2014 Fiscal Year Research-status Report
真性赤血球増加症の診断確定のためのJAK2変異探索
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25860416
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| Research Institution | Juntendo University |
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Principal Investigator |
森下 総司 順天堂大学, 医学部, 助教 (10635866)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Keywords | 遺伝子変異検出 / 骨髄増殖性腫瘍 / 真性赤血球増加症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
骨髄増殖性腫瘍（MPN）は，造血幹細胞の異常による骨髄系細胞のクローナルな増殖を来す一連の疾患群と定義され，真性赤血球増加症（PV），本態性血小板血症（ET），原発性骨髄線維症（PMF）などがしられる。これまでに，上記3つの疾患に共通の変異として，JAK2，MPL，CALRなどの変異が報告されている。平成25年度において，日本全国より収集した検体を対象としたJAK2変異の探索を実施した。この結果を踏まえ，平成26年度では，JAK2，MPL，CALR遺伝子の高感度検出技術の確立，およびそれらを用いた変異のスクリーニングと，JAK2，MPL，CALR遺伝子のエクソンシークエンスを実施し，日本におけるMPN症例の変異スペクトラムを解析した。
確立した技術をもちいて，平成25年度で確定させたJAK2変異陰性の症例（PV:2例，ET:51例，PMF:12例）について，MPL変異，CALR変異の有無を探索したところ，ETにおいてMPL変異陽性7例，CALR変異陽性22例，PMFにおいてMPL変異陽性1例，CALR変異陽性7例を見出した。PVではMPL，CALRいずれの変異も検出されなかった。
残ったJAK2変異，MPL変異，CALR変異いずれも陰性であった症例すべて（PV:2例，ET:22例，PMF:4例）について，JAK2，MPL，CALR遺伝子の全エクソン配列を次世代シークエンサーをもちいて解読し，新たな変異が検出されないか確認したが，候補として有力な変異は見出されなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
平成26年度の目標はJAK2領域の選択的濃縮技術の確立，およびそれをもちいたJAK2領域の全配列シークエンスをおこなうことであった。実際の成果として，JAK2のみならず，MPNに関連すると考えられる遺伝子であるMPL，CALRのエクソン領域を次世代シークエンサーで解読できるプラットフォームを立ち上げたのみならず，それらを実際に収集したコホートへ応用し，日本におけるMPN患者の変異スペクトラムを日本で初めて報告できたことから，目標は十分に達したと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
これまでの解析によって，JAK2，MPL，CALRいずれの変異ももたない症例が一定数存在することが明らかとなった。今後は，その中でも特に，PV症例について全ゲノム解析なども視野に入れ，診断に利用できる変異を探索することを計画している。
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| Causes of Carryover |
研究費の主な使途として次世代シークエンサー関連技術の構築に係る経費を見込んでいたが，予想よりも開発費を抑えることができたため，余剰が発生した。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
データの信頼性向上のため，解析コホートを拡大する予定である。コホート拡大に伴う経費増大に対応するため，今回発生した余剰金を充当する。
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] JAK2, CALR, and MPL mutation status in Japanese myeloproliferative neoplasms patients2015
Author(s)
Shirane S, Araki M, Morishita S, Edahiro Y, Sunami Y, Hironaka Y, Noguchi M, Koike M, Ohsaka A, and Komatsu N
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Journal Title
Haematologica
Volume: 100
Pages: e46-8
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Detection of MPLW515L/K mutations and determination of allele frequencies with a single-tube PCR assay2014
Author(s)
Takei H, Morishita S, Araki M, Edahiro Y, Sunami Y, Hironaka Y, Noda N, Sekiguchi Y, Tsuneda S, Ohsaka A, and Komatsu N
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Journal Title
PLoS ONE
Volume: 9
Pages: e104958
DOI
Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Dynamic increase in JAK2V617F allele burden is a predictive parameter for the transformation into myelofibrosis from polycythemia vera and essential thrombocythosis2014
Author(s)
Shirane S, Araki M, Morishita S, Hironaka Y, Noguchi M, Koike M, Hirano T, Ohsaka A, and Komatsu N
Organizer
The 56th ASH Annual Meeting
Place of Presentation
San Francisco, CA, USA
Year and Date
2014-12-06 – 2014-12-09
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