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2017 Fiscal Year Annual Research Report

リピート結合分子をプローブとしたトリヌクレオチドリピート病の化学生物学研究

Research Project

Project/Area Number 26000007
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

中谷 和彦  大阪大学, 産業科学研究所, 教授

Project Period (FY) 2014 – 2018
Keywordsトリヌクレオチドリピート / 低分子 / 神経変性疾患 / 遺伝子疾患 / 分子設計 / スクリーニング / 分子合成
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、我々の開発するトリヌクレオチドリピート結合分子を用いて、リピート伸長とリピートRNAの機能を低分子で調節する化学を拓き、トリヌクレオチドリピート病の新しい治療法開発に資する創薬リード化合物の創製を目指して、以下4つの研究項目、1)リピート結合分子の性能向上と創製、2)結合分子のリピート不安定化誘導と分子機構の解明・短縮分子探索、3)結合分子によるToxic RNAの捕捉、4)RAN Translationの分子機構解明と低分子による調節原理導出、を実施する。平成29年度は、研究項目1)に関して、前年度に引き続き、CTG、CUGリピートを標的とする、アミノフェナンスロリン誘導体の2量体の合成につづいて、筋緊張性ジストロフィー1型(DM1)の細胞モデルならびにマウスモデルを用いた、スプライシング異常修復活性を評価した。また、ジアミノイソキノリン誘導体については、精密な構造活性相関研究を実施し、CUGリピートとCCGリピートを区別する分子を獲得した。さらに、環状二量体(CMBL)のミニライブラリーのリピートに対する結合並びに生物活性評価を進めた結果、新たに、r(CAG)リピートに結合した複合体のX線構造解析にも成功している。研究項目2-1)では、新たにPCRを基盤とするハイスループットスクリーニング系の構築を進め、これを達成している。研究項目3)に関しては、前年度に引き続き、SPR法によるRNA結合評価をすすめ、5塩基リピートRNAが疾患発症の原因となっている脊髄小脳失調症31型(SCA31)に結合する分子NCDの同定、さらに、その結合構造の獲得に成功した。研究項目4)については、ポーランドアダムミツケビッチ大学との共同研究により進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

平成29年度は、中間評価を受け、A評価を受けた。具体的には、ハンチントン病に関係するCAGリピート結合分子NAについて、論文を再度纏め直し現在Cellに投稿中である。NAを投与したハンチントンマウスモデルの線条体において、リピート短縮効果が認められる画期的な結果であるため、審査員からの厳しい(無理な)注文が多く、対応に苦慮していたが、阪大医学部、カナダSick Kidds Instituteとの共同研究により、可能な限りの修正を完了し再投稿している。また、r(CAG)リピートと環状分子CMBL3aとの共結晶のX線構造解析が、共同研究先のポーランド科学アカデミー生物化学研究所にて成功した。得られた構造は我々の想像を超えるものであり、新たな分子設計に極めて有用な情報を提供すると考えている。さらに、5塩基リピートRNAが疾患発症の原因となっている脊髄小脳失調症31型(SCA31)に結合する分子NCDをSPRによるスクリーニングにより同定し、さらに、その複合体構造のNMRによる解析に成功した。この研究は、阪大医学部、千葉工大との共同研究により推進された。SCA31のショウジョウバエモデルを用いたフェノタイプアッセイでは、顕著な改善効果が認められており、より毒性の低い分子の開発が期待されている。新たにPCRを基盤とするハイスループットスクリーニング系の構築を進め、これを達成するなど、概ね計画通りに進行していると判断している。

Strategy for Future Research Activity

最終年度を迎え、全ての研究課題の纏めを強く意識するとともに、この4年間の研究により大きく広がった共同研究のネットワークを活用して、リピート病を標的とする低分子創成をさらに加速させる取り組みを検討してゆく。
具体的な研究課題としては、DM1に対するジアミノイソキノリン誘導体をモデル細胞ならびにモデルマウスにより評価し、分子設計、結合解析が、実際のフェノタイプにどのように影響をおよぼすかを考察する。リピート結合分子のハイスループットスクリーニングを、創薬企業提供のミニ化合物ライブラリーに適用し、結合分子が探索可能かどうか、どの様な分子が結合性を示すかを考察する。4年間進捗が思わしくなかったRAN翻訳については、共同研究先から評価系を導入し、研究室が保有するリピート結合分子による効果を検証し、纏める。

