2013 Fiscal Year Research-status Report
ゲノム解析による円形脱毛症疾患感受性遺伝子同定の試み(第2段)
Project/Area Number |
25461712
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
|
Research Institution | Juntendo University |
Principal Investigator |
池田 志斈 順天堂大学, 医学部, 教授 (40193198)
|
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
岡 晃 東海大学, 付置研究所, 講師 (80384866)
|
Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
|
Keywords | alopecia areata / GWAS / gene |
Research Abstract |
Microsatellite markersならびにsingle nucleotide variantsを用いたGWASにより、円形脱毛症(AA)感受性遺伝子の局在をHLA-C遺伝子座の近隣に同定した。その後詳細なhaplotype解析を行い、疾患感受性遺伝子が存在するhaplotypeを同定した(OR: 3.75)。その後疾患感受性haplotype依存的にHLA-C領域を含む2 megabase領域を次世代sequencerで解析したところ、特に汎発性AAの患者において、ある遺伝子のamino酸置換を伴う遺伝子変異が同定された。この遺伝子は、毛髪関連遺伝子の発現調整をしていると報告されており、またこのamino酸置換を伴う遺伝子変異により、本遺伝子産物の機能に重要である構造に変化が生じることが明らかとなった。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
HLA領域においてAAの疾患感受性遺伝子を、疾患感受性haplotype依存的次世代sequencer解析で同定できた。これは、自己免疫性疾患のGWASにおいて、世界で初めてと思われる。
|
Strategy for Future Research Activity |
今後は本遺伝子の毛髪特異的遺伝子変異をマウスに導入する予定である。 今後はAAの連鎖解析でその局在が予想されている領域についても、Microsatellite markersならびにsingle nucleotide variantsを用いたGWAS解析ならびに疾患感受性haplotype依存的次世代sequencer解析を行い、amino酸置換を伴う遺伝子変異の同定を試みる。
|
Research Products
(2 results)