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2014 Fiscal Year Research-status Report

薬物代謝遺伝子解析用アレイを用いた、CPT-11副作用予測因子の探索

Research Project

Project/Area Number 25460659
Research InstitutionTokyo Women's Medical University

Principal Investigator

倉持 英和  東京女子医科大学, 医学部, 講師 (30287362)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 林 和彦  東京女子医科大学, 医学部, 教授 (10208613)
中島 豪  東京女子医科大学, 医学部, 助教 (80338996)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
KeywordsCPT-11 / 遺伝子多型 / DMET
Outline of Annual Research Achievements

DMETマイクロアレイを持ちいて、胃癌大腸癌患者で塩酸イリノテカンを使用した患者14名の血清から抽出したDNAより遺伝子多型スクリーニングを行った。
DMET TM PlusはAffymetrix社から発売されている薬物代謝・トランスポーター遺伝子解析用マイクロアレイであり、網羅的に225遺伝子上の1,936個の薬物代謝マーカーの解析が可能である。特長としては従来の一塩基変異(SNP)だけではなく、挿入、欠損、トリアレル、コピー数など様々な種類の遺伝子変異をカバーしているため、従来のSNPアレイのみでは測定できなかった様々な種類の多型を測定することができる。
14名の患者の臨床データ、特に副作用データと遺伝子情報を統計的に解析することにより、イリノテカンの副作用発現に関連する遺伝子多型を同定することを目的としている。
好中球減少と多型との関連解析では14の多型で有意な関連が見られた。
また下痢との関連では28の多型で有意な関連が見られた。検定の多重性を考慮しても1つのSNP Xに有意な関連(P<0.00001)が認められた。
今後このSNPに関する、別集団のコホート検体を用いたValidationと、機能解析を行う予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

実験補助員の確保に難渋していたが、昨年末より補助員の雇用に成功し、予備実験を行っている。

Strategy for Future Research Activity

DMETによる測定と臨床データとの統計的関連性の検討から得られた候補遺伝子多型において別のコホートを用いた検証と、機能解析を行っていきたいと考えている。

Causes of Carryover

実験補助員の手配が進まず、人件費が消費できなかった。学会出張費が予定に満たなかった。

Expenditure Plan for Carryover Budget

実験補助員も確保できたため、今年度実験を遂行していく。

URL: 

Published: 2016-05-27  

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