  • Research Products

    (36 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (25 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Invited: 10 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Scick Kids Institute, Tronto(カナダ)

    • Country Name
      CANADA
    • Counterpart Institution
      Scick Kids Institute, Tronto
  • [Int'l Joint Research] Polish Academy of Sciences, Posnan/Instiute of Bioorganic Chemistry/Adam Mickiewicz University(ポーランド)

    • Country Name
      POLAND
    • Counterpart Institution
      Polish Academy of Sciences, Posnan/Instiute of Bioorganic Chemistry/Adam Mickiewicz University
  • [Journal Article] PCR under Low Ionic Concentration Buffer Conditions2018

    • Author(s)
      Takei, F. ; Akiyama, M. ; Nobusawa, K. ; Sabani, Norhayati Binti ; Han, H. ; Nakatani, K. ; Yamashita, I.
    • Journal Title

      Chemistryselect

      Volume: 3 Pages: 973-976

    • DOI

      10.1002/slct.201702542

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Restoration of Ribozyme Tertiary Contact and Function by Using a Molecular Glue for RNA2018

    • Author(s)
      Dohno, C. ; Kimura, M. ; Nakatani, K.
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 57 Pages: 506-510

    • DOI

      10.1002/anie.201709041

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Electrical Nucleotide Sensor Based on Synthetic Cuanine-Receptor-Modified Electrodes2018

    • Author(s)
      Oshiro, T. ; Verma, R. K. ; Yokota, K. ; Tsutsui, M. ; Mukherjee, S. ; Kawai, T. ; Nakatni, K. ; Taniguchi, M.
    • Journal Title

      Chemistryselect

      Volume: 3 Pages: 3819-3824

    • DOI

      10.1002/slct.201702341

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthetic ligand promotes gene expression by affecting GC sequence in promoter2017

    • Author(s)
      Matsumoto, S. ; Iida, K. ; Murata, A. ; Denawa M. ; Hagiwara, M. ; Nakatani, K.
    • Journal Title

      Bioorg, Med. Chem. Lett.

      Volume: 27 Pages: 3391-3394

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2017.06.006

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of cyclic mismatch binding ligands (CMBLs) with variable linkers by ring closing metathesis and their photophysical and DNA repeat binding properties2017

    • Author(s)
      Mukherjee, S. ; Dohno, C. ; Nakatani, K.
    • Journal Title

      Chem. Eur. J.

      Volume: 23 Pages: 11385-11396

    • DOI

      10.1002/chem.201702064

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of Naphthyridine Carbamate Dimer (NCD) Derivatives Modified with an Alkane Thiol and the Binding Properties to G-G Mismatch DNA2017

    • Author(s)
      Yamada, T. ; Miki, S. ; Ulhusna, A. ; Michikawa, A. ; Nakatani, K.
    • Journal Title

      Org. Lett.

      Volume: 19 Pages: 4163-4166

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.7b01632

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of naphthyridine dimers with conformational restriction and the binding to DNA and RNA2017

    • Author(s)
      Nakatani, K. ; Natsuhara, N. ; Mori, Y. ; Mukherjee, S. ; Das, B. ; and Murata, A.
    • Journal Title

      Chem. Asian J.

      Volume: 12 Pages: 3077-3087

    • DOI

      10.1002/asia.201701293

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Small molecule interactions with DNA and RNA, and their application for sensing Hairpin-Primer PCR2018

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      Meeting at National Chiao Tung University
    • Invited
  • [Presentation] Binding Studies of a Three Carbon Atom Linked 2-amino-1, 8- Naphthyridine Dimer with Bulge-Mismatch DNA2018

    • Author(s)
      B. Das, K. Nakatani
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] Naphthyridine tetramer as a bivalent ligand targeting DNA expanded GGGGCC sequences2018

    • Author(s)
      Y. Lu, C. Dohno, K. Nakatani
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] Small molecule induced CAG/CTG repeat contraction during PCR : Repeat length dependency2018

    • Author(s)
      N. Binti Mohd Zaifuddin, C. Dohno, K. Nakatani
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] 核酸塩基認識を指向したインドール誘導体の合成及び評価2018

    • Author(s)
      南 凌、堂野 主税、中谷 和彦
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] 金属に配位可能な側鎖をもつアミノ酸で修飾したミスマッチDNA結合性小分子の合成と性質2018

    • Author(s)
      三木 翔太、山田 剛史、中谷 和彦
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] ADDA水素結合面を有する含窒素芳香族グアニジンの合成及び核酸との結合評価2018

