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2015 Fiscal Year Annual Research Report

1つの細胞が持つ新奇なウイルス防御システムの体系的理解

Research Project

Project/Area Number 25440013
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

新海 暁男  国立研究開発法人理化学研究所, 横山構造生物学研究室, 先任研究員 (10391989)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
KeywordsCRISPR-Cas / 獲得免疫 / 超分子複合体 / 電子顕微鏡構造 / タンパク質 / 低分子RNA / リボヌクレアーゼ / Thermus thermophilus
Outline of Annual Research Achievements

CRISPR-Casシステムは細菌特有の獲得免疫システムで、ウイルス(ファージ)由来のDNAやRNAなど、細胞外から侵入してくる核酸を分解する。本システムはCRISPRと呼ばれる特徴的な塩基配列を持つDNA領域とCRISPRの近傍にコードされているタンパク質群から構成されている。本システムの作用機構を解明することは、獲得免疫システムの原型やその進化を考察するために重要である。本研究はゲノムが比較的小さいにも関わらず比較的多種類のCRISPR-Casシステムを持つThermus thermophilus株をモデル生物として用い、1つの細胞におけるCRISPR-Casシステムを体系的に理解することを目的としている。今年度は、本菌株のCRISPR-Casシステムを構成しているCmr、Csm両複合体、および、CRISPRの近傍にコードされている機能未知タンパク質群のX線結晶構造解析を行うことを目的として、これらのタンパク質の発現・調製を試みた。その結果、Cmr複合体を構成している6種類のタンパク質サブユニットのうちの4種類を大腸菌無細胞タンパク質合成法で同時に発現させることによってCmrサブ複合体を作製することができた。このサブ複合体に、大腸菌で発現させた2種類のタンパク質サブユニット、および、34~46塩基のRNAを混合することによって、Cmr複合体を作製することができた。Csm複合体を構成している5種類のタンパク質サブユニットは、いずれも大腸菌あるいは大腸菌無細胞タンパク質合成法で発現した。しかし、それらのうちの1種類は何れの発現系においても不溶性であった。4種類の機能未知タンパク質:TTHB159、-158、-157、-156のうち、TTHB156以外のものは大腸菌あるいは大腸菌無細胞タンパク質合成法で発現した。しかし、TTHB158タンパク質は不溶性であった。

  • Research Products

    (5 results)

All 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (2 results)

  • [Int'l Joint Research] Wageningen University/University of Utrecht(オランダ)

    • Country Name
      NETHERLANDS
    • Counterpart Institution
      Wageningen University/University of Utrecht
  • [Int'l Joint Research] University of California, Berkeley(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      University of California, Berkeley
  • [Journal Article] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Cmr複合体の構造と機能2015

    • Author(s)
      新海 暁男
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 87 Pages: 454-458

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2015.870454

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilusのType III CRISPR-Casシステムを構成しているリボヌクレオタンパク質複合体の構造と機能2015

    • Author(s)
      新海 暁男
    • Organizer
      BMB2015
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫県神戸市
    • Year and Date
      2015-12-03
  • [Presentation] 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Casシステムを構成するCmr複合体の構造と機能2015

    • Author(s)
      新海 暁男
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      ホテルライフォート札幌、北海道札幌市
    • Year and Date
      2015-07-15

URL: 

Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-27  

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