2015 Fiscal Year Annual Research Report
新規O血清群に属する志賀毒素産生性大腸菌のゲノム構造と病原因子の解析
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25460540
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| Research Institution | University of Miyazaki |
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Principal Investigator |
井口 純 宮崎大学, 農学部, 准教授 (00437948)
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2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 志賀毒素産生性大腸菌 / 血清型 / O血清群 / ゲノム解析 / PCR |
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| Outline of Annual Research Achievements |
大腸菌の新規O血清群株について、ゲノム情報を基盤とした遺伝学的特徴の解析を行った。2011年に大腸菌のレファランスセンターであるデンマーク国立血清研究所（Statens Serum Institut：SSI）により新しく6種類のO血清群（O182からO187）が追加された。これらの新規O血清群は、前回2004年にSSIにより8種類（O174からO181）が追加された時と同様に、志賀毒素産生性大腸菌（Shiga toxin-producing E. coli：STEC）に見出された未同定のO血清群が追加されたと予想された。SSIより入手した新規O血清群STEC参考株を用いて病原関連遺伝子（stx1, stx2, eae）の保有をPCRにより確かめたところ、O182：stx1/eae、O183：stx2、O185：stx1/stx2、O186：stx2/eaeであり、O184とO187はstx、eaeともに陰性であった。7種類のハウスキーピング遺伝子の配列情報を基に系統分類を行ったところ、O184およびO186は系統Aグループ、O181およびO182はB1グループ、O183およびO185はB2グループに分類された。MiSeqシステムにより各株のドラフトゲノムを取得し、O抗原コード領域を抽出して遺伝子アノテーションを行った。その情報を基にそれぞれのO血清群に特異的な検出できるPCR法を開発し、2014-2015年に国内で分離されたヒト患者由来株STECについて網羅的調査を行ったところ、O182-2株、O183-6株、O184-0株、O185-1株、O186-1株、O187-0株が確認された。さらに、既存のO血清群またはその遺伝子型には属さない6種類の新規O血清群遺伝子型（OgN）を見出し、それぞれを検出するPCR法も併せて開発した。
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Research Products
(3 results)