    • Author(s)
      村上 英太郎、柴田 知範、中谷 和彦
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] 2-アミノ-1, 8-ナフチリジン3量体の合成およびそのDNA結合特性の解析2018

    • Author(s)
      八木 勇樹、相川 春夫、中谷 和彦
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
  • [Presentation] RNAをターゲットとする低分子創薬に向けて2017

    • Author(s)
      中谷 和彦
    • Organizer
      NPO法人 mRNAターゲット創薬研究機構シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Studies on Small Molecules targeting Repeat Diseases2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      Asian Chemical Biology Initiative, 2017 Ulaanbaatar Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Regulation of -1 Ribosomal Frameshifting by Small Molecules2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      The 1st Joint Workshop of Nanyang Technological University and Osaka University on Fundamental Science
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Targeting Trinucleotide Repeat Sequences by Small Organic Molecules2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      Mini-Symposium on Nucleic Acid Chemistry, 2017
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Targeting Diseases-related Trinucleotide Repeat Sequences by Small Organic Molecules2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      120th KCS General Meeting
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Toward discovery of molecules regulating nucleic acids structure and function2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      JSPS Kickoff symposium ZIAM/GBB-ISIR/IPR
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 低分子による核酸構造の認識とその創薬研究への応用2017

    • Author(s)
      中谷 和彦
    • Organizer
      第827回千葉県がんセンター研究所集談会
    • Invited
  • [Presentation] 治らない遺伝子疾患を標的にした低分子創成研究2017

    • Author(s)
      中谷 和彦
    • Organizer
      第43回 反応と合成の進歩シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Targeting Trinucleotide Repeat Sequences by Small Organic Molecules2017

    • Author(s)
      Kazuhiko Nakatani
    • Organizer
      2nd A3 Roundtable Meeting on Chemical Probe Research Hub
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Designing small molecules targeting CUG repeats causing Myotonic Dystrophy type 12017

    • Author(s)
      J. Li, J. Matsumoto, B. Li-Ping, A. Murata, C. Cohno, K. Nakatani
    • Organizer
      RNA 2017 (The 22nd Annual Meeting of the RNA Society)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A small molecule that target UGGAA pentanucleotide repeats in spinocerebellar ataxia 312017

    • Author(s)
      T. Shibata, M. Ueyama ; Y. Nagai, K. Nakatani
    • Organizer
      RNA 2017 (The 22nd Annual Meeting of the RNA Society)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] CAG/CTG repeat-targeting-ligands induce repeat contraction during PCR amplification2017

    • Author(s)
      N. Binti Mohd Zaifuddin, C. Dohno, K. Nakatani
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第11回年会
  • [Presentation] A Novel Riboswitch Strategy by Utilize Mismatch Binding Ligand (MBL)2017

    • Author(s)
      A. U1' Husna, S. Matsumoto, A. Murata, K. Nakatani
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第11回年会
  • [Presentation] Thiol Modified Naphthyridine Carbamate Dimer Accumulated on CGG Repeat DNA2017

    • Author(s)
      T. Yamada, S. Miki, K. Nakatani
    • Organizer
      ISNAC 2017 (The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel isoquinoline derivatives that inhibit MBNL1-CUG repeat interaction in Myotonic Dystrophy typel2017

    • Author(s)
      J. Matsumoto, J. Li, A. Murata, C. Dohno, K. Nakatani
    • Organizer
      ISNAC 2017 (The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Cross-linking behavior of psoralen-conjugated oligonucleotides toward epigenetic DNA modifications2017

    • Author(s)
      A. Yamayoshi, T. Yamada, Y. Araki, A. Murakami, T. Wada, K. Nakatani, H. Sugiyama
    • Organizer
      ISNAC 2017 (The 44th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 1型筋強直性ジストロフィーに見られるMBNL1-CUGexp 相互作用における新規イソキノリン誘導体の阻害効果2017

    • Author(s)
      松本惇、中谷和彦
    • Organizer
      第40回分子生物学会年会
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/labs/rbc/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] Methods of Treating Diseases Associated with Repeat Instability

    • Inventor(s)
      中谷和彦、中森雅之、Christopher Pearson
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人大阪大学、ザ・ホスピタル・フォー・シック・チルドレン
    • Industrial Property Number
      PCT/TB2017/054932
    • Filing Date
      2017年
    • Overseas

URL: 

Published: 2019-03-20  

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