• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2013 Fiscal Year Research-status Report

ゲノム解析による円形脱毛症疾患感受性遺伝子同定の試み(第2段)

Research Project

Project/Area Number 25461712
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Research InstitutionJuntendo University

Principal Investigator

池田 志斈  順天堂大学, 医学部, 教授 (40193198)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡 晃  東海大学, 付置研究所, 講師 (80384866)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsalopecia areata / GWAS / gene
Research Abstract

Microsatellite markersならびにsingle nucleotide variantsを用いたGWASにより、円形脱毛症(AA)感受性遺伝子の局在をHLA-C遺伝子座の近隣に同定した。その後詳細なhaplotype解析を行い、疾患感受性遺伝子が存在するhaplotypeを同定した(OR: 3.75)。その後疾患感受性haplotype依存的にHLA-C領域を含む2 megabase領域を次世代sequencerで解析したところ、特に汎発性AAの患者において、ある遺伝子のamino酸置換を伴う遺伝子変異が同定された。この遺伝子は、毛髪関連遺伝子の発現調整をしていると報告されており、またこのamino酸置換を伴う遺伝子変異により、本遺伝子産物の機能に重要である構造に変化が生じることが明らかとなった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

HLA領域においてAAの疾患感受性遺伝子を、疾患感受性haplotype依存的次世代sequencer解析で同定できた。これは、自己免疫性疾患のGWASにおいて、世界で初めてと思われる。

Strategy for Future Research Activity

今後は本遺伝子の毛髪特異的遺伝子変異をマウスに導入する予定である。
今後はAAの連鎖解析でその局在が予想されている領域についても、Microsatellite markersならびにsingle nucleotide variantsを用いたGWAS解析ならびに疾患感受性haplotype依存的次世代sequencer解析を行い、amino酸置換を伴う遺伝子変異の同定を試みる。

  • Research Products

    (2 results)

All 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Association analysis of the HLA-C gene in Japanese alopecia areata.2013

    • Author(s)
      Haida Y, Ikeda S, Takagi A, Komiyama E, Mabuchi T, Ozawa A, Kulski JK, Inoko H, Oka A.
    • Journal Title

      Immunogenetics

      Volume: 65 Pages: 553-7

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] An association study of alopecia areata using microsatellite markers within major histocompatibility complex2013

    • Author(s)
      Ikeda S, Takagi A, Komiyama E, et al
    • Organizer
      World Congress for Hair Research
    • Place of Presentation
      Edinbough, UK
    • Year and Date
      20130604-20130606

URL: 

Published: 2015-05-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi