感染根管治療に伴う根管内細菌叢の量的・質的推移：メタゲノム解析

2015 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 25861785
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 橋本 紀洋 東北大学, 歯学研究科(研究院), 大学院非常勤講師 (70646447)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: 感染根管 / 細菌叢 / メタゲノム / PCR

Outline of Annual Research Achievements

膨大な数と種類の微生物が、口腔バイオフィルム常在微生物叢を構成しているが、いったん、その統制が乱れ始めると、病的な微生物叢に変遷し、諸々の口腔内環境の変動と相まって、種々の口腔疾患が発症することになる。従って、口腔微生物生態系の性状を理解し、制御することが、口腔疾患の多くを、予防する一手段と考えられる。
口腔微生物叢構成の量的・質的解析の一手段として、高度嫌気培養法があり、高度嫌気実験システムの格段の進歩ならびに分子生物学的手法の併用によって、多種多様な嫌気性菌が口腔微生物叢を構成していることが、最近の研究によって明らかにされている。その一方で、迅速性・多試料解析性といった利点を求めて、培養に依らない手段として、16S ribosomal RNA塩基配列をターゲットとしたPCRランダムクローニング法なども注目されている。そこから発展させて本研究では、クローニングを経ずに、超高速シークエンサー解析を行って、根管内微生物叢の微生物構成の全貌を明らかにすることを目指している。現在までに、根管試料の無菌的採取・保存方法の検定、試料からのDNA抽出、特異的プライマーを用いたPCR法による増幅までの検討を済ませ、実際のシークエンス解析を開始している。今後、実験の継続ならびに結果の解釈・まとめが必要となっている。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

高速シークエンサーによる解析を順調に開始できているため。

Strategy for Future Research Activity

今後も、高速シークエンサーによる解析を継続し、結果の解釈・まとめを行う予定である。

Causes of Carryover

高速シークエンサーによる解析を開始しており、その解析および結果の解釈・まとめを現在、継続中であるので。

Expenditure Plan for Carryover Budget

高速シークエンサーによる解析および結果の解釈・まとめ（発表）の費用に支出予定である。

Research Products

• [Presentation] Profiling of microbiota from infected root canals with and without marginal leakage using anaerobic culture and molecular biological techniques (16S rRNA gene sequencing). (2015)
  • Author(s): Sato T, Yamaki K, Kawamura Y, Tomida J, Tian L, Ishida N, Takeuchi Y, Hashimoto K, Abiko Y, Matsuyama J, Takahashi N
  • Organizer: The 25th ECCMID (European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases)
  • Place of Presentation: Copenhagen, Denmark
  • Year and Date: 2015-04-25 – 2015-04-28
  • Int'l Joint Research