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2013 Fiscal Year Research-status Report

MLPAとFISHを用いたヒト固形癌における遺伝子増幅の網羅的研究

Research Project

Project/Area Number 25460452
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionKanazawa University

Principal Investigator

大井 章史  金沢大学, 医学系, 教授 (50160411)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsgastric cancer / gene amplification / MLPA / FISH / ERBB2 / EGFR / FGFR2 / MYC
Research Abstract

附属病院外科で切除された胃癌239例のフォルマリン固定パラフィン包埋切片よりDNAを抽出し、2種類のmultiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) キット(P175-A2 Tumour-Gain kit、P231-A2)を用いて、MDM4, MYCN, ALK, PDGFRA, KIT, KDR, DHFR, EGFR, MET, SMO, BRAF, FGFR1, MYC, ABL1, RET, CCND1, CCND2, CDK4, MDM2, AURKB, ERBB2, TOP2A, AURKA, AR、FGFR2 and FGF10の遺伝子コピー数を検索した。またERBB2とEGFRについては, 全症例を対象に免疫染色にて蛋白の過剰発現を検索し陽性症例では連続切片をもちいたfluorescence in situ hybridization (FISH)を用いて遺伝子増幅を検索し、MLPAの結果と比較した。
MLPA では、ERBB2の’amplification’は13例、’gain’は15例、他の211例は’normal’であった。免疫染色陽性例について行ったFISHでは、13例の’amplification’全例に遺伝子増幅が見られ、其の増幅形態は12例がhomogeneously stainng resion (HSR) 型、1例がdouble minute (DM) 型であった。また、’gain’の15例のうち1例を除いて全例にFISHで増幅がみられた。MLPAで’normal’とされた211例中7例にFISHで増幅がみられたが、いずれも、陽性細胞の割合は10%以下であった。
以上の結果から、胃癌における優勢な遺伝子増幅はMLPAでスクリーング可能であるという見地から、EGFR, FGFR2, MET, MYC, CCND1, MDM2のMLPA値が1.3以上(’amplification’& ’gain’)であった症例についてFISHを行った。結果、EGFR, FGFR2, MET, MYC, CCND1, MDM2の遺伝子増幅がそれぞれ4, 10, 2, 10, 5例に認められた。さらに、受容体チロシンキナーゼを標的とする分子標的療法を視野にいれ進行胃癌に限って検討すると、ERBB2, EGFR, FGFR2, METの遺伝子増幅は42例にみられERBB2とFGFR2の同時増幅の見られた3例を除くと重複増幅はみられなかった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

乳癌について、ERBB2、EGFRの免疫染色、ERBB2, EGFRのFISHを行い。同時に ”SALSA MLPA probemix P078-C1 Breast Tumour”,を用いたMLPAを施行し、遺伝子増幅・増加を網羅的に検索し、さらに増幅・増加の見られた遺伝子をFISHで確認しつつある。
さらに胃癌についての解析はほぼ終了した。学会発表ののち、論文完成をめざしている。
研究全体からみると本年度の達成度は80%である。

Strategy for Future Research Activity

乳癌、大腸癌に関して引き続き、MLPA, FISHの解析を続ける。

  • Research Products

    (9 results)

All 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Utility of fluorescence in situ hybridization to detect MDM2 amplification in liposarcomas and their morphological mimics.2013

    • Author(s)
      Hiroaki Kimura, Yoh Dobashi, Takayuki Nojima, Hiroyuki Nakamura, Norio Yamamoto, Hiroyuki Tsuchiya, Hiroko Ikeda, Seiko Sawada-Kitamura, Takeru Oyama, Akishi Ooi
    • Journal Title

      Int J Clin Exp Pathol

      Volume: 6 Pages: 1306-1316

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Intratumoral heterogeneity of gene amplification of HER2 in gastric cancers examined by MLPA and FISH.2013

    • Author(s)
      Akishi Ooi, Ryousuke Tajiri, Ritsuko Nakamura, Takeru Oyama ,Takashi Fujimura, Yoh Dobashi
    • Organizer
      72th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • Year and Date
      20131003-20131005
  • [Presentation] Global transcript analysos for the gastric carcinomas with intratumoral heterogeneity.2013

    • Author(s)
      Takeru Oyama, Ritsuko Nakamura, Ryosuke Tajiri, Akishi Ooi
    • Organizer
      72th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • Year and Date
      20131003-20131005
  • [Presentation] Nell 1/2 expression and function in kidney cancer.2013

    • Author(s)
      Ritsuko Nakamura, Takeru Oyama, Ryosuke Tajiri, Akishi Ooi
    • Organizer
      72th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association.
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama, Yokohama
    • Year and Date
      20131003-20131005
  • [Presentation] Utility of fluorescence in situ hybridization (FISH) to detect MDM2 amplification2013

    • Author(s)
      大井章史、土橋洋、野島孝之、池田博子、北村星子、尾山武
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      さっぽろ芸文館、札幌
    • Year and Date
      20130606-20130608
  • [Presentation] 骨軟部腫瘍におけるAKT遺伝子の異常と蛋白活性化2013

    • Author(s)
      土橋洋、蛭田昌宏、椙村春彦、山田茂樹、大井章史
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      さっぽろ芸文館、札幌
    • Year and Date
      20130606-20130608
  • [Presentation] ERBB2増幅陽性胃癌における癌遺伝子増幅に関する腫瘍内多様性の検討2013

    • Author(s)
      田尻亮輔、尾山武、中村律子、大井章史
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      さっぽろ芸文館、札幌
    • Year and Date
      20130606-20130608
  • [Presentation] ヒト胃癌でのHER2遺伝子発現の腫瘍内不均一性を示す部分における遺伝子発現2013

    • Author(s)
      尾山武、中村律子、田尻亮輔、大井章史
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌、札幌
    • Year and Date
      20130606-20130608
  • [Presentation] 胎児腎、腎癌などにおける分泌型タンパクNellの発現機能解析2013

    • Author(s)
      中村律子、尾山武、田尻亮輔、中本賢、大井章史
    • Organizer
      第102回日本病理学会総会
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌、札幌
    • Year and Date
      20130606-20130608

URL: 

Published: 2015-05-28  

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