2015 Fiscal Year Annual Research Report
次世代シークエンスによる膠芽腫の遺伝子変異スクリーニングと予後因子の特定
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25462283
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
市村 幸一 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (40231146)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 膠芽腫 / グリオーマ / 次世代シークエンス / TERT / Ion Torrent / 分子分類 / 遺伝子診断 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
平成27年度は成人グリオーマの大規模コホートに対する分子分類をvalidationする目的で193症例の膠芽腫を集め、IDH/TERT変異, MGMTメチル化などを調べた。最終的には両コホート合わせて976例に対して解析を行った。その結果成人グリオーマはIDHとTERT変異により4型に分類することが可能で、IDH変異・TERT変異を持つGroup Aは最も予後が良く、ほとんどの例で1p19q欠失を有する乏突起細胞腫であった。IDH変異のみを有するGroup Bは中間の予後を示し、星細胞腫が多かった。TERT変異のみを持つGroup Dは最も予後不良でほぼ全例が膠芽腫であり、IDH/TERT変異を持たないGroup Cは様々な組織型から構成された。標準治療を受けた膠芽腫の中ではTERT変異とMGMTメチル化の間に交絡作用を認め、最も予後が不良なのはTERT変異とMGMT非メチル化を示す膠芽腫であり、次いでTERT野生型・MGMT非メチル化膠芽腫、TERT野生型・MGMTメチル化膠芽腫、TERT変異・MGMTメチル化膠芽腫の順に予後が良かった。以上のようにTERT野生型MGMTメチル化の予後に対する影響はTERT変異の有無に左右されることが示された。さらにIon Torrentを用いたGlioma Mutation Screening Panel (GMSP)を用いて126例について解析を行った。93遺伝子を91%カバーする5442のampliconのうち97.4%において100以上のリード数が得られ（平均877）、またIDH1などいくつか既知の変異が検出され、その有用性が確認された。Group Cの腫瘍についてはPDGFRAやFGFR1といった膜受容体チロシンキナーゼの変異が認められ、GMSPによる変異スクリーニングが新たな治療標的の検出に有用であることが示された。
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Research Products
(7 results)
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[Journal Article] Glioblastomas with IDH1/2 mutations have a short clinical history and have a favourable clinical outcome2016
Author(s)
Ohno M, Narita Y, Miyakita Y, Matsushita Y, Arita H, Yonezawa M, Yoshida A, Fukushima S, Takami H, Ichimura K, Shibui S
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Journal Title
Japanese Journal of Clinical Oncology
Volume: 46
Pages: 31-39
DOI
Peer Reviewed
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