2016 Fiscal Year Annual Research Report

Methods and strategies to determine epigenetic variation in human disease: association with R/G-band boundaries on human chromosomes

Research Project

Project/Area Number	25430168
Research Institution	University of Shizuoka
Principal Investigator	渡邊良久静岡県立大学, 薬学部, 客員共同研究員 (00362187)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	前川真人浜松医科大学, 医学部, 教授 (20190291)
Project Period (FY)	2013-04-01 – 2017-03-31
Keywords	染色体バンド境界 / DNA複製タイミング
Outline of Annual Research Achievements	cDNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析を行い、ヒトゲノム“染色体バンド境界地図”との相関解析を行う。特に、細胞間でバンド境界の位置が異なるゲノム部位について、局在する遺伝子群の発現との対応関係を明らかした。また、DNAマイクロアレイを用いたDNAメチル化解析を行い、ヒトゲノム“染色体バンド境界地図”との相関解析を行う。特に、細胞間でバンド境界の位置が異なるゲノム領域について、DNAメチル化状態との対応関係を明らかにした。さらに、特定したバンド境界領域に共通する塩基配列を抽出し、境界を特徴づけるシグナル群が存在するかを明らかにする。また、局在する遺伝子群を網羅的に特定し、その特徴を明らかにした。