2014 Fiscal Year Research-status Report
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25871068
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
藤原 大 公益財団法人がん研究会, その他部局等, 研究員 (00552712)
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2017-03-31
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| Keywords | ゲノム解析 / 遺伝子病理診断学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
肺腺がんのトランスクリプトームデータを公共データベースより取得し、既報の遺伝子セットにてサブタイプ分類を実施した。特にがんゲノムアトラスより548症例の肺腺がんのデータを取得しトランスクリプトームサブタイプ分類を実施し、サブタイプごとのゲノム異常を同定した。既報と発現パターンが類似したサブタイプが同定され、特徴的な変異をもつ遺伝子が得られた。また、サブタイプと関連するマイクロRNA予測のための準備を進めた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
計画どおり、公共のデータベースからトランスクリプトームデータを取得し、既報と同手法にてサブタイプモデルを構築できた。がんゲノムアトラスのデータについてはサブタイプごとのゲノム異常を同定できた。
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| Strategy for Future Research Activity |
計画書に基づき研究を進める。
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| Causes of Carryover |
発表予定学会の変更のため。
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| Expenditure Plan for Carryover Budget |
平成27年度の学会発表費用に充当予定。
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