2015 Fiscal Year Annual Research Report
自己免疫性膵炎のDNAメチレーション異常についての検討
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25460453
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| Research Institution | Shinshu University |
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Principal Investigator |
上原 剛 信州大学, 学術研究院医学系, 准教授 (80402121)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
増本 純也 愛媛大学, 大学院医学系研究科 ゲノム病理学分野, 教授 (20334914)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 自己免疫性膵炎 / メチル化解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
自己免疫性膵炎のDNAメチル化異常についてイルミナ社のInfinium MethylationEPIC Kitを用いて網羅的な解析を行った。１３症例の自己免疫性膵炎、コントロールには閉塞性膵炎１４症例と、正常膵を１４症例選択した。それぞれの症例に対してマイクロダイセクションを行いDNAを濃度20ng/μLで1000ngのDNAを抽出した。Bisulfate法によってDNAを処理したのちに、およそ45万カ所のCpGアイランド部位に対して全ゲノム網羅的なメチル化アレイ解析を行った。解析後、上位５０および下位５０位の高メチル化遺伝子領域をピックアップした。そこからプロモーター領域でAIPに関連が示唆されるメチル化異常を認める遺伝子をデータベースと比較しながら選択し、メチル化異常を示す遺伝子を複数選択した。
その後、選択された遺伝子のプロモーター領域のターゲットCpG周辺のDNA配列を検索し、メチル化特異的プライマーとメチル化非特異的プライマーを作成し、メチル化特異的定量PCR法を用いてメチル化異常が自己免疫性膵炎に特異的なものかどうかの再検証解析を行っっている。プライマー条件が難しく再検証が困難な遺伝子があるので、別の手法での解析を行う予定である。また選択された遺伝子のタンパク発現に関して、免疫染色での解析を行っている。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] Signal intensity of the pancreas on magnetic resonance imaging: Prediction of postoperative pancreatic fistula after a distal pancreatectomy using a triple-row stapler2015
Author(s)
Arai T, Kobayashi A, Yokoyama T, Ohya A, Fujinaga Y, Shimizu A, Motoyama H, Furusawa N, Sakai H, Uehara T, Kadoya M, Miyagawa S.
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Journal Title
Pancreatology
Volume: 15
Pages: 380-386
DOI
Peer Reviewed
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