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2015 Fiscal Year Annual Research Report

SERS_DNAシーケンサの創生

Research Project

Project/Area Number 25600049
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山口 佳則  大阪大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (20386634)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords表面増強ラマン散乱 / DNAシーケンサ / 普及型DNAシーケンサ / ナノ剣山 / マイクロチップ
Outline of Annual Research Achievements

DNAシーケンスによって、感染症の病原菌となる微生物、ウィルスを現場にて特定することは世界中で切望される診断技術です。これまで、DNAシーケンスは十分なサンプルの前処理と研究所に設置された大型の装置を利用して行われてきました。したがって、現場でのDNAシーケンスを達成するには現行の原理技術とは異なった、新規原理からの研究開発が必要です。我々は現場でのDNAシーケンスを達成できる新規技術として、表面増強ラマン散乱による単一分子の測定技術を応用したDNAシーケンサを本研究にて提案しました。
本研究課題では、(1)DNAの伸張について、厚さ方向(Z軸方向)への拡散を数nmに制限された空間にDNAを電気泳動させることと、酢酸を混合した緩衝液を使用することで、可能であることが分かりました。一方では、厚さ方向への拡散を数nmに制限する空間にDNAを直接に導入することが困難でした。さらに(2)露出したDNA塩基について単一分子での表面増強ラマン散乱を測定するために単一分子感度を達成できるプラズモン電場を発生することのできるナノ剣山を製作しました。ナノ剣山は針自身の先が100nmの平面で、平面の下部がさらに細くエッチングされた絶壁構造で、銀蒸着することで、表面プラズモンを強く発生できると同時に絶壁構造にDNA分子が絡み合うことができるデザインにしました。作製したナノ剣山を利用して、DNAのひとつの塩基であるアデニンの分子を測定し、ナノ剣山の絶壁における単一分子の特徴であるブリンキングを計測しました。この結果は、表面増強ラマン散乱をDNAシーケンサの原理技術として利用できる可能性を示したことになります。

  • Research Products

    (7 results)

All 2015 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results,  Open Access: 2 results)

  • [Int'l Joint Research] 華東理工大学/理学研究科(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      華東理工大学/理学研究科
  • [Int'l Joint Research] 上海理工大学/光電信息研究院(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      上海理工大学/光電信息研究院
  • [Journal Article] Electrophoresis of Periodontal Pathogens in Poly (ethyleneoxide) Solutions with Uncoated Capillary2015

    • Author(s)
      Zhenqing Li, Ronglin Yang, Q Wang, Dawei Zhang, Songlin Zhuang, Yoshinori Yamaguchi
    • Journal Title

      Analytical Biochemistry

      Volume: 471 Pages: 70-72

    • DOI

      10.1016/j.ab.2014.11.002

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Polyethylene Oxide (PEO) and Polyethylene Glycol (PEG) Polymer Sieving Matrix for RNA Capillary Electrophoresis2015

    • Author(s)
      Yoshinori Yamaguchi, Zhenqing Li, Xifang Zhu, Chenchen Liu, Dawei Zhang, Xiaoming Dou
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10(6) Pages: e0131265

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0123406

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Analysis of small interfering RNA by capillary electrophoresis in hydroxyethylcellulose solutions2015

    • Author(s)
      Chenchen Liu, Yoshinori Yamaguchi, Xifang Zhu, Zhenqing Li, Yi Ni, Xaoming Dou
    • Journal Title

      Electrophoresis

      Volume: 36 Pages: 1651-1657

    • DOI

      10.1002/elps.201500018

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Time-lapse Raman imaging of osteoblast differentiation2015

    • Author(s)
      Aya Hashimoto, Yoshinori Yamaguchi*, Liang-da Chiu, Chiaki Morimoto, Katsumasa Fujita, Masahide Takedachi, Satoshi Kawata, Shinya Murakami, Eiichi Tamiya
    • Journal Title

      Scientific reports

      Volume: 5 Pages: 12529

    • DOI

      10.1038/srep12529

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Capillary electrophoresis of RNA in hydroxyethylcellulose polymer with various molecular weights2015

    • Author(s)
      Zhenqing Li, Chenchen Liu, Dawei Zhang, Yoshinori Yamaguchi
    • Journal Title

      Journal of Chromatography B

      Volume: 1011 Pages: 114-120

    • DOI

      10.1016/j.jchromb.2015.12.057

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant

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Published: 2017-01-06   Modified: 2022-01-31  

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