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2014 Fiscal Year Annual Research Report

海綿二次代謝産物生産を担う共生微生物の同定とゲノム解析

Research Project

Project/Area Number 25560399
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

脇本 敏幸  東京大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (70363900)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords海綿共生微生物 / Theonella / Discodermia
Outline of Annual Research Achievements

本研究では伊豆半島、伊豆諸島沿岸に生息するTheonellidae科の海綿類、特にTheonella属およびDiscodermia属について生物活性物質の生産を担う共生微生物を特定し、そのゲノム解析を試みた。八丈島産Theonella swinhoeiに関しては細胞分画を駆使して二次代謝産物の生産を担う海綿共生微生物の探索を進めた結果、光学顕微鏡下観察可能なフィラメント状バクテリアを候補微生物として単離した。ドラフトゲノム解析の結果、このバクテリアがTheonella swinhoei由来の生物活性物質の生合成遺伝子をコードしていることが明らかになった。この新規バクテリアをEntotheonella factorとして同定し、新たにTectomicrobia門を提唱している。
さらにDiscodermia属の海綿類においても同様のフィラメント状バクテリアが観察されており、伊豆半島産Discodermia kiiensisを採集後、密度勾配遠心法を用いて細胞分画し、同バクテリアを精製し、次世代シークエンサーを用いたゲノム解析に供した。その結果、やはりペプチド、ポリケタイドなどの数多くの二次代謝産物の生合成遺伝子クラスターをコードしていることが明らかになった。代謝産物の不明な遺伝子クラスターも複数存在することから、メタゲノムマイニングによって代謝産物の探索を行った。その結果、新規リポペプチド、lipodiscamide類の単離、構造決定に成功した。このようにTheonellidae科の海綿類においてはEntotheonella属の共生微生物が物質生産を担っていることが明らかとなり、多様な海綿由来生物活性物質の生産機構の解析へ向け、重要な糸口を掴む事ができた。

  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 7 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Calyculin biogenesis from a pyrophosphate protoxin produced by a sponge symbiont2014

    • Author(s)
      T. Wakimoto, Y. Egami, Y. Nakashima, Y. Wakimoto, T. Mori, T. Awakawa, T. Ito, H. Kenmoku, Y. Asakawa, J. Piel, I. Abe
    • Journal Title

      Nature Chem. Biol.

      Volume: 10 Pages: 648-655

    • DOI

      10.1038/nchembio.1573

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Complete biosynthetic pathway of anditomin: nature's sophisticated synthetic route to a complex fungal meroterpenoid.2014

    • Author(s)
      Y. Matsuda, T. Wakimoto, T. Mori, T. Awakawa, I. Abe
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 136 Pages: 15326-15336

    • DOI

      10.1021/ja508127q

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A methyltransferase initiates terpene cyclization in teleocidin B biosynthesis2014

    • Author(s)
      T. Awakawa, L. Zhang, T. Wakimoto, S. Hoshino, T. Mori, T. Ito, J. Ishikawa, M. E. Tanner, I. Abe
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 136 Pages: 9910-9913

    • DOI

      10.1021/ja505224r

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Phosphocalyculin C as a pyrophosphate protoxin of calyculin C in the marine sponge Discodermia calyx2014

    • Author(s)
      Y. Egami, T. Wakimoto, I. Abe
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 24 Pages: 5150-5153

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2014.10.002

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Arcyriaflavin E, a new cytotoxic indolocarbazole alkaloid isolated by combined-culture of mycolic acid-containing bacteria and Streptomyces cinnamoneus NBRC 138232014

    • Author(s)
      S. Hoshino, L. Zhang, T. Awakawa, T. Wakimoto, H. Onaka, I. Abe
    • Journal Title

      J. Antibiot.

      Volume: 67 Pages: 1-3

    • DOI

      10.1038/ja.2014.147

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Three acyltetronic acid derivatives: noncanonical cryptic polyketides from Aspergillus niger identified by genome mining2014

    • Author(s)
      X.-L. Yang, T. Awakawa, T. Wakimoto, I. Abe,
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 15 Pages: 1578-1583

    • DOI

      10.1002/cbic.201402172

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Lipodiscamides A-C, new cytotoxic lipopeptides from the marine sponge Discodermia kiiensis2014

    • Author(s)
      K. C. Tan, T. Wakimoto, I. Abe
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 16 Pages: 3256-3259

    • DOI

      10.1021/ol501271v

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] The significance of unstable marine natural products2015

    • Author(s)
      Toshiyuki Wakimoto
    • Organizer
      Marine Biotechnology Seminar
    • Place of Presentation
      Adelaide, Australia
    • Year and Date
      2015-02-09
    • Invited
  • [Presentation] 海綿由来生物活性物質の生合成に関する研究2014

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      日本生薬学会第61年会
    • Place of Presentation
      福岡県福岡市
    • Year and Date
      2014-09-14
    • Invited
  • [Presentation] 多様な天然物を生産する海綿共生バクテリア2014

    • Author(s)
      脇本敏幸
    • Organizer
      静岡大学農学部公開講演会
    • Place of Presentation
      静岡県静岡市
    • Year and Date
      2014-07-14
    • Invited
  • [Book] Handbook of Anticancer Drug from Marine Origin2014

    • Author(s)
      T. Wakimoto, K. C. Tan, H. Tajima, I. Abe
    • Total Pages
      800
    • Publisher
      Springer
  • [Remarks] カイメンを気づかう共生バクテリア ―チョコガタイシカイメンの毒性物質はバクテリアが生産していた―

    • URL

      http://www.u-tokyo.ac.jp/public/public01_260630_02_j.html

  • [Remarks] 海綿動物の化学防御を担う共生細菌

    • URL

      http://first.lifesciencedb.jp/archives/9108

URL: 

Published: 2016-06-01  

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