2014 Fiscal Year Annual Research Report
シアノバクテリアのマクロなコロニーパターンの構築原理
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25650111
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| Research Institution | Waseda University |
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Principal Investigator |
岩崎 秀雄 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (00324393)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | シアノバクテリア / パターン形成 / 形態形成 / コロニーパターン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
前年度に引き続き，GeitlerinemaとPseudanabaenaの二種類のシアノバクテリアのコロニーパターンに関する解析を行った。
1.Geitlerinemaのコロニーパターンダイナミクスの解析： Geitlerinema sp.に特有な，安定な軌道を伴う渦状コロニーパターン形成に関して，前年度の成果をもとに主としてシミュレーションによる解析と，ゲノムDNA解析を行った。前者については，セルオートマトンを用い，Vicsekモデルを改変したシミュレーションにより，以前から提案してた軌道安定性を伴うコロニーパターン形成モデルを用いて現実のパターンの一部が再現できることを示した。また，共同研究により，次世代シーケンサーを用いたde novoシーケンシングを行った。その際，前年度までに分離していた，コロニーパターン形成変異株のゲノムDNAも解読し，変異箇所の同定を試みた。その結果，いくつかの遺伝子の塩基配列に変異が見つかった。
2.Pseudanabaenaのコロニーパターンダイナミクスの解析： Pseudanabeanaは円盤状および彗星状の特徴的なコロニーを呈する。定量的な顕微鏡観察から得られたパラメータをもとに，数理モデルを作成し，基本的な三つのコロニーパターン（束状，円盤状，彗星状）の形成と遷移のダイナミクスの一部を表現することに成功した（高松早大教授との共同研究）。また，世代シーケンサーを用いたde novoシーケンシングを行った。まだ，いくつかのギャップ配列があり，完全長決定には至っていない。前年度までに分離していた，Pseudanabaneaの個体長変異株のゲノムDNAも解読し，変異箇所の同定を試みた。
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