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2015 Fiscal Year Annual Research Report

短いペプチドオリゴマーを用いた、水中での強固な規則構造の構築と制御

Research Project

Project/Area Number 25460009
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

尾谷 優子  東京大学, 薬学研究科(研究院), 講師 (60451853)

Project Period (FY) 2013-02-01 – 2016-03-31
Keywordsβ-アミノ酸 / ヘリックス構造 / プロリン / アミド結合 / シス-トランス異性化 / 計算科学
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、プロリン型の3級アミド結合を持つ二環性β-プロリンミミックを用いた機能性物質創製のための構造化学の基礎および応用研究を行うことを目的とした。3級アミドはシスアミド体とトランスアミド体の平衡混合物になることが多く、規則構造の創製にはアミド平衡の制御が必須である。アミド平衡をシス・トランスどちらか一方に完全に制御したプロリン誘導体の報告は少ない。
3年間の研究期間を通じて、二環性骨格の橋頭位に1個置換基を導入したβ-アミノ酸を創製し、アミド平衡をシスあるいはトランス一方に完全に偏らせることに成功した。また、このようなβ-アミノ酸を2個連結させ、閉環メタセシス反応を用いて橋頭位置換基同士を結んだ環化モデルペプチドのアミド結合の溶液構造解析を行ったところ、環化前はシスアミド体のみを取っていたが、環化によりシス/トランス比や回転障壁が変化し、環を作るリンカー長が短いほどトランス体の割合が増え、回転障壁も低下することを見出した。
トランスアミド体をとるβ-アミノ酸を2個から8個連結させたペプチドオリゴマーを創製し、溶液構造解析や短い(2-3量体)オリゴマーのX線結晶構造解析を行った結果、安定なヘリックス構造をとることを示した。これは生体にない構造規則性を持つ伸長型ヘリックス構造であり、人工アミノ酸であるため生体内での酵素消化に対する安定性をもつと予想される。このペプチドオリゴマーのうちのいくつかが、あるタンパク質-タンパク質相互作用を阻害することを見出した。今後は阻害活性を改善すると同時に、タンパク質への作用部位等を明らかにしたい。

  • Research Products

    (27 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results) Presentation (23 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Hydrogen Bonding to Carbonyl Oxygen of Nitrogen-Pyramidalized Amide-Detection of Pyramidalization Direction Preference by Vibrational Circular Dichroism Spectroscopy.2016

    • Author(s)
      Siyuan Wang, Tohru Taniguchi, Kenji Monde, Masatoshi Kawahata, Kentaro Yamaguchi, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 52 Pages: 4018-4021

    • DOI

      10.1039/C6CC00284F

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Tandem Buildup of Complexity of Aromatic Molecules Through Multiple Successive Electrophile Generation in One Pot, Controlled by Varying the Reaction Temperature2016

    • Author(s)
      Akinari Sumita, Yuko Otani, and Tomohiko Ohwada
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 14 Pages: 1680-1693

    • DOI

      10.1039/C5OB02240A

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structure-Activity Relationships of Lysophosphatidylserine Analogs as Agonists of G-Protein-Coupled Receptors GPR34, P2Y10, and GPR1742015

    • Author(s)
      Masaya Ikubo, Asuka Inoue, Sho Nakamura, Sejin Jung, Misa Sayama, Yuko Otani, Akiharu Uwamizu, Keisuke Suzuki, Takayuki Kishi, Akira Shuto, Jun Ishiguro, Michiyo Okudaira, Kuniyuki Kano, Kumiko Makide, Junken Aoki, and Tomohiko Ohwada
    • Journal Title

      Journal of Medicinal Chemistry

      Volume: 58 Pages: 4204-4219

    • DOI

      10.1021/jm5020082

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] sp2-窒素上での求核置換反応による複素環構築反応の研究2016

    • Author(s)
      寧 桜唐, 福田 朋也, 尾谷 優子, 川幡 正俊, 山口 健太郎, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] リン原子への隣接基関与によるリン酸トリエステルのP-O結合開裂反応と新たな求電子種発生法への応用2016

    • Author(s)
      澄田 明成, 尾谷 優子, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] 不斉記憶型分子内アルキル化における窒素置換基効果2016

    • Author(s)
      大津寄 悠,松田 誠司, 川上 晋平, 吉村 智之, 尾谷 優子, 谷 紀彦, 大和田 智彦, 川端 猛夫
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] 橋頭位置換二環性プロリン誘導体のヘテロペプチドオリゴマーの構造解析2016

    • Author(s)
      ザイ ルーハン, オカンポ ディエゴ, 王 思遠, 尾谷 優子, 大和田智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] アルカリ加水分解に対する二環性βプロリンアミドの安定性2016

    • Author(s)
      オカンポ ディエゴ, ザイ ルーハン, 王 思遠, 尾谷 優子, 川幡 正俊, 山口 健太郎, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] タンパク質S-トランスニトロソ化反応解析のためのモデル反応の開発2016

    • Author(s)
      猪股 悟, フィルマン, 尾谷 優子, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] プロリン型人工アミノ酸ペプチドの規則構造化における置換基効果の計算科学的検討2016

    • Author(s)
      尾谷 優子, 王 思遠, 渡邉 恵, 北尾 彰朗, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] ペリ位置換基―イミノカチオン結合形成における構造要求性の検討2016

    • Author(s)
      福田 朋也, 寧 桜唐, 尾谷 優子, 川幡 正俊, 山口 健太郎, 大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] リゾリン脂質のGPCRへの結合様式解明のための誘導体合成2016

    • Author(s)
      佐山 美紗, ジョン セジン, 中村 翔, 井久保 仁也, 尾谷 優子, 上水 明治, 岸 貴之, 井上 飛鳥, 巻出 久美子, 青木 淳賢, 広川 貴次,大和田 智彦
    • Organizer
      日本薬学会第136年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] プロリン型の非天然アミノ酸の柔らかいアミド結合に基づいた規則構造制御2016

    • Author(s)
      尾谷 優子
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府・京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24
    • Invited
  • [Presentation] 二環性β-プロリンオリゴマーの規則構造化の鎖長依存性2015

    • Author(s)
      尾谷優子・王思遠・北尾彰朗・渡辺恵・大和田智彦
    • Organizer
      第45回複素環化学討論会
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都・新宿区)
    • Year and Date
      2015-11-20
  • [Presentation] 可視光感受性二環性ニトロソアミンを用いるCaged NO化合物の生細胞応用のための構造最適化2015

    • Author(s)
      フィルマン・中嶋隆浩・猪股悟・尾谷優子・浦野泰照・佐藤守俊・大和田智彦
    • Organizer
      第45回複素環化学討論会
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都・新宿区)
    • Year and Date
      2015-11-19
  • [Presentation] Synthesis and conformational study of hetero-dimers of bicyclic proline derivatives2015

    • Author(s)
      Luhan Zhai, Diego Ocampo, Siyuan Wang, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • Organizer
      第52回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      平塚中央公民館(神奈川県・平塚市)
    • Year and Date
      2015-11-17
  • [Presentation] New helical foldamer with 1:1 alpha/beta amino acid residue patterns2015

    • Author(s)
      Siyuan Wang, Yuko Otani, Masatoshi Kawahata, Kentaro Yamaguchi, Tomohiko Ohwada
    • Organizer
      第52回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      平塚中央公民館(神奈川県・平塚市)
    • Year and Date
      2015-11-16
  • [Presentation] Alkaline hydrolysis of nonplanar bicyclic β-proline amides2015

    • Author(s)
      Diego Antonio Ocmapo Gutierrez de Velasco, Zhai Liuhan, Siyuan Wang, Yuko Otani, Tomohiko Ohwada
    • Organizer
      第52回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      平塚中央公民館(神奈川県・平塚市)
    • Year and Date
      2015-11-16
  • [Presentation] GPCR と脂質リガンドの結合モデルに基づくリガンドの構造展開2015

    • Author(s)
      佐山 美紗
    • Organizer
      CBI学会2015年大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • Year and Date
      2015-10-27
  • [Presentation] オキシム転位選択性の制御:オキシム窒素カチオンの安定化へのへテロ原子の関与2015

    • Author(s)
      寧桜唐,福田朋也,尾谷優子,川幡正俊,山口健太郎,大和田智彦
    • Organizer
      第46回 反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪府・東大阪市)
    • Year and Date
      2015-10-26
  • [Presentation] ワンポット逐次的求電子種生成法の開発-芳香族連続官能基化反応への応用2015

    • Author(s)
      澄田明成,黒内寛明,尾谷優子,大和田智彦
    • Organizer
      第46回 反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      近畿大学(大阪府・東大阪市)
    • Year and Date
      2015-10-26
  • [Presentation] Structural Expansion of the Lipid Ligand Lysophosphatidylserine Based on the Model of Hydrophobic Binding Pocket of G-protein-coupled Receptor GPR34/LPS12015

    • Author(s)
      佐山 美紗, ジョンセジン, 中村翔, 井久保仁也, 尾谷優子, 上水明治, 岸貴之, 井上飛鳥, 巻出久美子, 青木淳賢, 広川貴次, 大和田智彦
    • Organizer
      第43回構造活性相関シンポジウム・第10回薬物の分子設計と開発に関する日中シンポジウム
    • Place of Presentation
      新潟日報メディアシップ 日報ホール(新潟県・新潟市)
    • Year and Date
      2015-09-29
  • [Presentation] オキシム窒素上の新しい結合形成反応:隣接基関与によるイミノカチオンの関与2015

    • Author(s)
      福田 朋也・寧 桜唐・尾谷優子・大和田智彦・川幡正俊・山口健太郎
    • Organizer
      第26回基礎有機化学討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学(愛媛県・松山市)
    • Year and Date
      2015-09-24
  • [Presentation] タンパク質S-トランスニトロソ化反応のモデル系構築2015

    • Author(s)
      猪股 悟・フィルマン・尾谷優子・大和田智彦
    • Organizer
      第26回基礎有機化学討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学(愛媛県・松山市)
    • Year and Date
      2015-09-24
  • [Presentation] アルカリ加水分解に対する二環性β-プロリンアミドの安定性2015

    • Author(s)
      ディエゴアントニオオカンポグティエレスデベラスコ、ザイルーハン、 劉シン、王思遠、尾谷優子、大和田智彦
    • Organizer
      第59回日本薬学会関東支部大会
    • Place of Presentation
      日本大学(千葉県・船橋市)
    • Year and Date
      2015-09-12
  • [Presentation] 二環性プロリン誘導体のヘテロジペプチドのコンホメーション解析2015

    • Author(s)
      ザイ ルーハン、ディエゴ オカンポ、劉 シン、王 思遠、尾谷 優子、 大和田 智彦
    • Organizer
      第59回日本薬学会関東支部大会
    • Place of Presentation
      日本大学(千葉県・船橋市)
    • Year and Date
      2015-09-12
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科 薬化学教室

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~yakka/index.html

URL: 

Published: 2017-01-06  

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