2015 Fiscal Year Annual Research Report
デメキンをモデルとした眼球サイズを制御するメカニズムの解析
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25670144
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
大森 義裕 大阪大学, たんぱく質研究所, 准教授 (90469651)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | デメキン / キンギョ / 魚類 / ゲノム解読 / 眼球 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
これまでに、デメキン遺伝子の同定のためのマップクロスを行い、そのF2世代のキンギョを得て、これらの個体からサンプルの取得と保存を完了した。H27年度はすべての遺伝子座がホモとなっているキンギョをヒートショック法により作出し、共同研究によりゲノム解読に用いる手法の確立を行った。効率よく遺伝子座がホモとなるキンギョの作製条件を見出した。野生型キンギョ（2年魚）を購入し、この手法を野生型キンギョであるワキンに適用し、すべての遺伝子座がホモとなるワキン個体を複数得ることができた。これらのワキンを成長させ十分なサイズに育てた後、これらのワキン子孫の臓器を摘出し次世代シーケンサーによるRNAseq解析を行うためのサンプルの精製を行った。新型の次世代シーケンサーで全ゲノム解読を行うためには精製度が高く分子量の大きいゲノムが必要である。このゲノムの精製のために共同研究により、精度の高いキンギョゲノムの精製を行った。新型次世代シーケンサーによる解析に十分な精度のゲノムDNAを精製することができた。一方、これまでに得たサンプルからゲノムを精製し、次世代シーケンサー（Hiseq）を用いてゲノム解析を行った。この実験は共同研究により行った。現在までに複数匹分のデメキンF2世代のゲノムのシーケンスが完了している。今後は得られたデータを解析し、デメキン遺伝子の同定を進める予定である。H27年度は、これまでに得られた結果について学会発表を行った。今後は、論文発表にむけて準備を進める。
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