2014 Fiscal Year Research-status Report
新規alpha-synuclein発現調節modifier遺伝子の同定と機能解明
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25860726
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Research Institution | Juntendo University |
Principal Investigator |
西岡 健弥 順天堂大学, 医学部, 准教授 (40348933)
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Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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Keywords | パーキンソン病 / alpha-synuclein / SNCA / duplication |
Outline of Annual Research Achievements |
家族性パーキンソン病には種々の変異が報告されている.SNCA duplicationの遺伝子変異もその代表的な変異の一つであるが、約30%という低い浸透率を持つ.つまり、遺伝子変異を持ちながら発症しない人も数名存在しており、発症のメカニズムとして、その発現を抑制するメカニズムが考えられている.我々はSNCA duplicationを持つ同一家系内のDNAを用いて、gene chipによる連鎖解析を行うことにより、発症発現、あるいは抑制となる因子の同定を探索している.現在gene chipの解析を行っている.実験自体は終了しており、現在統計解析を施行中である.統計解析には少し時間がかかっていますが、今年の夏頃までには終了させる予定です.
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現在の進捗状況ですが、SNCA duplicationを持つ者で発症している13名と発症していない14名のDNAに対して、genome-wide human SNP 6.0 arrays (affymetrix)を用いてarraysを施行した.現在実験は終了しており、統計解析に入っている.統計解析はSNP HiT Link (BMC Bioinfomatics, 2009)とMerlin (Nat Genet, 2002)を用いて、全ゲノム連鎖解析を行っている.
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Strategy for Future Research Activity |
統計解析終了後に、候補領域を絞り込み、疾患抑制と関連が高いと判断されるgeneに対してsanger seqencing法にて変異領域の同定を目指す.遺伝子のmodifierの可能性が高いと判断された遺伝子については、細胞実験や動物モデルの作成を行い、その機能解明を目指す.
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Research Products
(23 results)
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[Journal Article] High frequency of beta-propeller protein-associated neurodegeneration (BPAN) among patients with intellectual disability and young onset parkinsonism.2015
Author(s)
Nishioka K, Oyama G, Yoshino H, Li Y, Matsushima T, Takeuchi C, Mochizuki Y, Mori-Yoshimura M, Murata M, Yamasita C, Nakamura N, Konishi Y, Ohi K, Ichikawa K, Terada T, Obi T, Funayama M, Saiki S, Hattori N.
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Journal Title
Neurobiology of aging
Volume: in press
Pages: in press
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Identification of a gene associated with autosomal dominant late-onset Parkinson’s disease: a genome-wide linkage and sequencing study.2015
Author(s)
Funayama M, Ohe K, Amo T, Furuya N, Yamaguchi J, Saiki S, Li Y, Ogaki K, Ando M, Yoshino H, Tomiyama H, Nishioka K, Hasegawa K, Saiki H, Satake W, Mogushi K, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Toda T, Mizuno Y, Uchiyama Y, Ohno K, Hattori N.
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Journal Title
Lancet Neurology
Volume: 14(3)
Pages: 274-282
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] EIF4G1 gene mutations are not a common cause of Parkinson’s disease in the Japanese population.2014
Author(s)
Nishioka K, Funayama M, Vilariño-Güell C, Ogaki K, Li Y, Sasaki R, Kokubo Y, Kuzuhara S, Kachergus JM, Cobb SA, Tahakashi H, Mizuno Y, Farrer MJ, Ross OA, Hattori N.
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Journal Title
Parkinsonism and related disorders
Volume: 20(6)
Pages: 649-661
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] High frequency of WDR45 mutation in Japanese patients with beta- propeller protein-associated neurodegeneration (BPAN)2014
Author(s)
Nishioka K, Oyama G, Yoshino H, Li Y, Matsushima T, Takeuchi C, Mochizuki Y, Mori-Yoshimura M, Murata M, Yamasita C, Nakamura N, Konishi Y, Ohi K, Ichikawa K, Terada T, Obi T, Funayama M, Saiki S, Hattori N.
Organizer
9th Annual Genetics Epidemiology of Parkinson's Disease Consortium
Place of Presentation
Vancouver, British Columbia
Year and Date
2014-09-10 – 2014-09-13
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