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2015 Fiscal Year Annual Research Report

立体構造情報に基づいたCTX-M型β―ラクタマーゼの基質特異性拡張機構の解明

Research Project

Project/Area Number 25670276
Research InstitutionNara Medical University

Principal Investigator

山本 惠三  奈良県立医科大学, 医学部, 准教授 (90254490)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 笠原 敬  奈良県立医科大学, 医学部, 准教授 (50405403)
中山 章文  岐阜医療科学大学, 保健科学部, 教授 (70536721)
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywordsβ―ラクタマーゼ / 基質特異性 / X線結晶構造解析 / 構造変化
Outline of Annual Research Achievements

前年度の研究より、活性が拡張されるためにはループ部分の構造の柔軟性が重要であることが示唆された。そこで、活性部位の上部に位置し、α/βドメインをつなぐループにおいて柔軟性に影響を与えると考えられるAla219について、柔軟性が低下すると考えられる一連のアミノ酸置換、A219V, A219L, A219Fを導入した変異型酵素を作成し、大腸菌より精製した。
これらの酵素について結晶化条件を検索した結果、タンパク質濃度20 mg/mL、①1.9 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate pH 5.6, 0.2 M potassium sodium tartrate (native, A219V, A219F), ②10% PEG200, 0.1 M bis-Tris propane pH 9.0, 17% PEG8000 (A219L)の条件で、約0.1 mm角の良好な結晶が得られた。得られた結晶を用いて、SPring-8のBL44XUにおいて単結晶X線回折データを収集した。A219Vは分解能1.3Å、空間群P3221、A219Lは分解能1.7Å、空間群P212121、A219Fは分解能1.7Å、空間群P3221という結果を得た。
すでに構造が決定されているToho-1の構造を初期モデルとした用いた分子置換法により、野生型CTX-M-2、A219V, A219L, A219Fの構造を決定し互いに比較したところ、野生型に対して、A219V, A219Fの主鎖の構造変化はr.m.s.d=0.1Å程度と微小であったが、A219Lの構造変化はr.m.s.d=0.5Å、最大4.2Åと大きいことがわかった。このことから、CTX型β-ラクタマーゼでは、ループ部分に生じたアミノ酸置換が全体の構造に大きな変化を及ぼし、活性に影響を与えることが示唆された。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] First case of isolation of Kerstersia gyiorum from urinary tract.2016

    • Author(s)
      Ogawa Y, Koizumi A, Kasahara K, Lee ST, Yamada Y, Nakano R, Yano H, Mikasa K.
    • Journal Title

      J. Infect. Chemother.

      Volume: 22 Pages: 265-267

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2015.11.003.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 【感染症 いま何が起きているのか 基礎研究、臨床から国際支援まで】(第1章)感染症Hot topics 新興再興感染症を中心に 薬剤耐性菌の治療とその対策 抗菌薬は終わってしまうのか?2016

    • Author(s)
      小川 吉彦,笠原 敬,矢野 寿一
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 33 Pages: 2766-2770

  • [Journal Article] Nationwide surveillance of bacterial respiratory pathogens conducted by the surveillance committee of Japanese Society of Chemotherapy, the Japanese Association for Infectious Diseases, and the Japanese Society for Clinical Microbiology in 2010: General view of the pathogens' antibacterial susceptibility.2015

    • Author(s)
      Mikasa K, Kasahara K, Sano R
    • Journal Title

      J. Infect. Chemother.

      Volume: 21 Pages: 410-420

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2015.02.008.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chronic invasive sinus and intracerebral aspergillosis controlled by combination therapy with micafungin and a daily dose of 400 mg itraconazole oral solution.2015

    • Author(s)
      Ogawa T, Matsumoto K, Tsujimoto K, Hishiya N, Yamada Y, Uno K, Kasahara K, Maeda K, Nario K, Mikasa K, Morita K.
    • Journal Title

      J. Infect. Chemother.

      Volume: 21 Pages: 134-137

    • DOI

      10.1016/j.jiac.2014.08.010.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 【薬剤耐性菌感染症の早期診療-耐性菌はどう見分け、どう治療するか】 臨床における耐性菌感染症の病態・診断・治療 メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA).2015

    • Author(s)
      笠原 敬
    • Journal Title

      感染と抗菌薬

      Volume: 18 Pages: 134-139

  • [Presentation] 臨床医と検査技師の連携~地域での連携、そして院内システムの構築へ~2016

    • Author(s)
      笠原 敬
    • Organizer
      第27回日本臨床微生物学会総会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-01-29 – 2016-01-31
  • [Presentation] 臨床検査技師と医師を対象にした他施設共同臨床微生物研修会の試み2016

    • Author(s)
      李 相太,笠原 敬,水野 文子,小泉 章,宇井 孝爾,阿部 教行,福田 砂織,口広 智一,藤原 美樹,市村 佳彦,米倉 久剛,山田 幸司,近澤 秀己,夏目 聖子,矢野 寿一,幸福 知己,中村 竜也
    • Organizer
      第27回日本臨床微生物学会総会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2016-01-29 – 2016-01-31
  • [Presentation] 高速リアルタイムPCR装置を用いた結核菌迅速検出法の開発2015

    • Author(s)
      中山章文、永井秀典、赤羽貴行、茂籠邦彦、水野文子
    • Organizer
      第64回日本医学検査学会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2015-05-16 – 2015-05-17
  • [Presentation] JAID/JSC感染症治療ガイド2014年改訂版はどこが変わった?2015

    • Author(s)
      笠原 敬,三笠 桂一
    • Organizer
      第89回日本感染症学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2015-04-16 – 2015-04-17
  • [Presentation] 血液培養から分離されたメチシリン感受性黄色ブドウ球菌の検討2015

    • Author(s)
      笠原 敬,小松 方,小松 祐子,李 相太,米川 真輔,梶田 明裕,今北 菜津子,今井 雄一郎,宇野 健司,前田 光一,中村(内山) ふくみ,古西 満,矢野 寿一,三笠 桂一
    • Organizer
      第89回日本感染症学会総会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2015-04-16 – 2015-04-17

URL: 

Published: 2017-01-06  

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