2015 Fiscal Year Annual Research Report
ABO式血液型遺伝子のエンハンサーの同定に基づく統合的転写調節機構の解明
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25460861
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| Research Institution | Gunma University |
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Principal Investigator |
中島 たみ子 群馬大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (40008561)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
小湊 慶彦 群馬大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30205512)
佐野 利恵 群馬大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (70455955)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | ABO遺伝子 / ハプロタイプ / エンハンサー / 転写因子 / 転写調節 / 遺伝子発現 / 変異型 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
既に我々は、血球系細胞特異的エンハンサー(+5.8-kb site）を同定し、ABOの亜型であるBm、AmやA3型ではこの+5.8-kb siteに欠失や塩基置換があることを報告してきた。今回は、通常型ABO式血液型の+5.8-kb siteのハプロタイプについて解析を行い、両者の間の遺伝子型特異的なリンクを検討した。通常型ABO式血液型113名の遺伝子のエキソン6・7及び+5.8-kb siteの塩基配列を調べた。その結果+5.8-kb siteには6種類のハプロタイプが見いだされ、それぞれABOInt1*01-06と命名した。218/226アリルで、ABOInt1*04を有するアリルではA遺伝子と、ABOInt1*06を有するアリルではB遺伝子と、ABOInt1*01-03、ABOInt1*05アリルではO遺伝子とリンクしていると推測された。Peptide Nucleic Acid (PNA)-clamping PCR及びクローニングにより、AおよびB遺伝子のアリル特異性は確認された。また、各種ハプロタイプの+5.8-kb siteを組み込んだルシフェラーゼレポータープラスミドを用いたレポーターアッセイでは、6種のハプロタイプ間にはエンハンサー活性に有意な差がなかった。 一方、8アリルにおいて例外が存在し、ABOInt1*03がB遺伝子と、ABOInt1*04がO遺伝子と、ABOInt1*05がA遺伝子、ABOInt1*06がA遺伝子とリンクしたアリルが見出され、いずれもAやB遺伝子とリンクしたアリルであることが直接証明された。ABO遺伝子のイントロン6或いはエキソン7中で組み換えが生じた事例は既に報告されており、ABOInt1*06がA遺伝子とリンクしたアリルは、組み換えにより生じたと推測され、他の5例も組み換えにより生じた可能性が考えられた。
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Research Products
(19 results)
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[Journal Article] A 3.0-kb deletion including an erythroid cell-specific regulatory element in intron 1 of the ABO blood group gene in an individual with the Bm phenotype.2015
Author(s)
Sano R, Kuboya E, Nakajima T, Takahashi Y, Takahashi K, Kubo R, Kominato Y, Takeshita H, Yamao H, Kishida T, Isa K, Ogasawara K, Uchikawa M.
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Journal Title
Vox Sang.
Volume: 108
Pages: 310-313.
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Blood group B gene is barely expressed in in vitro erythroid culture of Bm-derived CD34+ cells without an erythroid cell-specific regulatory element.2015
Author(s)
Sano R, Nogawa M, Nakajima T, Takahashi Y, Takahashi K, Kubo R, Kominato Y, Yokohama A, Tsukada J, Yamao H, Kishida T, Ogasawara K, Uchikawa M.
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Journal Title
Vox Sang.
Volume: 108
Pages: 302-309
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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