2013 Fiscal Year Research-status Report
Nanofluidic法を用いた肺炎症例の肺炎球菌血清型サーベイランスの構築
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25460761
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Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Research Institution | Nagasaki University |
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Principal Investigator |
古本 朗嗣 長崎大学, 大学病院, 講師 (50380952)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 呼吸器感染症 / 成人肺炎 / 肺炎球菌 / 肺炎球菌血清型 |
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| Research Abstract |
H25年は、システムの有用性の確認と、収集サンプルの処理に時間を費やした。ベトナムの小児コホートで得られた小児のレントゲンで確認した肺炎の52検体（咽頭拭い液）から、LytA陽性のサンプルをnanofluidic技術を用いて血清型を解析し研究協力者が論文として出版した。この研究によって、この技術の正確性と再現性を確認することができた。（Journal of Medical Microbiology 2014;63:528）これにより、本格的に成人肺炎コホートへの利用が可能である段階に至った。
現在、保存された成人肺炎コホートの喀痰サンプルのDNA抽出と、一般細菌（肺炎球菌、インフルエンザ菌、モラキセラ）および非定型菌（マイコプラズマ、クラミドフィラ、レジオネラ）のスクリーニングPCRを推進している。現在は一年目(合計約1600検体）のサンプルの処理を続行しており、サンプルは二年分を収集している（合計3000検体程度）。
DNA抽出が済んだものから、nanofluidic技術を用いたPCRで血清型を同定しているが、この中で、一人の患者の検体から複数の血清型が分離されるケースが、これまで考えられていたよりも多い事が明らかとなった。このことは今後のワクチン政策を考慮する上で重要である。
また、培養陽性の保存菌株の従来法（菌の膨化反応）による血清型分類も同時に進行しており、この結果とnanofluidic技術を用いた結果との整合性を確認するに至った。
これまでの成果から、研究方針を分離菌の本技術と従来法の二法による血清型決定、喀痰から直接抽出したDNAを用いての本技術での血清型決定を行うこととした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
ベトナム小児の解析が順調に進み、また、成人肺炎のサンプル収集と解析作業には時間を要するが、滞りなく遂行している。
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| Strategy for Future Research Activity |
ひきつづき、計画通り収集されたサンプルを処理して、データ化していく。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
おおむね予定通り使用したが、試薬の購入が予定よりも少なかった。
研究をより加速させて、継続することで使用していく予定である。
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