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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Functional analysis of large intergenic non-coding RNAs regulated by p53 in cancers of digestive organs

Research Project

Project/Area Number 25460929
Research InstitutionSapporo Medical University

Principal Investigator

井戸川 雅史  札幌医科大学, 医学部, 講師 (00404749)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2017-03-31
Keywordsp53 / lincRNA / 転写 / アポトーシス / 癌 / ChIP-seq / lncRNA / non-coding RNA
Outline of Annual Research Achievements

In silico p53結合配列解析とクロマチン免疫沈降産物の次世代シーケンサー解析(ChIP-seq)により絞り込まれたゲノム上のp53結合領域近傍に存在する約150のlincRNA(大型遺伝子介在非コードRNA)の内,22のlincRNAがp53ファミリーにより発現誘導され,これらのlincRNAのp53結合部位配列を用いたレポーターアッセイを行ったところp53活性化により転写活性の上昇が認められた.これらの結果から,複数のlincRNAがp53ファミリーの標的となっていることが明らかとなった.
これらのlincRNAの中で,3つのp53ファミリーすべてで強く発現誘導が認められる3つのlincRNAについて肝癌細胞Hep3Bおよび大腸癌細胞DLD1においてsiRNAを用いたノックダウンを行い,アデノウイルスによりp53導入時のアポトーシス誘導能をフローサイトメトリー,Capspase-3活性の定量およびウエスタンブロットによるPARP-1の断片化を用いて測定した.その結果,2つのlincRNAではそのノックダウンによりp53によるアポトーシス誘導が減弱した一方,もう1つのlincRNAではアポトーシスの増強が認められた.更にp53正常型である大腸癌細胞RKOおよび骨肉腫細胞U2OSにおいてnutlin-3a処理により内因性p53を活性化した系においても,同様の結果が得られた.
これらのlincRNAがどのように機能してp53誘導アポトーシスに影響を与えているのかを調べるため,lincRNAをノックダウンしnutlin-3a処理したHep3B細胞において,マイクロアレイを用いて網羅的な発現解析を行ったところ,nutlin-3aによるp53活性化で発現がlincRNA依存的に誘導される遺伝子クラスターが見出された.

  • Research Products

    (4 results)

All 2017 2016

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Long non-coding RNA NEAT1 is a transcriptional target of p53 and modulates p53-induced transactivation and tumor-suppressor function.2017

    • Author(s)
      Idogawa M, Ohashi T, Sasaki Y, Nakase H, Tokino T.
    • Journal Title

      International Journal of Cancer

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1002/ijc.30689

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] p53 mediates the suppression of cancer cell invasion by inducing LIMA1/EPLIN.2017

    • Author(s)
      Ohashi T, Idogawa M, Sasaki Y, Tokino T.
    • Journal Title

      Cancer Letters

      Volume: 390 Pages: 58-66

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2016.12.034.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification and characterization of the intercellular adhesion molecule-2 gene as a novel p53 target.2016

    • Author(s)
      Sasaki Y, Tamura M, Takeda K, Ogi K, Nakagaki T, Koyama R, Idogawa M, Hiratsuka H, Tokino T.
    • Journal Title

      Oncotarget

      Volume: 7 Pages: 61426-61473

    • DOI

      10.18632/oncotarget.11366

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 癌におけるp53および長鎖非コードRNA(lncRNA)による転写ネットワーク解析2016

    • Author(s)
      井戸川 雅史
    • Organizer
      第75回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2016-10-08 – 2016-10-08

URL: 

Published: 2018-01-16  

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