Development of both the data exchange format of hierarchical omics data and the multi-axis and polyphenic ontology

2016 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 26240044
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Life / Health / Medical informatics
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: NAKAYA Jun 東北大学, 医学系研究科, 大学院非常勤講師 (90420463)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 荻島 創一 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 准教授 (40447496) ; 立川 察理 東北大学, 医学(系)研究科(研究院), 助手 (90621483) ; 今井 健 東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 講師 (90401075) ; 永家 聖 東北大学, 東北メディカル・メガバンク機構, 助手 (00726466)
• Project Period (FY): 2014-04-01 – 2017-03-31
• Keywords: オミックス / ICD / 臨床情報モデル / 全ゲノムシーケンス / マークアップ言語 / マルチエントリーポイント / 国際標準化

Outline of Final Research Achievements

In this study, we formulated data exchange format of omics medical data including hierarchical omics data and clinical data. We developed novel data exchange format of multidimensional, multifactorial, multi layered data of hierarchical omics data (from genome to phenome), clinical data, and environmental data, which are separately described by data elements and semantics relationships. We are working on international standardization of our data exchange formats.

Free Research Field

生命・健康・医学情報学