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2013 Fiscal Year Research-status Report

指紋の総隆線数に関与する遺伝子多型同定を目的とした2つのアプローチ

Research Project

Project/Area Number 25460881
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

副島 美貴子  久留米大学, 医学部, 講師 (80279140)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 神田 芳郎  久留米大学, 医学部, 教授 (90231307)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsゲノムワイド多型解析 / 指紋 / 隆線数 / 多因子遺伝
Research Abstract

ヒトの指紋は現在でもなお最も有用な個人識別ツールの一つである。指紋の総隆線数には紋のパターンと同様個人差があり、従来より多因子遺伝形質であるとされてきた。
本研究計画では、総隆線数の決定に関与する遺伝子多型を同定することを目的とし、この目的が達成されれば、遺伝学的な知見の蓄積のみならず、形態としての指紋が採取できない身元不明者の身元確認等に貢献することが可能になると考えられる。研究計画の初年度にあたる当該年度では、目的達成のために、研究開始時既におこなっていた、ランダムな個体からなる同一集団中での、総隆線数の多いグループと少ないグループの2群についてのDNAマイクロアレイ解析の比較検討により得られた、総隆線数の決定に関与する可能性のある一塩基多型群(SNPs)をターゲットとし、当該集団におけるマイクロアレイ解析非対象検体(中くらいの総隆線数保有者)について、TaqMan probe法に基づくリアルタイムPCRを実施し各多型について遺伝子型判定をおこなった。
これらの決定した遺伝子型に、マイクロアレイ解析対象サンプル(極端な総隆線数保有サンプル)の情報を加えた集団全体のデータについて、各対立遺伝子の遺伝的性質として、①アディティブモデル、②優性モデルの、2つのモデルを想定し、ソフトウェアを用い、それぞれの遺伝子多型と総隆線数間の関連解析をおこなった。
しかしながら現在までに統計的に有意なSNPsを検出できていない。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

当初の予定としては、可能であれば25年度中に候補遺伝子群のうち少なくとも一部は絞り込みたいと考えていたが、その段階に至っていないため。

Strategy for Future Research Activity

今後は、2つのアプローチ法のうち、先天性無指紋症候群、ネーゲリ症候群、網状色素性皮膚症等の、指紋に異常を呈する疾患について、現在までに報告のある原因遺伝子の多型について、データベースを活用することにより多型を探索し解析を続け、候補遺伝子多型を絞り込みたいと考えている。候補遺伝子多型を同定できたら、より感度の度合いの大きいハプロタイプを推定する。さらに、各多型について、ソフトウェアを用い、機能を類推し、それぞれの予想された機能を検出するためのシステムを構築し多型による機能差を調べる。

  • Research Products

    (7 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Genetic factors associated with serum haptoglobin level in a Japanese population.2014

    • Author(s)
      Soejima M, Sagata N, Komatsu N, Sasada T, Kawaguchi A, Itoh K, Koda Y.
    • Journal Title

      Clin Chim Acta.

      Volume: 433 Pages: 54-57

    • DOI

      10.1016/j.cca.2014.02.029

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evaluation of point-of-care testing of C-reactive protein in forensic autopsy cases.2014

    • Author(s)
      Soejima M, Koda Y.
    • Journal Title

      Forensic Sci Int.

      Volume: 237 Pages: 27-29

    • DOI

      10.1016/j.forsciint.2014.01.008

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 血清ハプトグロビン(HP)濃度に影響する遺伝子多型が形成するハプロタイプの集団間差2013

    • Author(s)
      副島美貴子、神田芳郎
    • Organizer
      日本DNA多型学会第22回学術集会
    • Place of Presentation
      仙台市戦災復興記念館(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      20131120-20131122
  • [Presentation] 簡易C反応性蛋白検査キットの有用性の検討2013

    • Author(s)
      副島美貴子、神田芳郎
    • Organizer
      第63回日本法医学会学術九州地方集会
    • Place of Presentation
      九州大学 コラボステーションI(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      20131018-20131019
  • [Presentation] 日本人集団におけるハプトグロビン(HP)遺伝子多型と血清HP濃度の関連2013

    • Author(s)
      副島美貴子、神田芳郎
    • Organizer
      第97次日本法医学会総会
    • Place of Presentation
      ロイトン札幌(北海道札幌市)
    • Year and Date
      20130626-20130628
  • [Book] DNA多型(日本DNA多型学会編)2013

    • Author(s)
      神田芳郎,副島美貴子: FUT2融合遺伝子(sefus)スクリーニング法による新規ハイブリッドアリルの同定
    • Total Pages
      305
    • Publisher
      東洋書店
  • [Remarks] 久留米大学医学部法医学・人類遺伝学講座

    • URL

      http://www.med.kurume-u.ac.jp/med/foren/

URL: 

Published: 2015-05-28  

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