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2014 Fiscal Year Research-status Report

ヘムオキシゲナーゼと弱い相互作用を示す複合体の立体構造解析

Research Project

Project/Area Number 25840026
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

杉島 正一  久留米大学, 医学部, 准教授 (30379292)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Keywords電子伝達 / 分子間相互作用 / X線結晶構造解析 / 酵素
Outline of Annual Research Achievements

ヘムオキシゲナーゼ(HO)は、分子状酸素とNADPH-シトクロムP450還元酵素(CPR)からの還元力を利用し、ヘムをα-ビリベルジン、一酸化炭素、鉄に分解する酵素である。本研究ではCPR-HO複合体もしくはCPRの各ドメインとHOの複合体の立体構造解析を行い、CPRとHOの相互作用の詳細およびCPRからHOへの電子伝達経路について明らかにすることを目的とした。

現在までに、CPR-HO複合体を変異CPR(ΔTGEE)を用いることで安定化し、低分解能ながらX線結晶構造解析に成功した。ΔTGEE-HO複合体中で電子はNADPH→FAD→FMN→ヘムと伝達されると推定しているが、FADとFMNは20Å以上離れており、FAD→FMNの直接の電子伝達は難しい位置関係にあった。実際にΔTGEEからヘム-HO複合体への電子伝達速度は野生型CPRを用いた場合の1/250程度であり、非常に遅くなっていた。
これまでの海外の研究グループ(米ウィスコンシン大 Kim博士)らの報告では、CPRはopenとclosedの二つ以上のコンフォメーションを行き来しながら電子伝達を行うことが推定されている。ΔTGEEはopenコンフォメーションが安定化された変異CPRであり、このことと我々の決定した立体構造を合わせて考えると、openコンフォメーションはHOに結合するのに都合が良く、結合すると、FMNとヘムが近接するので、CPR-HO間の分子間電子伝達に都合の良い形、closedコンフォメーションはFMNとFADが近接しているので、CPR内部の分子内電子伝達に都合の良い形と考えることができる。CPRはこの二つのコンフォメーションを行き来することで、HOなどにうまく電子伝達を行っていると推定できた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究の目的であるCPR-HO複合体の構造解析に成功した。ただし、低分解能であるため、アミノ酸側鎖の構造や結合水には不明瞭な点が多く、そのレベルでのCPR-HO間の相互作用に関する議論はできない。詳細を明らかにするためには、分解能の向上が必要である。

Strategy for Future Research Activity

1.複合体結晶の分解能向上
複合体の精製度向上、分子間パッキングの改良、新たな結晶化条件の探索などにより、分解能の向上を図る。

2.closedコンフォメーションのCPRとHOの相互作用
現在考えている電子伝達モデルでは、closedコンフォメーションのCPRとHOは必ずしも相互作用する必要はない。実際に相互作用するかどうか、表面プラズモン共鳴法や超遠心分析によって明らかにする。これについてはclosedコンフォメーションのCPRを使った活性測定や還元速度測定も予定している。

Causes of Carryover

前年度未使用額と合わせて、概ね交付決定額通りに使用している。
残額で購入可能な試薬・消耗品で、研究遂行に必要な物品がなかったため、次年度に交付予定の予算と合わせることで、有効活用することにした。

Expenditure Plan for Carryover Budget

次年度使用額は交付予定額と合算した上で、試薬・消耗品の購入に当てる。

Remarks

平成27年度科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞受賞

  • Research Products

    (20 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Backbone assignments of the apo and Zn(II) protoporphyrin IX-bound states of the soluble form of rat heme oxygenase-12015

    • Author(s)
      Harada E., Sugishima M., Harada J., Noguchi M., Fukuyama K., Sugase K.
    • Journal Title

      Biomol. NMR Assign.

      Volume: 9 Pages: 197-200

    • DOI

      10.1007/s12104-014-9573-z

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Distal regulation of heme binding of heme oxygenase-1 mediated by conformational fluctuations2015

    • Author(s)
      Harada E., Sugishima M., Harada J., Fukuyama K., Sugase K.
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 54 Pages: 340-348

    • DOI

      10.1021/bi5009694

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Insights into the Proton Transfer Mechanism of a Bilin Reductase PcyA Following Neutron Crystallography2015

    • Author(s)
      Masaki Unno, Kumiko Ishikawa-Suto, Katsuhiro Kusaka, Taro Tamada, Yoshinori Hagiwara, Masakazu Sugishima, Kei Wada, Taro Yamada, Katsuaki Tomoyori, Takaaki Hosoya, Ichiro Tanaka, Nobuo Niimura, Ryota Kuroki, Koji Inaka, Makiko Ishihara, Keiichi Fukuyama
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 137 Pages: 5452-5460

    • DOI

      10.1021/jacs.5b00645

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ヘム鉄代謝の鍵となる電子伝達複合体の構造解析2014

    • Author(s)
      杉島正一
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 56 Pages: 393-398

    • DOI

      10.5940/jcrsj.56.393

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ヒト由来ペプチド C 末端アミド化酵素の結晶構造解析を目指 して2015

    • Author(s)
      下川千寿、城田 ( 原田 ) 沙織、Rudzka K、杉島正一、佐藤秀明、東元祐一郎、Amzel LM、野口正人
    • Organizer
      日本化学会第 95 春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 新規ポルホビリノーゲン誘導体のヒドロキシメチルビランシンターゼに対する阻害剤としての効果2015

    • Author(s)
      佐藤秀明、塚口舞、杉島正一、増子隆博、小俣義明、和田啓、久枝良雄、野口正人、山本健
    • Organizer
      日本化学会第 95 春季年会
    • Place of Presentation
      日本大学船橋キャンパス(千葉県船橋市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] X 線結晶構造解析によるヘム代謝酵素複合体の立体構造解明2014

