全エクソーム解析を用いたPFAPA症候群疾患原因遺伝子の同定

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 25860874
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 中島 光子 横浜市立大学, 医学部, 助教 (20541965)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2015-03-31
• Keywords: 全エクソーム解析 / 小児周期発熱

Outline of Annual Research Achievements

PFAPA症候群(periodic fever, aphtous stomatitis, pharyngitis, and adenitis syndrome)はアフタ性口内炎、咽頭/扁桃炎、頸部リンパ節炎を随伴症状とする周期性発熱発作を繰り返す自己炎症疾患である。本研究では、PFAPA家系例について次世代シークエンサーを用いた全エクソーム解析を行い、原因遺伝子の単離・分子病態解明を行うことを目的としていた。まず我々は、PFAPA症候群をきたす患者およびその家族から血液試料の収集を行い、最終的に12家系、44検体の収集を行った。これらの検体からDNA抽出を行った後、全例につき全エクソーム解析を施行した。各家系において、予想される遺伝形式から候補遺伝子変異の絞込みを行い、その後複数家系において共通して変異がみられる遺伝子の検索を行った。まず、これまで先天性周期発熱の原因遺伝子としてすでに報告のある6遺伝子(MEFV, MVK, TNFRS1A, LPIN2, NOD2, ELANE)において病的変異の検索を行ったが、これらの遺伝子には疾患原因となりうる病的変異は認められなかった。このことは、本疾患が既存の周期発熱疾患とは異なる遺伝的要因によって引き起こされていることを示すものである。また新規候補遺伝子の検索においては、候補変異数は常染色体優性遺伝形式を示す家系においては26~39個であり、孤発の罹患児がみられる家系においては0~5個であった。そのかなかで、疾患候補遺伝子と考えられる遺伝子の検索を行ったものの、複数家系において共通して変異が認められる遺伝子は同定できなかった。このことは、本疾患の遺伝的背景は多様な要因が関与している可能性を示唆するものであると考えられた。

Research Products

• [Journal Article] Novel compound heterozygous PIGT mutations caused multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome. (2014)
  • Author(s): Mitsuko Nakashima, Hirofumi Kashii, Yoshiko Murakami, Mitsuhiro Kato, Yoshinori Tsurusaki, Noriko Miyake, Masaya Kubota, Taroh Kinoshita, Hirotomo Saitsu, Naomichi Matsumoto
  • Journal Title: Neurogenetics Volume: 15 Pages: 193-200
  • DOI: 10.1007/s10048-014-0408-y
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Causative novel PNKP mutations and concomitant PCDH15 mutations in a patient with microcephaly with early-onset seizures and developmental delay syndrome and hearing loss. (2014)
  • Author(s): Mitsuko Nakashima, Kyoko Takano, Hitoshi Osaka, Noriko Aida, Yoshinori Tsurusaki, Noriko Miyake, Hirotomo Saitsu, Naomichi Matsumoto
  • Journal Title: Journal of Human Geneics Volume: 59 Pages: 471-474
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.51.
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] The somatic GNAQ mutation c.548G>A (p.R183Q) is consistently found in Sturge-Weber syndrome. (2014)
  • Author(s): Mitsuko Nakashima, Masakazu Miyajima, Hidenori Sugano, Yasushi Iimura, Mitsuhiro Kato, Yoshinori Tsurusaki, Noriko Miyake, Hirotomo Saitsu, Hajime Arai and Naomichi Matsumoto
  • Journal Title: Journal of Human Geneics Volume: 59 Pages: 691-693
  • DOI: 10.1038/jhg.2014.95.
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] Sturge-Weber syndromeにおけるGNAQ体細胞変異の同定 (2014)
  • Author(s): 中島 光子,宮嶋 雅一、新井 一、加藤 光広、松本 直通
  • Organizer: 第59回日本人類遺伝学会
  • Place of Presentation: タワーホール船堀(東京都江戸川区)
  • Year and Date: 2014-11-22
• [Presentation] Novel compound heterozygous PIGT mutations caused multiple congenital anomalies-hypotonia-seizures syndrome 3 (2014)
  • Author(s): Mitsuko Nakashima, Hirofumi Kashii, Yoshiko Murakami, Mitsuhiro Kato, Yoshinori Tsurusaki, Noriko Miyake, Masaya Kubota, Taroh Kinoshita, Hirotomo Saitsu, Naomichi Matsumoto
  • Organizer: The American Society of Human Genetics, 2014 meeting
  • Place of Presentation: San Diego (CA, USA)
  • Year and Date: 2014-10-19 – 2014-10-21