2013 Fiscal Year Research-status Report
卵巣癌における“hot spot”変異解析に基づく新規薬剤の探索
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25462590
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
松村 謙臣 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 (20452336)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 誠一 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 研究員 (10334814)
小西 郁生 京都大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (90192062)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 卵巣癌 / 遺伝子 |
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| Research Abstract |
１）卵巣癌組織の凍結組織のエクソームシークエンシングを２８サンプル行い、現在解析中である。
２）卵巣癌組織１２０サンプルについて、TP53, PIK3CA, pERK, pAKT, ER, HNF1B, KI67、さらにARID1AをはじめとするSWI/SNF complexの７タンパク質の免疫組織染色を行い、SWI/SNF complexの発現が卵巣明細胞腺癌の予後因子になることを見いだした。
３）shRNAライブラリーを用いて、functional genomicsスクリーニングを行い、ABHD2の発現低下が卵巣癌のanoikis抵抗性に関与することを見いだした。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
卵巣癌の遺伝子変異の検出を目的として、もともとは遺伝子を絞ってターゲットシークエンシングを行う予定であったが、エクソームシークエンシングの価格の低下もあり、エクソームシークエンシングを行った。すると、非常にそのデータのクオリティーがよく、免疫組織染色の結果とも合致していることがわかった。
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| Strategy for Future Research Activity |
あと２０サンプルほどエクソームシークエンシングを追加し、ゲノムワイドな遺伝子変異解析を行う予定としている。また、shRNAライブラリーによって見いだしたanoikis関連遺伝子であるABHD2については、さらに機能解析を進めて行く方針としている。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
エクソームシークエンシングの価格低下により、当初予定していたターゲットシークエンシングを中止してエクソームシークエンシングを行うこととした。そのため、ターゲットシークエンシングにかかる予定であった諸費用を、翌年度に繰り越すこととなった。
エクソームシークエンシングを追加し、ゲノムワイドな遺伝子変異解析を行う予定。
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[Journal Article] An EMT spectrum defines an anoikis-resistant and spheroidogenic intermediate mesenchymal state that is sensitive to e-cadherin restoration by a src-kinase inhibitor, saracatinib (AZD0530).2013
Author(s)
Huang RY, Wong MK, Tan TZ, Kuay KT, Ng AH, Chung VY, Chu YS, Matsumura N, Lai HC, Lee YF, Sim WJ, Chai C, Pietschmann E, Mori S, Low JJ, Choolani M, Thiery JP
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Journal Title
Cell Death Dis.
Volume: 4
Pages: e915
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Functional genomics identifies five distinct molecular subtypes with clinical relevance and pathways for growth control in epithelial ovarian cancer.2013
Author(s)
Tan TZ, Miow QH, Huang RY, Wong MK, Ye J, Lau JA, Wu MC, Bin Abdul Hadi LH, Soong R, Choolani M, Davidson B, Nesland JM, Wang LZ, Matsumura N, Mandai M, Konishi I, Goh BC, Chang JT, Thiery JP, Mori S.
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Journal Title
EMBO Mol Med.
Volume: 5
Pages: 983-998
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Utilization of genomic signatures to identify high efficacy candidate drugs for chemo-refractory endometrial cancers.2013
Author(s)
Kharma B, Baba T, Mandai M, Matsumura N, Murphy SK, Kang HS, Yamanoi K, Hamanishi J, Yamaguchi K, Yoshioka Y, Konishi I.
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Journal Title
Int J Cancer.
Volume: 133
Pages: 2234-2244
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] Role of SWI/SNF complex in Clear Cell Carcinoma of the ovary (CCC)2014
Author(s)
Ken Yamaguchi, Hisham Abou-Taleb, Noriomi Matsumura, Yasuaki Amano, Koji Yamanoi, Ryusuke Murakami, Tsukasa Baba, Yumiko Yoshioka, Junzo Hamanishi, Masaki Mandai, Ikuo Konishi
Organizer
第66回日本産科婦人科学会学術集会
Place of Presentation
東京国際フォーラム
Year and Date
20140418-20140420
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