2016 Fiscal Year Annual Research Report
Exploration of long non-coding RNA involved in epithelial mesenchymal transition in non-small cell lung cancer.
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25860275
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| Research Institution | Jichi Medical University |
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Principal Investigator |
吉本 多一郎 自治医科大学, 医学部, 講師 (20634166)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | non-coding RNA / 上皮間葉転換 / 肺腺癌 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、肺腺癌進展、特に上皮間葉転換(Epithelial-Mesenchymal transition, 以下EMT)におけるnon-coding RNA (以下ncRNA)の役割を解析することである。当研究室では肺腺癌の多彩な形質をよく反映した細胞株40株のパネル（代表的なdriver mutationを網羅し、発現形質の違いに基づいて上皮型と間葉型に大別できる）を用いてこれまで研究を展開してきた。
昨年度までに、これらの細胞株のうち15株（上皮型細胞株5株、間葉型細胞株10株）から抽出したtotal RNAを並列型シーケンサーによりncRNA分画のトランスクリプトームシーケンシングを行い、網羅的に発現を解析した（これは共同研究者の東京医科歯科大学ゲノム病理学分野 石川俊平教授に依頼した）。
その結果、上皮型細胞株と間葉型細胞株で差が見られたncRNAのうち、現在まで有望な12個のncRNAに候補を絞った。これらを40株のパネルすべてを用いてTaqman RT-PCR法で定量的発現解析を行った。その結果、12個のうち大半のncRNAは網羅的発現解析と同様、上皮型と間葉型で発現に差が見られた。
現在はさらなる検証のため、実際のヒト肺腺癌切除症例（凍結検体）を用いて、これらncRNAの発現量の解析の準備を行っている。それにより有力な候補と思われるncRNAについては、今後、機能解析（RNAiによるknock down, あるいはベクターを用いた強制発現により細胞形態や発現形質、細胞増殖能、apoptosis、浸潤能などに影響がでるか）を進める予定である。
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| Remarks |
Frequent loss of the expression of multiple subunits of the SWI/SNF complex in large cell carcinoma and pleomorphic carcinoma of the lung.
Taichiro Yoshimoto et al.Pathol Int. 2015 Nov;65(11):595-602.
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