• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2015 Fiscal Year Annual Research Report

質量分析型即時がん診断支援システムの構築

Research Project

Project/Area Number 25713023
Research InstitutionUniversity of Yamanashi

Principal Investigator

吉村 健太郎  山梨大学, 総合研究部, 助教 (70516921)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords機械学習 / バルクデータ / がん診断 / 大気圧イオン化法 / リアルタイム質量分析 / メタボロミクス
Outline of Annual Research Achievements

1、データ解析ソフトウェア開発:多数のマススペクトルデータを蓄積、管理、編集し、統計解析や判別分析を行うための各種プログラムを構築した。またこれら全てのプログラムを連結し、graphical user interface (GUI) を含めてソフトウェアを完成させた。同ソフトウェアはフリーウェアとしてインターネット上に公開済みであり、さらに近日、国際誌にtechnical report を投稿予定である。
2、多種のがん診断への応用:昨年度までに肝細胞がん、腎細胞がんの診断に成功したため、本年度はさらに扁平上皮がん、膠芽腫、膀胱がん、胃がん、結腸がん、膵臓がんのデータ収集を行った。これらのデータ収集は今後も継続して行われるが、扁平上皮がん、大腸がんは特に多く検体が得られたため、本年度中の診断アルゴリズム構築を目指した。その結果、扁平上皮がんでは93%、膠芽腫では85%の精度で非がん部、がん部を判別可能なアルゴリズムを構築できた。
3、リアルタイム診断システム開発に向けた改良:現在の装置では検体表面への溶媒の添加が必要なため、臨床現場で人体に直接使用することができない。そこでイオン化部にスプレーシステムを導入し、一切の処理を行うことなく、生きた動物の組織から直接マススペクトルを得ることを可能とした。当該システムはリアルタイムメタボローム解析や薬剤動態解析への応用も可能であり、現在その有用性の検証を進めている。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Causes of Carryover

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Expenditure Plan for Carryover Budget

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (10 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) Remarks (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Modulation of primary cilia length by melanin-concentrating hormone receptor 12016

    • Author(s)
      Akie Hamamoto, Shogo Yamato, Yohei Katoh, Kazuhisa Nakayama, Kentaro Yoshimura, Sen Takeda, Yuki Kobayashi, Yumiko Saito
    • Journal Title

      Cellular Signalling

      Volume: 28 Pages: 572-584

    • DOI

      10.1016/j.cellsig.2016.02.018

  • [Journal Article] 相反する視座からの新しいがん診断支援装置の試み臨床病理2015

    • Author(s)
      竹田 扇、吉村 健太郎、田邉 國士
    • Journal Title

      臨床病理

      Volume: 63 Pages: 1083-1089

  • [Journal Article] Involvement of FKBP6 in hepatitis C virus replication2015

    • Author(s)
      Hitotake Kasai, Kunihiro Kawakami, Hiromasa Yokoe, Kentaro Yoshimura, Masanori Matsuda, Jun Yasumoto, Shinya Maekawa, Atsuya Yamashita, Tomohisa Tanaka, Masanori Ikeda, Nobuyuki Kato, Toru Okamoto, Yoshiharu Matsuura, Naoya Sakamoto, Nobuyuki Enomoto, Sen Takeda, Hideki Fujii, Masayoshi Tsubuki, Masami Kusunoki
    • Journal Title

      Scientific reports

      Volume: 16 Pages: 16699

    • DOI

      10.1038/srep16699

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ミエリン形成におけるヘッジホッグシグナルの機能とシグナル活性調節機構の解明2016

    • Author(s)
      吉村 健太郎
    • Organizer
      第121回日本解剖学会総会・全国学術集会
    • Place of Presentation
      ビッグバレットふくしま(福島県・郡山市)
    • Year and Date
      2016-03-28
  • [Presentation] Hedgehog signaling specifically regulates the morphogenesis of Schwann cell in promyelinating stage2015

    • Author(s)
      吉村 健太郎
    • Organizer
      第38回 日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-30
  • [Presentation] Development of real-time metabolomic analysis system and database construction/statistical analysis software2015

    • Author(s)
      吉村 健太郎
    • Organizer
      第63回質量分析総合討論会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場エポカルつくば(茨城県・つくば市)
    • Year and Date
      2015-06-19
  • [Remarks] 国立大学法人山梨大学研究者総覧

    • URL

      http://erdb.yamanashi.ac.jp/rdb/A_DispDetail.Scholar

  • [Remarks] 山梨大学 大学院医学工学総合研究部 解剖学講座細胞生物学教室

    • URL

      http://www.cellbiology.jp

  • [Remarks] 質量分析、メタボロミクス、データ解析

    • URL

      http://hh-bd.link

  • [Patent(Industrial Property Rights)] マススペクトル解析システム,方法およびプログラム2015

    • Inventor(s)
      吉村健太郎、城野悠志、船山慧、川井将敬、森優喜、竹田扇
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人山梨大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2015-078992
    • Filing Date
      2015-04-08

URL: 

Published: 2017-01-06  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi