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2013 Fiscal Year Research-status Report

リガンド連結型一電子酸化触媒による標的タンパク質選択的ケミカルラベリング法の開発

Research Project

Project/Area Number 25810104
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

佐藤 伸一  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (20633134)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Keywordsタンパク質分子修飾 / ケミカルラベリング / チロシン残基修飾 / 選択的ラベル化
Research Abstract

初めに、光触媒を用いたラジカル的なTyr残基修飾反応を開発した。Ru(bpy)3錯体は光照射刺激依存的に一電子酸化反応を触媒し、チロシルラジカルを生成することが知られている。発生したラジカルを特定の化合物構造で効率的にトラップすることができれば、Tyr残基に対する分子修飾反応に応用できると考えた。
種々のtyrosyl radical trapper (TRT)構造をスクリーニングした結果、N,N-dimethylamino-N’-acyl phenylenediamine構造がTyr残基と光触媒の活性化条件において効率的に縮合反応を起こすことを見出した(95%:ペプチド実験)。本ラベル化反応は精製タンパク質のラベル化にも適用できることが分かり、従来の汎用法である、求電子的な試薬を用いたタンパク質ラベル化法と直交的・相補的に使用できることを明らかとした。
次に、当初の研究計画通り、標的タンパク質の選択的ラベル化反応について検討した。リガンド連結型のRu錯体(local environmental SET catalyst : LESC)を用いて一電子酸化触媒となるRu錯体をリガンド親和性標的タンパク質に近接させることで、短寿命のチロシルラジカル生成‐トラップ反応を標的近傍で選択的に触媒することができると考えた。Carbonic anhydride(CA)を標的としてCAの親和性リガンドとRu錯体を連結させた分子をデザインし、合成した。合成上の問題点として目的化合物の精製法に検討を要したが、その手技を取得することができた。
BSAとCAから成る単純なタンパク質混在系においてコンセプトを検証した結果、仮説通り、CAを選択的にラベル化することに成功した。また、より複雑な混在系における実験として、本手法の有用性を検討した結果、マウス赤血球中のタンパク質混在系の中でCAを選択的にラベル化することに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画では初年度にチロシン残基修飾反応の検討、修飾剤構造の最適化等に平成25年の大半を費やす計画をしていたが、予想以上に早い段階で、ペプチドレベルでチロシン選択的に高効率の修飾反応を実現する修飾剤、反応条件を発見することができた。そこで、タンパク質親和性分子が連結したRu錯体の合成、評価を進めることとした。当初は平成26年度より開始する予定であった、生体由来成分を使った複雑なタンパク質混在での選択的ラベル化も達成することができ、コンセプトを証明するに至ったため、当初の計画以上に進展していると判断する。

Strategy for Future Research Activity

現在、コンセプト証明のための標的タンパク質はCarbonic anhydride(CA)という広く研究されているものを対象に研究を進めたが、今後は他のタンパク質を標的とした研究を展開することで、生命現象の解明に貢献できる手法に発展させることを目標とする。また、ケミカルバイオロジー研究分野における、リガンド標的タンパク質の同定法、リガンド結合サイトの同定法に応用できる手法へと拡張を目指す。
そのためには、現行のリガンド連結型Ru錯体の合成はアミド縮合反応に基づくものであるが、リガンド内構造の官能基によって制約を受けるといった問題点がある。そこで、官能基許容性の優れたクリック反応でのリガンド-Ru錯体の連結法の開発を行い、より汎用性の高いRu連結分子の合成法確立を目指す。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

平成25年度の2月より前所属の学習院大学から現所属の東京工業大学資源化学研究所に異動し、平成25年度からの研究室の引っ越し作業等に割かれた時間によって実験に使用する消耗品費等が当初の予定より若干少なくなったため。
次年度使用額について、研究室の引っ越し後の実験のスタートに必要な消耗品の購入、これまでは予算としてかかっておらず当初の予定に組み込まれていなかった質量分析機器の共同使用料等に当てる。

  • Research Products

    (10 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Diaryl-substituted ortho-carboranes as a new class of hypoxia inducible factor-1α inhibitors2014

    • Author(s)
      H. Nakamura, L. Tazaki, D. Kanoh, S. Sato, H. S. Ban
    • Journal Title

      J. Chem. Soc., Dalton Trans.

      Volume: 43 Pages: 4941-4944

    • DOI

      10.1039/c3dt52828f

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of Hypoxia-Inducible Factor (HIF)-1α Inhibitors: Effect of ortho-Carborane Substituents on HIF Transcriptional -Activity under Hypoxia2013

    • Author(s)
      H. Nakamura, Y. Yasui, M. Maruyama, H. Minegishi, H. S. Ban, S. Sato
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 23 Pages: 1455-1461

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.11.081

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ligand-directed Selective Protein Modification Based on Local Single Electron Transfer Catalysis2013

    • Author(s)
      S. Sato and H. Nakamura
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 52 Pages: 8681-8684

    • DOI

      10.1002/anie.201303831

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemically Programmed Antibodies As HIV-1 Attachment Inhibitors.2013

    • Author(s)
      S. Sato, T. Inokuma, N. Otsubo, D. R. Burton, C. F. Barbas III
    • Journal Title

      ACS Med. Chem. Lett.

      Volume: 4 Pages: 460-465

    • DOI

      10.1021/ml400097z

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 一電子酸化反応に基づくチロシン残基修飾法の開発と標的タンパク質選択的ラベル化法への応用2014

    • Author(s)
      佐藤 伸一、中村 浩之
    • Organizer
      日本薬学会第134年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20140327-20140330
  • [Presentation] Target-selective Protein Labeling Based on Local Single Electron Transfer Catalysis2013

    • Author(s)
      Shinichi Sato, Hiroyuki Nakamura
    • Organizer
      The 2nd International Symposium on Chemical Biology of Natural Products: Target ID and Regulation of Bioactivity
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      20131028-20131029
  • [Presentation] Ligand-directed Selective Protein Modification Based on Local Environmental Single Electron Transfer Catalysis2013

    • Author(s)
      Shinichi Sato, Hiroyuki Nakamura
    • Organizer
      International Chemical Biology Society 2nd Annual Conference ICBS2013
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20131007-20131009
  • [Presentation] 標的指向性Ru(bpy)3錯体をもちいた局所環境での一電子酸化反応の制御と標的タンパク質選択ラベル化法への応用2013

    • Author(s)
      佐藤 伸一、中村 浩之
    • Organizer
      第60回有機金属討論会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20130912-20130914
  • [Presentation] 局所環境での一電子酸化反応を利用した標的タンパク質選択的ラベル化法の開発2013

    • Author(s)
      佐藤 伸一、中村 浩之
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第8回年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20130619-20130621
  • [Remarks] 東京工業大学資源化学研究所 中村・谷口研HP

    • URL

      http://www.syn.res.titech.ac.jp/research.htm

URL: 

Published: 2015-05-28  

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