2013 Fiscal Year Research-status Report
NK/T細胞リンパ腫のプロテオーム解析による病態解明と臨床応用
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25460436
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Research Institution | Osaka University |
Principal Investigator |
本間 圭一郎 大阪大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20505945)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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Keywords | 悪性リンパ腫 |
Research Abstract |
健常人末梢血buffy coatから分離した単核球を、低濃度IL-2(10U/ml)およびfeeder (K562-mb15-41BBL)とともに共培養し増幅後、MACSで選択したNK細胞、およびレンチウイルスでEBER2、BARF1を導入したNK細胞を調整した。これらのNK細胞とNKリンパ腫細胞株(SNK6, NKL)からゲノムDNA、RNA、lysateを調整した。これらの検体でlysateはiTRAQ試薬による修飾ペプチドを調整し、ゲノムDNAはoligoarry CGH + SNP array解析に供した。ゲノムDNAでは申請者らの既報oligo array CGHで確認されたゲノム異常のほかに、新たに複数領域でUPDを認めた。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
申請者の施設におけるiTRAQ MS/MS解析を行う質量分析計の利用者が多く、解析できるまで時間を要するため、実験の進行にやや遅れが生じている。
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Strategy for Future Research Activity |
iTRAQ MS/MS解析については、他施設との共同研究で早急に解析を行う。ゲノム解析で明らかになったUPD領域の責任遺伝子を同定し、臨床検体での解析に移行する。
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Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
支出額は消耗品であり、これらは実験の実際の進捗状況や試行錯誤により変動する。本年度は別欄で記載の事由により研究進行に若干の遅れを生じ、そのため当初の予定額を下回った。 次年度使用額は、適宜外注会社のリソースなども利用し研究計画に遅れが生じないよう有効活用する。
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