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2015 Fiscal Year Annual Research Report

優しく動かしてみる一分子生理学

Research Project

Project/Area Number 26221102
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

木下 一彦  早稲田大学, 理工学術院, 教授 (30124366)

Project Period (FY) 2014 – 2015
Keywordsたんぱく質分子機械 / 一分子計測 / イオンチャンネル / 回転分子モーター / Reverse gyrase
Outline of Annual Research Achievements

電位依存性イオンチャネルであるBKカリウムチャネルは単一チャネル電流の測定が容易である。また、シェーカーチャネルは開閉が電位だけで制御されるイオンチャネルである。これらを対象に、その電位センサー部に操作用のハンドルタグを遺伝子的に導入し、電気的仕事ではなく力学的操作で開閉させることを試みている。まだ、成功率が極めて低く、タグの導入部位やハンドルの検討を試みている段階である。
回転分子モーターF1-ATPaseのATP加水分解機構において、未だに決着がついていない燐酸解離とATP分解のタイミングを決めるため、加水分解しにくいATPアナログや解離が遅くなることが示唆されている燐酸アナログを用いての実験を行った。その結果、我々の仮説がこれまで通り主張できることが分かった。また、リポソームあたりに1個未満再構成したATP合成酵素について、ATP合成の逆反応としてのATP分解駆動によるプロトンポンプ活性が定量できた。これまでは、ATP分解活性のみを測定し、プロトン/ATP比を仮定してポンプ活性を推定するしかなかったが、ATP合成酵素1個あたりのプロトン/ATP比を実験的に初めて見積もることができた。
70℃以上の高温で生育する超好熱菌のReverse gyraseは、高温でDNA二重鎖がほどけてしまうのを防ぐために、ATPの加水分解エネルギーを使ってDNAの二重螺旋をきつく巻き上げている。DNAの捻れ力を引っ張り力とは独立して測定することに成功し、この酵素一分子の出すトルクをはじめて見積もることができた。その結果、一回の捻れ反応にATPを2つ以上使うことが示唆され、F1-ATPaseとは違った、割といい加減な酵素であることが分かった。

  • Research Products

    (15 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Direct observation of DNA overwinding by reverse gyrase2015

    • Author(s)
      Taisaku Ogawa, et al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA

      Volume: 112 Pages: 7495-7500

    • DOI

      10.1073/pnas.1422203112

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A simple mechanism how F1-ATPase motor rotates with near-perfect chemo-mechanical energy conversion2015

    • Author(s)
      Ei-ichiro Saita, et al.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA.

      Volume: 112 Pages: 9626-9631

    • DOI

      10.1073/pnas.1422885112

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Torsional stress in DNA limits collaboration among reverse gyrase molecules2015

    • Author(s)
      Taisaku Ogawa, et al.
    • Journal Title

      FEBS J.

      Volume: 283 Pages: 1372-1384

    • DOI

      10.1111/febs.13675

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Conformational Control of Voltage Sensor Domains2016

    • Author(s)
      Morten Bertz, Kazuhiko Kinosita Jr.
    • Organizer
      The 60th Annual Meeting of the Biophysical Society of the USA
    • Place of Presentation
      Los Angeles, USA
    • Year and Date
      2016-02-27 – 2016-03-02
  • [Presentation] Direct Observation DNA Overwinding by Reverse Gyrase2016

    • Author(s)
      Taisaku Ogawa, et al.
    • Organizer
      The 60th Annual Meeting of the Biophysical Society of the USA
    • Place of Presentation
      Los Angeles, USA
    • Year and Date
      2016-02-27 – 2016-03-02
  • [Presentation] 回転モーター好熱菌F1の燐酸解離のタイミング2016

    • Author(s)
      足立健吾、他
    • Organizer
      2016年生体運動合同班会議
    • Place of Presentation
      キャンパスプラザ京都
    • Year and Date
      2016-01-08 – 2016-01-10
  • [Presentation] 好熱菌Bacillus PS3由来FoF2-ATP合成酵素のATP駆動によるH+ポンプ活性の定量2016

    • Author(s)
      飯田直也、他
    • Organizer
      2016年生体運動合同班会議
    • Place of Presentation
      キャンパスプラザ京都
    • Year and Date
      2016-01-08 – 2016-01-10
  • [Presentation] 張力によるアクチン重合・脱重合の制御2016

    • Author(s)
      久保田寛顕、他
    • Organizer
      2016年生体運動合同班会議
    • Place of Presentation
      キャンパスプラザ京都
    • Year and Date
      2016-01-08 – 2016-01-10
  • [Presentation] 好熱菌Bacillus PS3由来FoF1-ATP合成酵素のATP駆動によるH+ポンプ活性の定量2015

    • Author(s)
      飯田直也、他
    • Organizer
      第41回日本生体エネルギー研究会
    • Place of Presentation
      東京大学医学部1号館講堂
    • Year and Date
      2015-12-21 – 2015-12-23
  • [Presentation] Let's doubt ourselves疑おう〓2015

    • Author(s)
      木下一彦
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] Direct observation of DNA overwinding by reverse gyraseリバースジャイレースによるDNAの二重らせんをきつく巻きつける反応の解析〓2015

    • Author(s)
      小川泰策、他
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] Coupling scheme of the rotary motor thermophilic F1好熱菌由来の回転モーターF1のカップリングスキーム〓2015

    • Author(s)
      足立健吾、他
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] Conformational Control of Voltage Sensor Domains2015

    • Author(s)
      Bertz Morten, 木下一彦
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス 自然科学本館
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] 夢を見させてくださいなI beg you to let me dream a last dream〓2015

    • Author(s)
      木下一彦
    • Organizer
      IGERグリーン自然科学レクチャー
    • Place of Presentation
      名古屋大学理学研究科 坂田・平田ホール
    • Year and Date
      2015-07-03
    • Invited
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.k2.phys.waseda.ac.jp/

URL: 

Published: 2017-03-16  

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