血族婚のあるパーキンソン病における新規原因遺伝子探索

2013 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 25860725
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 李 元哲 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (40549292)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: オート接合性マッピング / パーキンソン病 / 劣性遺伝性PD / 血族婚

Research Abstract

本研究は血族婚のあるパーキンソン病4家系8人ついて全ゲノム90万のSNPタイピングを行い、オート接合性領域を見いだした。さらに、次世代シークエンサーを用いたエクソーム解析により候補遺伝子同定を進めた。1）アジレント社のSureSelectを用いて全エクソーム領域のみを濃縮した。２）イルミナ社のHiSeq2000を用いてエクソーム解析を行い、候補領域の約95％の塩基配列情報を取得した。３）SAMtoolsを用いて変異候補を検出した。４）ヒトゲノムデータベースと比較しオート接合性領域に位置する25個の候補遺伝子変異を見いだした。現在、単なる遺伝子多型を排除するために多数の健常者においてこれらの候補遺伝子変異の有無を解析している。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画通り、4家系8人についてエクソーム解析を実施し候補領域の約95％の配列情報を取得できた。さらに、変異解析により候補遺伝子変異を25個までに絞り込めたので、本研究はおおむね順調に進展していると考えられる。

Strategy for Future Research Activity

健常者における候補遺伝子変異の有無を確認し、さらに他の家族性パーキンソン病家系を対象に遺伝子変異の有無を検討する予定である。

Expenditure Plans for the Next FY Research Funding

健常者及び家族性パーキンソン病家系について候補遺伝子変異解析を行うため。
研究に必要な遺伝子解析用試薬(PCR用試薬、シークエンス用試薬)、プラスチック消耗品などの購入費用。

Research Products

• [Journal Article] p150glued-Associated Disorders Are Caused by Activation of Intrinsic Apoptotic Pathway. (2014)
  • Author(s): Ishikawa K, Saiki S, Furuya N, Yamada D, Imamichi Y, Li Y, Kawajiri S, Sasaki H, Koike M, Tsuboi Y, Hattori N.
  • Journal Title: PLoS One Volume: 10 Pages: e94645
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0094645
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] EIF4G1 gene mutations are not a common cause of Parkinson's disease in the Japanese population. (2014)
  • Author(s): Nishioka K, Funayama M, Vilarino-Guell C, Ogaki K, Li Y, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Kachergus JM, Cobb SA, Takahashi H, Mizuno Y, Farrer MJ, Ross OA, Hattori N.
  • Journal Title: Parkinsonism Relat Disord Volume: In Press Pages: In Press
  • DOI: 10.1016/j.parkreldis.2014.03.004
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The evaluation of polyglutamine repeats in autosomal dominant Parkinson's disease. (2014)
  • Author(s): Yamashita C, Tomiyama H, Funayama M, Inamizu S, Ando M, Li Y, Yoshino H, Araki T, Ichikawa T, Ehara Y, Ishikawa K, Mizusawa H, Hattori N.
  • Journal Title: Neurobiol Aging Volume: 35 Pages: 1779.e17-21
  • DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2014.01.022
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Clinicogenetic study of GBA mutations in patients with familial Parkinson's disease. (2014)
  • Author(s): Li Y, Sekine T, Funayama M, Li L, Yoshino H, Nishioka K, Tomiyama H, Hattori N.
  • Journal Title: Neurobiol Aging Volume: 35 Pages: 935.e3-8
  • DOI: 10.1016/j.neurobiolaging.2013.09.019
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A TREX1 mutation causing cerebral vasculopathy in a patient with familial chilblain lupus. (2013)
  • Author(s): Yamashiro K, Tanaka R, Li Y, Mikasa M, Hattori N.
  • Journal Title: J Neurol Volume: 260 Pages: 2653-2655
  • DOI: 10.1007/s00415-013-7084-y
  • Peer Reviewed
• [Presentation] GBA遺伝子変異を伴う家族性パーキンソン病の臨床遺伝学的検討
  • Author(s): 李元哲
  • Organizer: 第55回日本神経学会学術大会
  • Place of Presentation: 福岡