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2013 Fiscal Year Research-status Report

プロテインキナーゼC全長の再構成と構造解析による活性制御機構の解明

Research Project

Project/Area Number 25650025
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Research InstitutionTokyo Metropolitan University

Principal Investigator

三島 正規  首都大学東京, 理工学研究科, 准教授 (70346310)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
KeywordsPKC / NMR / 活性制御
Research Abstract

Protein kinase C(PKC)は、連続した2つのC1ドメインであるC1AおよびC1B ドメイン(DAG結合ドメイン)と、C2ドメイン(Ca2+、IP3結合ドメイン)、キナーゼドメインからなる。PKCの機能や活性化を理解するためには、全長のタンパク質を用いて、各ドメインが本来の相互作用をしている自己阻害状態の構造的知見が、まず必要である。さらにセカンドメッセンジャー等により活性型となり、膜と相互作用した活性化型の構造も重要である。
従来、PKCaのC1Aドメインは、大腸菌の発現系では可溶化せず、大量調製が困難であった。申請者は、C1Aのシステイン残基と疎水性残基の二重変異体を作製することで大腸菌からのC1Aドメインの大量調製が可能な系を構築した。これを用いて同位体標識を行って、現在までにNMR信号の帰属と立体構造を決定した。また調製したC1ドメインとC2ドメインをライゲーションするための予備実験を行った。連結によく利用されるsortase で、収量は極めて低いもののライゲーション産物を得ることが出来た。またキナーゼドメインの調製のため、カイコ個体を用いた発現系を導入し、安価で高効率なキナーゼドメインの発現・調製に成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1)大量調製が困難であったPKCaのC1Aドメインは、C1Aのシステイン残基と疎水性残基の二重変異体を作製することで大腸菌からのC1Aドメインの大量調製が可能な系を構築した。これを用いて同位体標識を行って、現在までにNMR信号の帰属と立体構造を決定した。
(2)sortase を用いて、C1ドメインとC2ドメインをライゲーションするための予備実験を行った。収量は極めて低いもののライゲーション産物を得ることが出来た。
(3キナーゼドメインの調製は一般に高等な生物の発現系が必要なことから、細胞培養ではコストがかかる。そこで飼育の安価なカイコ個体を用いた発現系を導入し、安価かつ高効率なキナーゼドメインの試料調製に成功した。
(1)-(3)のような進展があることから、おおむね、順調に推移しているといえる。

Strategy for Future Research Activity

全長のタンパク質を再構成する際、ドメインごとに安定同位体標識やスピンラベルを行うことで、曖昧さのない帰属が可能である。従来のNMR測定法では、分子量等の問題により解析が困難であるので、タンパク質の重水素化とメチルTROSYを用いて先鋭化させたNMR信号をプローブに、スピンラベルからのPREを観測することで、立体構造情報を取得する。構造計算ではドメイン単体の構造をrigid bodyとして扱う。またSAXSを併用することで、SAXSからもドメイン間の相対配置に関する情報を取得する。これらの情報を統合して、自己阻害型のPKCの立体構造と、PKCの足場としてナノディスクにセカンドメッセンジャーを埋め込んだものを用いて、活性型の構造(ドメイン配置)を同様に決定する。

  • Research Products

    (12 results)

All 2014 2013

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (5 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Structural insights into the recruitment of SMRT by the corepressor SHARP under phosphorylative regulation.2014

    • Author(s)
      Mikami S, Kanaba T, Takizawa N, Kobayashi A, Maesaki R, Fujiwara T, Ito Y, Mishima M.
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 22 Pages: 35-46

    • DOI

      10.1016/j.str.2013.10.007.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microtubule-binding sites of the CH domain of EB1 and its autoinhibition revealed by NMR.2013

    • Author(s)
      Kanaba T, Maesaki R, Mori T, Ito Y, Hakoshima T, Mishima M
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 1834 Pages: 499-507

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2012.10.013.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hamatsu J, O'Donovan D, Tanaka T, Shirai T, Hourai Y, Mikawa T, Ikeya T, Mishima M, Boucher W, Smith BO, Laue ED, Shirakawa M, Ito Y.2013

    • Author(s)
      Hamatsu J, O'Donovan D, Tanaka T, Shirai T, Hourai Y, Mikawa T, Ikeya T, Mishima M, Boucher W, Smith BO, Laue ED, Shirakawa M, Ito Y.
    • Journal Title

      J Am Chem Soc.

      Volume: 135 Pages: 1688-1691

    • DOI

      10.1021/ja310928u.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Divergent DNA-binding specificities of agroup of ETHYLENE RESPONSE FACTOR transcription factors involved in plant defense.2013

    • Author(s)
      Shoji T, Mishima M, Hashimoto T.
    • Journal Title

      Plant Physiol.

      Volume: 162 Pages: 977-990

    • DOI

      10.1104/pp.113.217455.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of the second RRM domain of Nrd1, a fission yeast MAPK target RNA binding protein, and implication for its RNA recognition and regulation.2013

    • Author(s)
      Kobayashi A, Kanaba T, Satoh R, Fujiwara T, Ito Y, Sugiura R, Mishima M.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 437 Pages: 12-17

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2013.06.008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An in-cell NMR study of monitoring stress-induced increase of cytosolic Ca2+ concentration in HeLa cells.2013

    • Author(s)
      Hembram DS, Haremaki T, Hamatsu J, Inoue J, Kamoshida H, Ikeya T, Mishima M, Mikawa T, Hayashi N, Shirakawa M, Ito Y
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 438 Pages: 653-659

    • DOI

      doi: 10.1016/j.bbrc.2013.07.127.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分裂酵母由来の MAP キナーゼによりリン酸化される RNA 結合タンパク質 Nrd1 の構造解析2013

    • Author(s)
      小林彩保, 佐藤亮介, 藤原俊伸, 伊藤隆, 杉浦麗子, 三島正規
    • Organizer
      第52回 NMR討論会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      20131112-20131114
  • [Presentation] マルチドメインタンパク質Protein kinase Cの構造解析の試み2013

    • Author(s)
      金場哲平, 矢巻菜央, 秋吉克昂, 前崎綾子, 宮崎健介, 伊藤隆, 三島正規
    • Organizer
      第52回 NMR討論会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      20131112-20131114
  • [Presentation] 分裂酵母由来の MAP キナーゼによりリン酸化される RNA 結合タンパク質 Nrd1 の構造解析2013

    • Author(s)
      Kobayashi A., Satoh R., Fujiwara T., Sugiura R., Ito Y., Mishima M
    • Organizer
      第 51 回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20131028-20131030
  • [Presentation] RNA結合蛋白質 Nrd1の NMR法による構造解析2013

    • Author(s)
      小林彩保, 佐藤亮介, 藤原俊伸, 伊藤隆, 杉浦麗子, 三島正規
    • Organizer
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      鳥取
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Presentation] NMRを用いた溶液中のマルチドメインタンパク質 PKCの構造解析の試み2013

    • Author(s)
      金場哲平, 秋吉克昂, 前崎綾子, 宮崎健介, 伊藤隆, 三島正規
    • Organizer
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      鳥取
    • Year and Date
      20130612-20130614
  • [Book] 細胞工学(転写抑制補助因子のcasein kinase 2によるリン酸化と転写制御)2014

    • Author(s)
      小林彩保、金場哲平、三島正規
    • Total Pages
      印刷中
    • Publisher
      学研メディカル秀潤社

URL: 

Published: 2015-05-28  

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