2013 Fiscal Year Research-status Report
ｍＲＮＡ核外輸送受容体サブユニットｐ１５のＲＮＡ認識機構
| Project/Area Number |
25440083
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
| Research Institution | Osaka University |
|---|
Principal Investigator |
片平 じゅん 大阪大学, 生命機能研究科, 准教授 (30263312)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
| Keywords | 核－細胞質間輸送 / 遺伝子発現制御 / RNA |
|---|
| Research Abstract |
核膜を有する真核細胞では、様々なRNAやタンパク質の核－細胞質間輸送は、遺伝子発現において必須の過程であり、多くの生命機能発現のための基礎となる。また、ある種の病原体は、宿主の核－細胞質間輸送装置を利用して、その生活環を全うすることが知られている。したがって、核－細胞質間輸送過程は、感染症制御の標的にもなり得る可能性がある。このようなことから、輸送過程に関係する因子群の構造・機能を詳細に解析し、核－細胞質間輸送の分子メカニズムを明らかにすることは、基礎生物学的な研究として重要であるばかりでなく、創薬などの応用研究を進めていく上でも有用な情報を提供できる可能性がある。
本研究では、mRNA核外輸送の分子メカニズムの解明を目指し、輸送受容体ヘテロダイマーとモデル輸送基質RNAの相互作用機構の解析を行なった。また、輸送受容体ヘテロダイマーとモデル輸送基質RNAとの三者複合体の結晶構造解析を行なうために、大腸菌における輸送受容体ヘテロダイマーのリコンビナントタンパク質の発現系を確立するとともに、大量発現および精製条件の至適化を行なった。得られた輸送受容体ヘテロダイマーのリコンビナントタンパク質を用いて、１０００を超える結晶化条件のスクリーニングを行ない、有望な条件をいくつか得ることができた。さらに、輸送受容体ヘテロダイマーとモデル輸送基質RNAとの三者複合体を再構成し、同様に結晶化条件のスクリーニングを行なった。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
輸送受容体ヘテロダイマーの発現の至適化を完了し、質・量的に構造解析に用い得る試料が得られた。現在までに、輸送受容体ヘテロダイマーについては、約3.6オングストロームの解像度の構造データが得られている。一方、積み荷RNAを含む三者複合体では、高解像度の構造データは、まだ得られていない。また、これまで数種類のRNA変異体を作製し、ゲルシフト法で輸送受容体ヘテロダイマーとの結合を解析したが、RNA側の結合ドメインの特定には至っていない。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後は、RNA側の結合部位の特定に向け、RNaseT1フィンガープリンティング等の手法を用いて、より詳細な解析を行なう必要がある。また、主としてRNAの構造の不安定さが原因となり、輸送受容体ヘテロダイマーとRNAの三者複合体については、高解像度のデータが得られていない。次年度以降は、RNA側に構造を安定化するような変異や修飾を導入し、構造データの改善を試みる。
|
| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
理由
研究の進捗状況に応じて、できるだけ無駄のないように研究費を執行した結果、本年度は当初の見込み額と執行額が異なった。
使用計画
次年度以降も、本年度分も含めて研究費を執行し、計画通りに研究を進める。
|
-
[Journal Article] Human TREX component Thoc5 affects alternative polyadenylation site choice by recruiting mammalian cleavage factor I.2013
Author(s)
Katahira, J., Okuzaki, D., Inoue, H., Yoneda, Y., Maehara, K. and Ohkawa, Y.
-
Journal Title
Nucleic Acids Res.
Volume: 41
Pages: 7060-7072
DOI
Peer Reviewed
-
-