    • Author(s)
      杉島正一, 佐藤秀明, 東元祐一郎, 原田二朗, 平 順一, 坂本 寛, 安永卓生, 和田 啓, 福山恵一, 山本 健, 野口正人
    • Organizer
      立体視プロジェクションシステムを使った分子科学研究講演会
    • Place of Presentation
      九州工業大学飯塚キャンパス(福岡県飯塚市)
    • Year and Date
      2014-12-05 – 2014-12-06
  • [Presentation] 中性子結晶構造解析によるフェレドキシン依存性ビリン還元酵素-基質複合体の水素化状態可視化2014

    • Author(s)
      海野昌喜、須藤久美子、日下勝弘、玉田太郎、萩原義徳、杉島正一、和田啓、山田太郎、石原真樹子、福山恵一
    • Organizer
      平成 26 年度日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(東京都文京区)
    • Year and Date
      2014-11-01 – 2014-11-03
  • [Presentation] シアノバクテリア由来ビリベルジンリダクターゼの構造・機能解析2014

    • Author(s)
      高尾春奈、平林 佳、渡邉 彩、萩原義徳、榊原陽 一、水光正仁、福山恵一、杉島正一、和田 啓
    • Organizer
      第 87 回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
  • [Presentation] NADPH-シトクロムP450 還元酵素とヘム-ヘムオキシゲナーゼ複合体との相互作用および電子伝達機構2014

    • Author(s)
      杉島正一、小松将大、坂本 寛、安永卓生、佐藤秀明、東元祐一郎、原田二朗、和田 啓、福山恵一、山本 健、野口正人
    • Organizer
      第 87 回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都国際会館(京都府京都市)
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
  • [Presentation] STRUCTURAL BASIS FOR THE ELECTRON TRANSFER FROM NADPH-CYTOCHROME P450 REDUCTASE TO MAMMALIAN HEME OXYGENASE-12014

    • Author(s)
      Masakazu Sugishima
    • Organizer
      8th International Conference on Heme Oxygenases, BioIron & Oxidative Stress
    • Place of Presentation
      The Garvan Institute of Medical Research (Sydney, Australia)
    • Year and Date
      2014-10-08 – 2014-10-11
    • Invited
  • [Presentation] NADPH-シトクロムP450 還元酵素のダイナミックな構造変化とヘムオキシゲナーゼへの電子伝達反応2014

    • Author(s)
      杉島正一
    • Organizer
      第 38 回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • Place of Presentation
      レイクサイドホテル久山(福岡県糟屋郡久山町)
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] Complex structure of NADPH-cytochrome P450 oxidoreductase and heme oxygenase-12014

    • Author(s)
      Masakazu Sugishima, Hideaki Sato, Yuichiro Higashimoto, Jiro Harada, Kei Wada, Keiichi Fukuyama, Masato Noguchi
    • Organizer
      23rd congress and general assembly of the international union of crystallography
    • Place of Presentation
      Palais des Congres de Montreal (Montreal, Quebec, Canada)
    • Year and Date
      2014-08-05 – 2014-08-12
  • [Presentation] Neutron Structure of Phycocyanobilin:oxidoreductase Complexed with Biliverdin2014

    • Author(s)
      Masaki Unno, Kumiko Ishikawa-Suto, Katsuhiro Kusaka, Taro Tamada, Yoshinori Hagiwara, Masakazu Sugishima, Kei Wada, Taro Yamada, Makiko Ishihara, Keiichi Fukuyama
    • Organizer
      23rd congress and general assembly of the international union of crystallography
    • Place of Presentation
      Palais des Congres de Montreal (Montreal, Quebec, Canada)
    • Year and Date
      2014-08-05 – 2014-08-12
  • [Presentation] NADPH-シトクロムP450 還元酵素からヘムオキシゲナーゼへの電子移動に関する構造基盤2014

    • Author(s)
      杉島正一、佐藤秀明、東元祐一郎、原田二朗、和 田啓、福山恵一、野口正人
    • Organizer
      第 14 回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ワークピア横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2014-06-25 – 2014-06-27
  • [Presentation] 中性子結晶構造解析で見るフェレドキシン依存性ビリン還元酵素 PcyA 基質複合体の水素化状態2014

    • Author(s)
      海野昌喜、須藤久美子、日下勝弘、玉田太郎、萩原義徳、杉島正一、和田啓、山田太郎、石原真樹子、福山恵一
    • Organizer
      第 41 回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      九州大学西新プラザ(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-06-06 – 2014-06-07
  • [Presentation] NADPH-シトクロムP450還元酵素とヘムオキシゲナーゼの複合体構造2014

    • Author(s)
      杉島正一、佐藤秀明、東元祐一郎、原田二朗、坂本 寛、安永卓夫、和田 啓、福山恵一、野口正人
    • Organizer
      第 41 回生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      九州大学西新プラザ(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-06-06 – 2014-06-07
  • [Presentation] NADPH-シトクロムP450還元酵素からヘム- ヘムオキシゲナーゼ複合体への電子伝達に関する構造基盤2014

    • Author(s)
      杉島正一、佐藤秀明、東元祐一郎、原田二朗、坂 本 寛、安永卓夫、和田 啓、福山恵一、野口正人
    • Organizer
      平成 26 年度日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      九州大学病院キャンパス(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2014-05-17 – 2014-05-18
  • [Book] 日本の結晶学(II)-その輝かしい発展-2014

    • Author(s)
      杉島正一、他220名
    • Total Pages
      485(294)
    • Publisher
      日本結晶学会
  • [Remarks] ホームページ

    • URL

      https://sites.google.com/site/msugishima76/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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