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2014 Fiscal Year Annual Research Report

ゲノム損傷部位輸送機構の解明

Research Project

Project/Area Number 25640066
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

田代 聡  広島大学, 原爆放射線医科学研究所, 教授 (20243610)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywords相同組換え / 転写反応 / 細胞核構造
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、「相同組換え修復では、相同部位を損傷部位に近づけるために転写反応が必要である。」という仮説を検証した。このために、1)損傷部位とその相同部位の位置関係の経時的変化、2)DICERやDROSHAなどnon-coding RNAに関わるRNaseの発現抑制によるゲノム損傷部位での相同部位近接への影響を検討した。
平成25年度は、TALEN法やI-Sce1などを用いた特定の染色体部位にDNA損傷を誘導する手法を確立した。平成26年には、切断されたDNA断端をFISH法により可視化することで局在の解析を行った。特に、画像解析を効率的に進めるために、画像取得、解析のプロセスの自動化を進めた。現在、画像データの統計的解析を行っている。また、DNA可視化には、TALEを応用して特定DNA領域を蛍光標識する実験系の開発を試みたが、シグナル・ノイズ比が低く、特異的なシグナルを検出することが困難であった。このため、米国NIHTom MIsteli博士から、切断部位の蛍光標識が可能な細胞の供与を受けて、現在解析を進めている。 次世代シーケンサーを用いた3C法による相同部位近接の検討は、現在解析を進めている。

  • Research Products

    (10 results)

All 2015 2014

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results,  Open Access: 3 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Regulation of homologous recombinational repair by lain B1 in radiation-induced DNA damage2015

    • Author(s)
      Liu NA
    • Journal Title

      FASEB J

      Volume: 29 Pages: 1-13

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structural Basis for Ubiquitin Recognition by Ubiquitin-Binding Zinc Finger of FAAP20.2015

    • Author(s)
      Toma A
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: 1-15

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0120887.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reorganization of damaged chromatin by the exchange of histone variant H2A.Z-2.2014

    • Author(s)
      Nishibuchi I
    • Journal Title

      Int J Radiat Oncol Biol Phys.

      Volume: 89 Pages: 736-744

    • DOI

      10.1016/j.ijrobp.2014.03.031.

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Smoking cessation reverses DNA double-strand breaks in human mononuclear cells.2014

    • Author(s)
      Ishida M
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 9 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0103993.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-order chromatin containing histone H1.2014

    • Author(s)
      Machida S
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 4 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/srep04863.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 放射線によるゲノム損傷と修復2014

    • Author(s)
      田代 聡
    • Organizer
      広島医学会総会シンポジウム
    • Place of Presentation
      広島医師会館、広島市
    • Year and Date
      2014-11-09 – 2014-11-09
  • [Presentation] 染色体ストレス応答の再構成と複合システムとしての理解2014

    • Author(s)
      田代 聡
    • Organizer
      第87回 日本生化学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都国際会議場、京都市
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-15
  • [Presentation] 医療放射線被ばくによるゲノム損傷評価法の確立2014

    • Author(s)
      田代 聡
    • Organizer
      日本放射線影響学会 第57回大会 シンポジウム
    • Place of Presentation
      鹿児島県民交流センター、鹿児島市
    • Year and Date
      2014-10-03 – 2014-10-03
  • [Presentation] 相同組換え修復における損傷クロマチン動態2014

    • Author(s)
      田代 聡
    • Organizer
      第52回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌市
    • Year and Date
      2014-09-26 – 2014-09-26
    • Invited
  • [Presentation] Nuclear topography of homologous recombinational repairp2014

    • Author(s)
      Tashiro S
    • Organizer
      Cold Spring Harbor meeting
    • Place of Presentation
      ニューヨーク(アメリカ)
    • Year and Date
      2014-08-23 – 2014-08-26

URL: 

Published: 2016-06-01  

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