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2014 Fiscal Year Annual Research Report

青色光受容タンパク質によるDNA修復機構の解明

Research Project

Project/Area Number 25870400
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

山元 淳平  大阪大学, 基礎工学研究科, 助教 (90571084)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
KeywordsDNA修復 / 光反応 / 酵素反応機構
Outline of Annual Research Achievements

環境光が引き起こす生体反応の中でも、紫外線によって生じたDNA損傷を青色光依存的に修復できる(6-4)光回復酵素の詳細な分子メカニズムは依然明らかとなっていない。そこで、アフリカツメカエル由来(6-4)光回復酵素において、基質認識および修復反応に関与することが予想されるアミノ酸側鎖について、そのアラニン変異体を作成し、in vivoおよびin vitroにおける上記アミノ酸側鎖の寄与を調べた。
まず、基質認識に関与する重要なアミノ酸側鎖を発見した。このアミノ酸側鎖はクリプトクロム/光回復酵素ファミリーに広く保存されているものの、CPD光回復酵素のそれとは役割が異なっており、(6-4)光回復酵素特有の認識様式がこのアミノ酸側鎖によって成されている可能性が示唆された。
また、修復反応に必須であることが知られているアミノ酸側鎖の他、同様に反応に寄与するアミノ酸側鎖を発見した。非常に興味深いことに、従来より必須であることが知られているアミノ酸側鎖変異体のin vitro修復反応を詳細に解析したところ、電子移動後の挙動に大きな違いがあることがわかった。また、申請者が提唱する2光子DNA修復反応に鑑みて、励起光子束密度が非常に高い状態で上記変異体の修復反応効率を調べたところ、修復しないとされていたアミノ酸変異体でも修復反応が進行することを見出した。反応量子収率は500分の1程度まで低減したものの、この結果は修復反応分子メカニズムの全容解明に非常に重要なことを示唆していると考えている。
なお、上記基質認識の内容に関しては、現在論文作成中である。修復反応の内容については、野生型と変異型の両方の反応を網羅する反応機構を描く結果までは得られておらず、今後さらなる研究が必要となる。

  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Analysis of structural flexibility of damaged DNA using thiol-tethered oligonucleotide duplexes2015

    • Author(s)
      Masashi Fujita, Shun Watanabe, Mariko Yoshizawa, Junpei Yamamoto, and Shigenori Iwai
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 10 Pages: e0117798

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0117798

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] FTIR study of CPD photolyase with substrate in single strand DNA2015

    • Author(s)
      I M. Mahaputra Wijaya, Tatsuya Iwata, Junpei Yamamoto, Kenichi Hitomi, Shigenori Iwai, Elizabeth D. Getzoff, and Hideki Kandori
    • Journal Title

      Biophysics

      Volume: 11 Pages: 39-45

    • DOI

      10.2142/biophysics.11.39

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deformable nature of various damaged DNA duplexes estimated by an electrochemical analysis on electrodes2014

    • Author(s)
      J. Chiba, S. Aoki, J. Yamamoto, S. Iwai, and M. Inouye
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 50 Pages: 11126-11128

    • DOI

      10.1039/c4cc04513k

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flavin adenine dinucleotide chromophore charge controls the conformation of cyclobutane pyrimidine dimer photolyase alfa-helices2014

    • Author(s)
      I M. Mahaputra Wijaya, Tatsuya Iwata, Junpei Yamamoto, Kenichi Hitomi, Shigenori Iwai, Elizabeth D. Getzoff, John T. M. Kennis, Tilo Mathes, and Hideki Kandori
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 53 Pages: 5864-5875

    • DOI

      10.1021/bi500638b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Synthesis of oligonucleotides containing chain-terminating antiviral drugs and their use in biochemical analysis2014

    • Author(s)
      Junpei Yamamoto and Shigenori Iwai
    • Organizer
      The 41th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      北九州国際会議場
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
  • [Presentation] Molecular mechanism of the two photon DNA repair by the (6-4) photolyase2014

    • Author(s)
      山元淳平、清水幸平、藤原智子、藤堂剛、Pascal Plaza、Klaus Brettel、岩井成憲
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Invited
  • [Presentation] 抗ウイルス剤を末端に含むオリゴヌクレオチドの化学合成とそれを用いた生化学解析2014

    • Author(s)
      山元淳平、岩井成憲
    • Organizer
      第8回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス
    • Year and Date
      2014-09-11 – 2014-09-13
  • [Presentation] 紫外線損傷DNAの化学合成及びその修復反応・変異機構解析2014

    • Author(s)
      山元淳平
    • Organizer
      変異機構研究会 第27回夏の学校
    • Place of Presentation
      愛知県小牧勤労センター
    • Year and Date
      2014-06-21 – 2014-06-22
    • Invited

URL: 

Published: 2016-06-01  

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