2015 Fiscal Year Annual Research Report
異所性脂肪蓄積の遺伝素因と環境因子の検索と前向き追跡調査での検証
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25461343
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
堀田 紀久子 大阪大学, 医学部附属病院, 講師 (30360639)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
北本 卓也 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (10456882) [Withdrawn]
北本 綾 浜松医科大学, 学内共同利用施設等, その他 (30381627) [Withdrawn]
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 非アルコール性脂肪肝疾患 / RNAシークエンス / メチル化DNA |
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| Outline of Annual Research Achievements |
非アルコール性脂肪肝疾患（NAFLD）の肝臓生検検体から抽出したRNAを次世代シークエンサーにて解析した。繊維化の進行度で軽症NAFLDと重症NAFLDの2群に分けて解析した。具体的にはRNAシークエンスのFastqファイルをFastXによりアダプター配列除去後、TopHatにてマッピングを行い、Cufflinksにて発現変動遺伝子の同定を行った。その結果をCummeRbundにて全体的な解析を行った。発現変動遺伝子は約2400存在していた。これらの遺伝子について、KEGG、Go Ontology、DAVIDによるpathway解析を行った。さらにWGCNAによる分子ネットワーク解析を行った。
昨年度に行った48人に加えて12人の全ゲノムのメチル化解析をイルミナ社HumanMethylation450 BeadChipを用いて行った。56症例はRNAシークエンス解析に用いたのと同じ肝生検組織から抽出した肝臓ゲノムDNAを用いた。約3000ヵ所のCpGサイトで軽症、重症NAFLD群間で有意差を認めた。
NAFLD進行に重要な因子である血中アディポネクチン値がCDH13遺伝子の多型と相関することを報告した。内臓脂肪量と独立にCDH13遺伝子多型は血中アディポネクチンと関連していた。CDH13遺伝子多型は内臓脂肪量、血中アディポネクチン値と共にメタボリックシンドローム発症に重要な因子であることを明らかにした。
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Research Products
(8 results)
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[Journal Article] CDH13 Polymorphisms are Associated with Adiponectin Levels and Metabolic Syndrome Traits Independently of Visceral Fat Mass2016
Author(s)
Kitamoto A, Kitamoto T, Nakamura T, Matsuo T, Nakata Y, Hyogo H, Ochi H, Kamohara S, Miyatake N, Kotani K, Mineo I, Wada J, Ogawa Y, Yoneda M, Nakajima A, Funahashi T, Miyazaki S, Tokunaga K, Masuzaki H, Ueno T, Chayama K, Hamaguchi K, Yamada K, Hanafusa T, Oikawa S, Sakata T, Tanaka K, Matsuzawa Y, Hotta K.
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Journal Title
J Atheroscler Thromb
Volume: 23
Pages: 309-319
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Influence of the rs738409 polymorphism in patatin-like phospholipase 3 on the treatment efficacy of non-alcoholic fatty liver disease with type 2 diabetes mellitus.2016
Author(s)
Kan H, Hyogo H, Ochi H, Hotta K, Fukuhara T, Kobayashi T, Naeshiro N, Honda Y, Kawaoka T, Tsuge M, Hiramatsu A, Imamura M, Kawakami Y, Aikata H, Chayama K
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Journal Title
Hepatol Res
Volume: 46
Pages: 146-153
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] The characteristics of non-obese NAFLD: Effect of genetic and environmental factors.2016
Author(s)
Honda Y, Yoneda M, Kessoku T, Ogawa Y, Tomeno W, Imajo K, Mawatari H, Fujita K, Hyogo H, Ueno T, Chayama K, Saito S, Nakajima A, Hotta K
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Journal Title
Hepatol Res
Volume: -
Pages: -
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] ADIPOQ polymorphisms are associated with insulin resistance in Japanese women.2015
Author(s)
Kitamoto A, Kitamoto T, So R, Matsuo T, Nakata Y, Hyogo H, Ochi H, Nakamura T, Kamohara S, Miyatake N, Kotani K, Mineo I, Wada J, Ogawa Y, Yoneda M, Nakajima A, Funahashi T, Miyazaki S, Tokunaga K, Masuzaki H, Ueno T, Chayama K, Hamaguchi K, Yamada K, Hanafusa T, Oikawa S, Sakata T, Tanaka K, Matsuzawa Y, Hotta K
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Journal Title
Endocr J
Volume: 62
Pages: 513-521
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Targeted-bisulfite sequence analysis of the methylation of CpG islands in genes encoding PNPLA3, SAMM50, and PARVB of patients with non-alcoholic fatty liver disease.2015
Author(s)
Kitamoto T, Kitamoto A, Ogawa Y, Honda Y, Imajo K, Saito S, Yoneda M, Nakamura T, Nakajima A, Hotta K
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Journal Title
J Hepatol
Volume: 63
Pages: 494-502
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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