of hydrophilic and hydrophobic solvents with ethylamino neurotransmitter radical cations: Infrared spectra of tryptamine+-(H2O)m-(N2)n clusters (m, n≤3)2015

    • Author(s)
      M. Schuts, K. Sakota, R. Moritz, M. Schmies, T. Ikeda, H. Sekiya, O. Dopfer
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 119 Pages: 10035-10051

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b07408

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 混み合い環境におけるポリ(N-イソプロピルアクリルアミド)の構造転移に対するホフマイスター効果2016

    • Author(s)
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • Organizer
      日本化学会第96回春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの吸着の効果とその分子量特異性2016

    • Author(s)
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      日本化学会第96回春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] Molecular level inspection of H-bond rearrangement and fluctuation in the gas phase2015

    • Author(s)
      K. Sakota
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Rearrangement of hydrogen bond network in mono-hydrated 5-hydroxyindole clusters2015

    • Author(s)
      T. Ikeda, K. Sakota, H. Sekiya
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] The influence of molecular-weight specific adsorption of polyethylene glycol on two-state transition of myoglobin2015

    • Author(s)
      S. Yasutomi, K. Sakota, H. Sekiya
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] IR spectroscopy of 5-hydroxyindole-methanol in the gas phase: Rearrangement of H-bond2015

    • Author(s)
      K. Yoneyama, K. Sakota, H. Sekiya
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 超高感度バイオセンシングを目指した単一微小液滴顕微分光装置の開発2015

    • Author(s)
      迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] 5-ヒドロキシインドール水和クラスターカチオンにおける水和構造組み換えの観測2015

    • Author(s)
      池田貴将,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] ポリ(N-イソプロピルアクリルアミド)の相転移に対する ホフマイスターイオンおよび巨大分子混み合いの複合効果2015

    • Author(s)
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] ミオグロビンの2状態転移に対する ポリエチレングリコールの分子量特異的吸着とその効果2015

    • Author(s)
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] Laser microscopy for a single levitated microdroplet: its application to FRET of simple dyes2015

    • Author(s)
      K. Sakota
    • Organizer
      Workshop on Nanoscale Atomic and Molecular Systems
    • Place of Presentation
      Fukuoka, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Water shuttling in hydrated molecular clusters2015

    • Author(s)
      K
    • Organizer
      Recent Progress in Molecular Science of Korea and Japan
    • Place of Presentation
      Hiroshima, Japan
    • Year and Date
      2015-07-30 – 2015-07-30
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの添加効果とその分子量特異性2015

    • Author(s)
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      九重分子科学セミナー
    • Place of Presentation
      九重共同研修所
    • Year and Date
      2015-07-24 – 2015-07-25
  • [Presentation] The impact of molecular-weight dependent adsorption of polyethylene glycol on two-state transition of myoglobin2015

    • Author(s)
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      9th mini symposium on liquids
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Year and Date
      2015-07-04 – 2015-07-04
  • [Presentation] ミオグロビンの2状態転移に対するポリエチレングリコールの 分子量特異的吸着の効果2015

    • Author(s)
      安冨翔太,迫田憲治,関谷博
    • Organizer
      第52回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2015-06-27 – 2015-06-28
  • [Presentation] 5-ヒドロキシインドール-メタノールクラスターの気相赤外分光:水素結合組み換えの観測2015

    • Author(s)
      米山可凜,迫田憲治,関谷 博
    • Organizer
      第52回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2015-06-27 – 2015-06-28

URL: 

Published: 2017-01-06  

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