2013 Fiscal Year Research-status Report
仮想病理画像と定量抗体プロテオミクスよる唾液腺腫瘍の分子標的バイオマーカー開発
| Project/Area Number |
25670868
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Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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| Research Institution | National Center of Neurology and Psychiatry |
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Principal Investigator |
本田 一文 独立行政法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (10260936)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 泰昌 独立行政法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (00296708)
野村 武史 東京歯科大学, 歯学部, 講師 (60328268)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | 抗体基盤プロテオミクス / 画像解析ソフトウエア / 唾液腺がん / 国際研究者交流 / 国際情報交換 |
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| Research Abstract |
唾液腺がんおよび健常部唾液腺を100例以上搭載した高密度組織マイクロアレイを作製した。唾液腺がん部と健常上皮部を描出するための抗サイトケラチン抗体と染色条件を決定した。唾液腺上皮部および唾液腺がん部を2値化するための、画像解析アルゴリズムを最適化した。唾液腺がん部と健常唾液腺上皮内に発現する標的タンパク質の半定量化に成功し、症例間の量比差を数学的に解析する解析法の概要を確立した。
唾液腺がん組織マイクロアレイを用いて、アクチン結合タンパク質であるアクチニン-4の染色体コピー数増加が唾液腺がんの予後因子になりうることを見出し、論文化した。
唾液腺がん組織マイクロアレイを数種類の抗体の免疫染色行い、唾液腺がん悪性度を分類する分子プロファイルの同定を試みた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画通り、唾液腺がん組織マイクロアレイは完成している。
唾液腺がんに特化した画像解析法のコンセプトを確立した。
組織マイクロアレイを利用した論文を執筆した。
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| Strategy for Future Research Activity |
唾液腺がんに特化した染色法、画像解析法の最適化と詳細の決定を行う。
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Research Products
(25 results)
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[Journal Article] Multilayer-omics analysis of renal cell carcinoma, including the whole exome, methylome and transcriptome.2014
Author(s)
Arai E, Sakamoto H, Ichikawa H, Totsuka H, Chiku S, Gotoh M, Mori T, Nakatani T, Ohnami S, Nakagawa T, Fujimoto H, Wang L, Aburatani H, Yoshida T, Kanai Y.
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Journal Title
Int J Cancer.
Volume: On line
Pages: On line
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Secondary osteosarcoma developing 10 years after chemoradiotherapy for non-small-cell lung cancer.2014
Author(s)
Yagishita S, Horinouchi H, Yorozu T, Kitazono S, Mizugaki H, Kanda S, Fujiwara Y, Nokihara H, Yamamoto N, Mori T, Tsuta K, Sumi M, Tamura T.
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Journal Title
Jpn J Clin Oncol.
Volume: 44(2):.
Pages: 191-4
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Soluble interleukin-6 receptor is a serum biomarker for the response of esophageal carcinoma to neoadjuvant chemoradiotherapy.2013
Author(s)
Makuuchi Y, Honda K, Osaka Y, Kato K, Kojima T, Daiko H, Igaki H, Ito Y, Hoshino S, Tachibana S, Watanabe T, Furuta K, Sekine S, Umaki T, Watabe Y, Miura N, Ono M, Tsuchida A, Yamada T.
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Journal Title
Cancer Sci
Volume: 104(8)
Pages: 1045-51.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] SOX10 is a novelmarker of acinus and intercalated duct differentiation in salivary gland tumors: a clue to the histogenesis for tumor diagnosis.2013
Author(s)
Ohtomo R, Mori T, Shibata S, Tsuta K, Maeshima AM, Akazawa C, Watabe Y, Honda K, Yamada T, Yoshimoto S, Asai M, Okano H, Kanai Y, Tsuda H.
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Journal Title
Mod Pathol.
Volume: 26(8):
Pages: 1041-50.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Distinct outcome of stage I lung adenocarcinoma with ACTN4 cell motility gene amplification.2013
Author(s)
Noro R(1), Honda K, Tsuta K, Ishii G, Maeshima AM, Miura N, Furuta K, Shibata T, Tsuda H, Ochiai A, Sakuma T, Nishijima N, Gemma A, Asamura H, Nagai K, Yamada T.
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Journal Title
Ann Oncol.
Volume: 24(10):
Pages: 2594-600.
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Sato Y, Ojima H, Onaya H, Mori T, Hiraoka N, Kishi Y, Nara S, Esaki M, Shimada K, Kosuge T, Sugihara K, Kanai Y.2013
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[Journal Article] Frequent GNAS mutations in low-grade appendiceal mucinous neoplasms.2013
Author(s)
Nishikawa G, Sekine S, Ogawa R, Matsubara A, Mori T, Taniguchi H, Kushima R, Hiraoka N, Tsuta K, Tsuda H, Kanai Y.
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Journal Title
Br J Cancer.
Volume: 108(4):
Pages: 951-8.
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] The mechanism of resistance for chemotherapy in advanced stage of ovarian cancer
Author(s)
Kazufumi Honda1, Sohei Yamamoto2, Hitoshi Tsuda2,3, Nami Miura1, Mitsuyo Omura4, Yoshihiro Izumi5, Masashi Takano6, Takahiro Kasamatsu7, Masaru Yoshida5, Makoto Suematsu4 & Tesshi Yamada1
Organizer
第８６回日本生化学学会大会
Place of Presentation
横浜
Invited
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