2013 Fiscal Year Research-status Report
ポリバレントモデル植物ゼニゴケによる葉緑体ゲノム収奪の分子機構の解明
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25650126
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Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
上田 実 京都大学, 理学(系)研究科(研究院), 特定研究員 (30632541)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 葉緑体ゲノム収奪 / ゼニゴケ / 葉緑体形質転換 |
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| Research Abstract |
人工的に葉緑体から細胞核へのDNAの移動（葉緑体ゲノム収奪）を測定する葉緑体形質転換体を用いて、ゼニゴケでの移行率を測定したところ、ゼニゴケでは被子植物と比べ移行率が抑制されていることが判明した。このゼニゴケの特長を利用して、葉緑体ゲノム収奪が起こる変異体のスクリーニングを行ったところ、候補株を単離することに成功した。また、この候補株に挿入していたT-DNAの挿入サイトを同定したところ、プロモーター領域であることが判明したため、ジーンターゲティングによるノックアウトの作出を試み、2ラインのノックアウト株を得ることに成功した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
今年度の目的である順遺伝学による葉緑体ゲノム収奪に関わる遺伝子の探索は達成できたと考えているため。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は、相補実験等により確実に葉緑体ゲノム収奪に関わる遺伝子であることを証明する。幸い、ノックアウト株の作出に成功しているので、今後は変異体を利用したオルガネラゲノム挿入領域の同定などを進め、ゲノムのどの領域がオルガネラゲノム（外来ゲノム）を受け入れやすく、また挿入後どのようなプロセスでオルガネラDNAが核ゲノム内に留まることが可能となるのか解析を進めていく予定である。
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| Expenditure Plans for the Next FY Research Funding |
所属が変更になる可能性があったため、年度をまたぐ可能性のある外部への委託発注を控えたため。
次世代シーケンス、メタボローム解析等を外注する予定である。
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[Journal Article] chlB requirement for chlorophyll synthesis under short photoperiod in Marchantia polymorpha L.2014
Author(s)
Ueda, M., Tanaka, A., Sugimoto, K., Kohchi, T., Shikanai, T., Nishimura, Y.
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Journal Title
Genome Biology and Evolution
Volume: 6
Pages: 620-628
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Subfunctionalization of sigma factors during the evolution of land plants based on mutant analysis of liverwort (Marchantia polymorpha L.) MpSIG12013
Author(s)
Ueda, M., Takami, T., Peng, L., Ishizaki, K., Kohchi, T., Shikanai, T., Nishimura, Y.
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Journal Title
Genome Biology and Evolution
Volume: 5
Pages: 1836-1848
DOI
Peer Reviewed
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