2015 Fiscal Year Annual Research Report
軟骨内骨化を制御する血管新生因子標的microRNAの同定と機能解析
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25713064
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Research Institution | Kyushu Dental College |
Principal Investigator |
藤田 優子 九州歯科大学, 歯学部, 助教 (90514670)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | マイクロRNA / 成長発育 / ラット |
Outline of Annual Research Achievements |
生後3週齢のラット10匹に固形食(コントロール群)もしくは粉末食(実験群)を8週間与えて飼育し、実験期間終了後、深麻酔下で安楽死させ、ただちにすべてのラットの咬筋(浅層、深層)を摘出した。摘出した右側の咬筋の一部でHE染色標本を作製し、残りのサンプルでmicroRNAを含むtotalRNAの抽出を行った。Total RNAのサンプルから、microRNAおよびDNAマイクロアレイ解析を行い、信頼性のあるmicroRNAとmRNAのみを抽出した。さらに実験群とコントロール群間でt-testを行い、p値が0.05未満で発現値の変動倍率が2以上もしくは1/2以下のmicroRNA(浅層;21種、深層;11種)とmRNA(浅層;555種、深層;155)を抽出した。 HE染色標本において、筋線維の平均横断面積と直径を測定し、実験群とコントロール群間における平均値を比較した結果、実験群の平均横断面積と直径はコントロール群と比較して有意に低い値を示した。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
概ね予測した通りの結果が出ているため。
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Strategy for Future Research Activity |
miRNAマイクロアレイ解析とDNAマイクロアレイ解析で得られたデータで統合解析を行う。 変動miRNAと変動mRNAの発現値が逆相関関係にあるものを抽出し、さらに公的データベース(targetScan, miRDB)を使用してmiRNAのターゲットmRNAの予測を行う。次にGene Ontology 頻度解析、KEGG Pathway頻度・挙動解析を行い、さらなるmiRNA-mRNAの絞込みを行う。
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Causes of Carryover |
平成27年度に遂行予定であった実験の一部が年度をまたいでしまったため。
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Expenditure Plan for Carryover Budget |
本年度は昨年度より続行している実験を完了する予定である。
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Research Products
(4 results)