2014 Fiscal Year Research-status Report
炎症性腸疾患の起因微生物の特定と治療・予防への展開
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25460177
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Research Institution | Aichi Gakuin University |
Principal Investigator |
河村 好章 愛知学院大学, 薬学部, 教授 (80262757)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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Keywords | メタゲノム解析 / 細菌叢 |
Outline of Annual Research Achievements |
DNA-deduction法を使った16Sメタゲノム法によるデータを精査したところ、一定の菌群の増減は確認できたものの、予想よりも少ない多様性しか確認できず、マイナー菌群を含めた、起因菌と考えられる菌群検出の再現性が確認できなかった。 現在、あらたなモデルマウスを作成すべく準備中である。 FISHによる特定微生物の検出系については、ハイブリダイゼーションの条件設定や、蛍光色素を変えることにより、夾雑物の中でも特異性高く検出することに成功している。 Helicobacter cinaediの6型分泌機構(T6SS)に関連する遺伝子のノックアウト株については、遺伝子レベルでの評価の結果、作成に成功することができた。さらに相補株を作成し、T6SSの直接的な影響を確認する系を構築している。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
DNA-deduction法の結果、多様性に富むデータの再現性が得られず、発症に関与する微生物の特定が十分に行えていない。 またHelicobacter cinaediについては、T6SS遺伝子のノックアウト株の作成には成功したが、その相補株は現在作成中であり、動物実験にまで至っていない。 FISHについては、夾雑物の存在下でも一定の細菌を検出することができたので、今後腸管壁等に対して適応していく。
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Strategy for Future Research Activity |
再度、潰瘍性大腸炎のモデルマウスを作成し、DNA-deduction法を使った手法で、細菌叢を明らかにする試みを行う。H. cinaediについても、ノックアウト株が出来ているので、相補株の作成と平行して、早急に動物実験を実施する。 また、日本感染症学会総会でシンポジウム発表したところ、ヒトの臨床検体を提供頂ける施設と話が出来たので、マウスモデルでの精査と同時に、ヒトの腸管細菌叢メタゲノム解析も同時に進め、新知見を見出すように努めたい。
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Causes of Carryover |
動物感染実験まで進捗せず、その分の使用額が少なかった。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
次年度は、動物モデルのみならずヒト臨床検体も精査する機会があるので、積極的にデータ取得、解析を行う予定である。
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Research Products
(1 results)