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2013 Fiscal Year Research-status Report

ゲノム編集による遺伝子ネットワークのin vivo再構成技術を用いた進化発生研究

Research Project

Project/Area Number 25650080
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

三戸 太郎  徳島大学, ソシオテクノサイエンス研究部, 助教 (80322254)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsゲノム編集
Research Abstract

コオロギのシス調節配列改変実験のために,人工ヌクレアーゼZFN, TALENに加えて,より簡便な系であるCRISPR/Casシステムを導入した。同じ遺伝子座(laccase2遺伝子)について生殖系列での変異導入効率を比較したところ,ZFN(47%), TALEN(17%)に対しCRISPR/Casでは77%と顕著に高く,他の遺伝子座でも同様に高効率であった。このため,CRISPR/Casシステムを用いてシス調節配列改変技術を確立を目指すことにした。1,標的配列の欠失: 2種類のガイドRNAを用いてそれらの標的部位間の配列の欠失を試み,標的部位近傍にマイクロホモロジーがあるようにガイドRNAを設定することで,目的の欠失を誘導可能であることが示された。 2,外来配列のノックイン: 相同組換えによるノックイン実験では結果が得られなかったため戦略を変え,非相同末端結合経路によるノックインを試みた。インジェクション当代において外来配列の標的部位への挿入を示す結果が得られた。現在次世代への伝搬効率を調べており,ノックイン系統を効率良く確立するための実験を進めている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

シス調節配列の操作には至らなかったものの,ゲノム編集技術による標的配列の除去および外来配列のノックインに成功し,シス改変の基盤となる技術開発が順調に進んでいるため。

Strategy for Future Research Activity

CRISPR/Casシステムをベースとして開発した新規ゲノム改変技術をさらに改良,最適化し,シス調節配列を操作した個体を作製する系を早期に確立する。本実験系により,体節パターン形成に関わる遺伝子ネットワークの再構成を試みる。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

トランスクリプトームを計画していたが,ゲノム改変技術の開発に集中することがその後の研究の展開において非常に重要と判断しこれを中止したため。
新たに開発したゲノム改変技術の改良とそれを用いた実験に使用する。多数のゲノム改変系統を維持する必要が生じるため,一部は研究協力謝金に使用する。

  • Research Products

    (10 results)

All 2014 2013

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Gene knockout by targeted mutagenesis in a hemimetabolous insect, the two-spotted cricket Gryllus bimaculatus, using TALENs2014

    • Author(s)
      Takahito Watanabe, Sumihare Noji, Taro Mito
    • Journal Title

      Methods

      Volume: 69 Pages: 17-21

    • DOI

      10.1016/j.ymeth.2014.05.006

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] コオロギにおけるZFN, TALEN, CRISPR/Cas9を用いた遺伝子改変2014

    • Author(s)
      渡辺崇人,三戸太郎,大内淑代,野地澄晴
    • Journal Title

      実験医学別冊

      Volume: - Pages: 印刷中

  • [Journal Article] ZFN/TALENを用いたコオロギの遺伝子ノックアウト2013

    • Author(s)
      渡辺崇人,三戸太郎,野地澄晴
    • Journal Title

      細胞工学

      Volume: 32 Pages: 543-549

  • [Presentation] CRISPR/Casシステムを用いたフタホシコオロギにおけるゲノム編集2014

    • Author(s)
      三戸太郎・渡辺崇人・野地澄晴
    • Organizer
      第58回 日本応用動物昆虫学会大会(昆虫ホルモン談話会)
    • Place of Presentation
      高知大学(高知県高知市)
    • Year and Date
      20140328-20140328
    • Invited
  • [Presentation] Genome editing in a cricket using a CRISPR/Cas system2014

    • Author(s)
      Taro Mito, Takahito Watanabe, Sumihare Noji
    • Organizer
      1st Asian Invertebrate Immunity Symposium
    • Place of Presentation
      Pusan National University (Busan, Korea)
    • Year and Date
      20140214-20140215
    • Invited
  • [Presentation] Whole-genome sequencing and targeted genome editing in the cricket G. bimaculatus2014

    • Author(s)
      Taro Mito
    • Organizer
      Hokkaido Neuroethology Workshops 2014
    • Place of Presentation
      北海道大学(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2014-06-27 – 2014-06-27
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集技術によるノックアウトコオロギの作製2013

    • Author(s)
      三戸太郎,渡辺崇人,松岡佑児,山本卓,野地澄晴
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市))
    • Year and Date
      20131204-20131204
    • Invited
  • [Presentation] Targeted genome modifications in the cricket, Gryllus bimaculatus2013

    • Author(s)
      Takahito Watanabe, Hiroshi Ochiai, Tetsushi Sakuma, Satoshi Ishihara, Taro Nakamura, Takashi Yamamoto, Sumihare Noji, and Taro Mito
    • Organizer
      Conference of Transposition & Genome Engineering 2013
    • Place of Presentation
      Danubius Thermal Hotel Margitsziget (Budapest, Hungary)
    • Year and Date
      20130918-20130921
  • [Presentation] ゲノム編集技術によるノックアウトコオロギの作製2013

    • Author(s)
      渡辺崇人,松岡佑児,石原聡,山本卓,野地澄晴,三戸太郎
    • Organizer
      第15回 日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      筑波大学(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      20130828-20130830
    • Invited
  • [Presentation] Targeted genome modifications using ZFNs and TALENs in the cricket Gryllus bimaculatus2013

    • Author(s)
      Takahito Watanabe, Hiroshi Ochiai, Tetsushi Sakuma, Taro Nakamura, Taro Mito, Takashi Yamamoto, Sumihare Noji
    • Organizer
      第46回日本発生生物学会年会
    • Place of Presentation
      くにびきメッセ(島根県松江市)
    • Year and Date
      20130527-20130527

URL: 

Published: 2015-05-28  

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