2013 Fiscal Year Research-status Report
細胞膜プロテオーム解析を用いた成人Ｔ細胞性白血病新規治療標的分子の探索
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25830126
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Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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| Research Institution | Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
石原 誠人 独立行政法人理化学研究所, 統合生命医科学研究センター, 研究員 (60581189)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Keywords | プロテオミクス / 膜プロテオーム / 糖鎖 |
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| Research Abstract |
我々はHTLV-1が主に末梢血中のCD4陽性T細胞に感染・潜伏することに着目し、膜表面分子を標的としたATL新規治療法の開発を目的として、CD4陽性T細胞における膜プロテオームプロファイル解析を行った。まず正常(n = 14)、無症候性感染者(n = 21)、ATL患者(n = 13)、HAM/TSP患者(n = 21)より末梢血を採取し、フローサイトメトリーを用いてCD4陽性T細胞を単離した。次に膜プロテオームに焦点を絞るため、これらのサンプルのトリプシン消化物からConA-Lectinアフィニティークロマトグラフィーにより糖ペプチドを濃縮した。サンプルをLTQ-Orbitrap Velosにより解析し、最終的に946 糖タンパク質（6,791 糖ペプチド、FDR < 0.01）を同定した。これら同定されたペプチド中、Welch検定を用いた2群検定で有意（p < 0.05、fold change > 2）にATL患者のCD4陽性T細胞で発現が上昇している、あるいはATL患者のCD4陽性T細胞のみで発現しているペプチドを単離した結果、ATLの治療標的候補として25タンパク質 / 71ペプチドを同定した。これらの25タンパク質のうち8タンパク質は以前にHTLV-1感染によって発現上昇するタンパク質としての報告があり、以上の結果から我々の行った糖ペプチド濃縮を用いた膜プロテオーム解析が新規抗体治療薬の開発を目的とした治療標的分子の探索に効率的に結び付くことが示された。今後残る19タンパク質の中から正常臓器での発現が少なく、治療法開発にあたって副作用の少ないと目される治療標的候補に対しATL細胞株、ATL患者検体を使ったバリデーション実験を進めていく予定である。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
本研究は抗体治療などに用いる治療標的の同定を研究期間内の最終目的としており、年度内には患者検体のスクリーニングによる治療標的候補タンパク質の同定まで終える予定であった。現在、バリデーション実験をすでに開始しており、すでに特に有望な１候補タンパク質に対する定量解析を行うための系の樹立を終え、JSPFADから提供されたATL、キャリア検体を用いたバリデーション実験を開始する段階にある。これらのことから当初予定していた研究予定より早いペースで研究が進行していると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
進行中のバリデーション実験に加え、上記プロテオーム解析で同定された残りの治療標的分子候補に対する100症例規模のバリデーション実験を行う。具体的には抗体作製、及びそれを用いたFlow cytometryを用いた定量系、また抗体作成が困難な分子に対しては質量分析を用いた定量法であるMultiple Reaction Monitoring(MRM)法による定量系を確立し、全候補タンパク質に対してバリデーション系を確立する。最終的に正常組織における発現や、治療標的分子候補に対して作成した抗体を基にADCC活性、CDC活性を計測し、ATLに対する治療用抗体の実用化が最も期待される候補分子群を1～5個選別する。
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Research Products
(4 results)
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[Presentation] Label free quantitative proteome analysis on cerebrospinal fluid to discover severity grade markers for Human T-cell leukemia virus type 1 associated myelopathy/tropic spastic paraparesis (HAM/TSP)
Author(s)
Makoto Ishihara, Natsumi Araya, Tomoo Sato, Risa Fujii, Ayako Tatsuguchi, Naomi Saichi, Hidewaki Nakagawa, Yoshihisa Yamano, Koji Ueda
Organizer
HUPO 2013
Place of Presentation
Pacifico Yocohama, Kanagawa, Japan
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