2014 Fiscal Year Research-status Report
全エクソンシーケンスによる非特異性多発性小腸潰瘍症の原因遺伝子同定
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25460953
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
梅野 淳嗣 九州大学, 大学病院, 助教 (70621704)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松本 主之 九州大学, 医学(系)研究科(研究院), 研究員 (10278955)
森山 智彦 九州大学, 大学病院, 助教 (20452758)
江崎 幹宏 九州大学, 大学病院, 講師 (50335957)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 非特異性多発性小腸潰瘍症 / エクソームシークエンス / 次世代シーケンサー / 常染色体劣性遺伝 / 小腸疾患 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
非特異性多発性小腸潰瘍症(CNSU)の15家系24例（患者16例、非発症者8例）から書面による同意が得られた。4家系6症例（CNSU患者5例、非発症者1例）においてエクソームシークエンスを行った。血族結婚を有する3家系3症例において、dbSNP135に未登録の非同義的も
しくはスプライス部位の変異がホモ型にみられる遺伝子は9個のみであった。同胞発症である2症例においても同9遺伝子内に変異を認めた。非発症者1例の情報で候補遺伝子を除外したところ、遺伝子Aのみに絞り込まれた。日本人コントロール検体747例では、3例においてエクソン7のスプライス部位の変異をヘテロ型で有していたが、他3ヶ所の変異は全くみられなかった。他CNSU患者11例について同遺伝子内のエクソン領域の変異を検索したところ、12例中11例にタンパクの機能変化をきたしうる遺伝子変異をホモ変異もしくはコンパウンドヘテロ変異として有していた。以上よりCNSUの原因遺伝子として遺伝子Aを同定した。クローン病患者603例について同遺伝子変異の有無を検索したところ、2例にコンパウンドヘテロ変異を認め、臨床情報はCNSUに矛盾しないものであった。上記結果について第22回 日本消化器関連学会週間（第56回日本消化器病学会大会、第88回日本消化器内視鏡学会総会）で発表した。論文作成の上、現在投稿中である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
エクソームシークエンスを用いた解析から非特異性多発性小腸潰瘍症の原因遺伝子を同定することができており、結果を学会で発表済みである。また論文は投稿中である。
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| Strategy for Future Research Activity |
全国の施設から本症が疑われる患者のゲノム検体を収集し、遺伝子解析を行う。また遺伝学的に確定診断できた症例においてその臨床徴候をより詳細に調査し、本症の臨床像を明らかにする。
また同定した原因遺伝子をノックダウンしたモデルマウスを作成し、小腸潰瘍発症における機序を明らかにする。
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| Causes of Carryover |
平成25年度にエクソームシークエンスで原因遺伝子候補の絞り込みを行い、全ての候補遺伝子についてダイレクトシーケンスを用いて再現性を確認する予定としていたが、候補遺伝子を1個に絞り込むことが可能であった。同遺伝子内の変異の一部は制限酵素を用いてタイピングすることが可能であり、クローン病検体を用いたジェノタイピングも比較的安価で可能だったため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
全国の施設から本症が疑われる症例のゲノム検体を収集し、今回同定した遺伝子内の全エクソンについてダイレクトシーケンスを行い、変異の検索を行う。
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